SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K9L2.12 (Universal genetic code) : 541 aa
 vs  library
 searching reto_escca library

    538 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
RETO_ESCCA, 538 bases, 21B8 checksum.              (538)1435

>>RETO_ESCCA, 538 bases, 21B8 checksum.              (538 aa)
Smith-Waterman score: 1435;   43.527% identity in 533 aa overlap

               10        20        30        40            50      
K9L2.1 MGNSKPLPTISCIIVSVLYFSFYCITPTSSSASIQDQFINC-VKRNTHVS---FP-LEK-
                                ::   : ::  ...:: .  :  .:   :  ... 
RETO_E                      MENKTPIFFSLSIFLSLLNCALGGNDLLSCLTFNGVRNH
                                    10        20        30         

           60        70        80        90       100       110    
K9L2.1 TLFTPAKNVSLFNQVLESTAQNLQFLAKSMPKPGFIFRPIHQSQVQASIICSKKLGI-HF
       :.:. : . : ::. :. . ::  :  . . ::. :. :  . ... .: : .: :   .
RETO_E TVFS-ADSDSDFNRFLHLSIQNPLFQNSLISKPSAIILPGSKEELSNTIRCIRK-GSWTI
      40         50        60        70        80        90        

           120       130       140       150       160       170   
K9L2.1 RVRSGGHDFEALSYVSRIEKPFILLDLSKLKQINVDIESNSAWVQPGATLGELYYRIAEK
       :.:::::..:.:::.:  . ::::.:: .:.....:.::..:::. :.::::::: :.:.
RETO_E RLRSGGHSYEGLSYTS--DTPFILIDLMNLNRVSIDLESETAWVESGSTLGELYYAITES
       100       110         120       130       140       150     

            180       190       200       210       220       230  
K9L2.1 S-KIHGFPAGLCTSVGIGGYMTGGGYGTLMRKYGLAGDNVLDVKMVDANGKLLDRAAMGE
       : :. :: :: : .:: ::...:::.: . ::::::.:::.:. ..:::: .::: ::::
RETO_E SSKL-GFTAGWCPTVGTGGHISGGGFGMMSRKYGLAADNVVDAILIDANGAILDRQAMGE
          160       170       180       190       200       210    

            240       250       260       270       280       290  
K9L2.1 DLFWAIRGGGGASFGIVLAWKIKLVPVPKTVTVFTVTKTLEQDARLKTISKWQQISSKII
       :.:::::::::. .: . ::::::.:::. :::: :::..  :   . . ::: .. .. 
RETO_E DVFWAIRGGGGGVWGAIYAWKIKLLPVPEKVTVFRVTKNVAIDEATSLLHKWQFVAEELE
          220       230       240       250       260       270    

            300       310        320        330       340       350
K9L2.1 EEIHIRVVLRAAGNDGNKTVTMTYLG-QFLGEKGTLLK-VMEKAFPELGLTQKDCTEMSW
       :.. . :.   .: : .: : .:.:: .: : : :. : ...  ::::::...:  ::::
RETO_E EDFTLSVL---GGAD-EKQVWLTMLGFHF-GLK-TVAKSTFDLLFPELGLVEEDYLEMSW
          280           290        300        310       320        

              360       370        380         390       400       
K9L2.1 IEAALFHGGFPTGSPIEILLQLKSPLGK-DY--FKATSDFVKEPIPVIGLKGIFKRLI-E
        :.  :  .. .:  .: . ::.. . : :   ::.  :..:::.:  .. :...::  :
RETO_E GES--F--AYLAG--LETVSQLNNRFLKFDERAFKTKVDLTKEPLPSKAFYGLLERLSKE
      330             340       350       360       370       380  

        410       420       430       440       450        460     
K9L2.1 GNTTFLNWTPYGGMMSKIPESAIPFPHRNGTLFKILYYANWLEND-KTSSRKINWIKEIY
        :  :.  . .::.::::  .  :::::.:: . . : . : ... : ... ..:....:
RETO_E PNG-FIALNGFGGQMSKISSDFTPFPHRSGTRLMVEYIVAWNQSEQKKKTEFLDWLEKVY
             390       400       410       420       430       440 

         470       480       490          500        510       520 
K9L2.1 NYMAPYVSSNPRQAYVNYRDLDFGQ-NKNNAKV--NFIE-AKIWGPKYFKGNFDRLVKIK
       ..: :.::.::: .:::. :::.:  . .:  :  : :: .. :: .:: .:..::.. :
RETO_E EFMKPFVSKNPRLGYVNHIDLDLGGIDWGNKTVVNNAIEISRSWGESYFLSNYERLIRAK
             450       460       470       480       490       500 

             530       540                  
K9L2.1 TKVDPENFFRHEQSIPPMPY                 
       : .::.: : : ::::::                   
RETO_E TLIDPNNVFNHPQSIPPMANFDYLEKTLGSDGGEVVI
             510       520       530        

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