SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K9L2.13 (Universal genetic code) : 518 aa
 vs  library
 searching reto_escca library

    538 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
RETO_ESCCA, 538 bases, 21B8 checksum.              (538)1350

>>RETO_ESCCA, 538 bases, 21B8 checksum.              (538 aa)
Smith-Waterman score: 1350;   41.699% identity in 518 aa overlap

               10        20         30         40        50        
K9L2.1 MGNSKPLPTISCISVFALYFSFYTITLTS-STSLQ-DDFIKCLYRNTNVRFTLDKTFFTP
                        ..::. .: :.  . .:  .:...::  : .::   ..: :. 
RETO_E            MENKTPIFFSL-SIFLSLLNCALGGNDLLSCLTFN-GVR---NHTVFSA
                          10         20        30            40    

       60        70        80        90       100       110        
K9L2.1 ERNASIFTEVLESTAQNQRYLTKTMPKPGFIFKPVHESHVQASVICSKKLEIHFRVRSGG
       . ... :.. :. . ::  . .. . ::. :. :  . ... .. : .:    .:.::::
RETO_E DSDSD-FNRFLHLSIQNPLFQNSLISKPSAIILPGSKEELSNTIRCIRKGSWTIRLRSGG
            50        60        70        80        90       100   

      120       130       140       150       160       170        
K9L2.1 HDYEGVSYVSQIEKPFVLIDLSKLRQINVDIKDTSAWVEAGATVGELYYRIAEKS-KFHG
       :.:::.::.:  . ::.:::: .: ....:... .::::.:.:.::::: :.:.: :. :
RETO_E HSYEGLSYTS--DTPFILIDLMNLNRVSIDLESETAWVESGSTLGELYYAITESSSKL-G
           110         120       130       140       150        160

       180       190       200       210       220       230       
K9L2.1 FPAGVYPSLGIGGHITGGAYGSLMRKYGLAADNVLDAKIVDANGKLLDRASMGEDLFWAI
       : ::  :..: ::::.::..: . ::::::::::.:: ..:::: .::: .::::.::::
RETO_E FTAGWCPTVGTGGHISGGGFGMMSRKYGLAADNVVDAILIDANGAILDRQAMGEDVFWAI
              170       180       190       200       210       220

       240       250       260       270       280       290       
K9L2.1 RGGSGGSFGIILSWKIKLVPVPETLTVFTVTKTFEQDRSFKILSKWQEIADNLVDELFLR
       :::.:: .: : .:::::.:::: .::: :::.   :.. ..: ::: .:..: .: :  
RETO_E RGGGGGVWGAIYAWKIKLLPVPEKVTVFRVTKNVAIDEATSLLHKWQFVAEEL-EEDFT-
              230       240       250       260       270          

       300       310        320       330           340       350  
K9L2.1 VFFTVSGNKANKTVTMAYIG-QFLGEKGTLMEVMKK--D--FPELGLTQKDCIEMSWIDS
         ..: :.  .: : ....: .: : : :   : :.  :  ::::::...: .:::: .:
RETO_E --LSVLGGADEKQVWLTMLGFHF-GLK-T---VAKSTFDLLFPELGLVEEDYLEMSWGES
        280       290        300           310       320       330 

            360       370       380       390       400       410  
K9L2.1 IIYNSGFPTNPPPPIEILLQAKSPIGKVYFKGKSDFAKKPIPVLGLEGMFKKLLEEDAAL
       . : .:. :      ..:   :  . .  :: : :..:.:.:  .. :....: .:  ..
RETO_E FAYLAGLETVSQLNNRFL---K--FDERAFKTKVDLTKEPLPSKAFYGLLERLSKEPNGF
             340          350         360       370       380      

            420       430        440       450       460           
K9L2.1 VIWTPYGGKMDKIPESEI-PFPHRNGTNFMIQYYRSWSDSEKRPNRRTK---WIRELYGY
       .  . .::.:.::  :.. :::::.:: .:..:  .:..::..  ..:.   :....: .
RETO_E IALNGFGGQMSKIS-SDFTPFPHRSGTRLMVEYIVAWNQSEQK--KKTEFLDWLEKVYEF
        390       400        410       420         430       440   

      470       480       490           500        510             
K9L2.1 MTPYVSSNPRQAYVNYRDLDLGQNKD-NSKS---NFIE-AKIWGANYFKDNFNRL     
       : :.::.::: .:::. ::::: . : ..:.   : :: .. :: .:: .:..::     
RETO_E MKPFVSKNPRLGYVNHIDLDLG-GIDWGNKTVVNNAIEISRSWGESYFLSNYERLIRAKT
           450       460        470       480       490       500  

RETO_E LIDPNNVFNHPQSIPPMANFDYLEKTLGSDGGEVVI
            510       520       530        

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