SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K9L2.10 (Universal genetic code) : 532 aa
 vs  library
 searching reto_escca library

    538 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
RETO_ESCCA, 538 bases, 21B8 checksum.              (538)1364

>>RETO_ESCCA, 538 bases, 21B8 checksum.              (538 aa)
Smith-Waterman score: 1364;   41.241% identity in 548 aa overlap

                 10        20        30        40        50        
K9L2.1   MRTLEAFALSLFLVFLVKWVNSDSSSSPSKDQFLSCMSTHSDSSFINPKSFIHKPDSR
               :.::.:: .:    :    .  ..: .:::. : .     :   :  . :: 
RETO_E MENKTPIFFSLSIFLSLL----NC---ALGGND-LLSCL-TFNGVR--NHTVF--SADSD
               10            20            30           40         

       60          70        80        90       100        110     
K9L2.1 VYTDFSQSL-IS-QNYRFLTLNFTSQKPILIVTPRTDTEIQRSLLCSRKLGV-KVRTKSG
         .::.. : .: ::  : . .. : ::  :. : .  :.. .. : :: :   .: .::
RETO_E --SDFNRFLHLSIQNPLFQN-SLIS-KPSAIILPGSKEELSNTIRCIRK-GSWTIRLRSG
          50        60          70        80        90        100  

         120       130       140       150       160       170     
K9L2.1 GHDYEGLSYLSLHSPFIILDLVNVRSIEINLADETAWVGAGATIGELYYKIAKSS-KIHG
       ::.:::::: :  .:::..::.:.  . :.: .::::: .:.:.::::: :..:: :. :
RETO_E GHSYEGLSYTS-DTPFILIDLMNLNRVSIDLESETAWVESGSTLGELYYAITESSSKL-G
            110        120       130       140       150        160

          180       190       200       210       220       230    
K9L2.1 FPAGTCPSVGVGGHFSGGGFGAMMRKHGLAADNVVDARFVDANGRIYNSRREMGEDLFWA
       : :: ::.::.:::.:::::: : ::.:::::::::: ..:::: : . :. ::::.:::
RETO_E FTAGWCPTVGTGGHISGGGFGMMSRKYGLAADNVVDAILIDANGAILD-RQAMGEDVFWA
              170       180       190       200        210         

          240       250       260         270       280       290  
K9L2.1 IRGGGAASFGVVLSWKVKLVRVPEKVTCFR--RNLPLTQNMTKIVHRWQQIAAELDDNLF
       :::::.. .:.. .::.::. :::::: ::  .:. . .  :...:.:: .: ::... :
RETO_E IRGGGGGVWGAIYAWKIKLLPVPEKVTVFRVTKNVAIDEA-TSLLHKWQFVAEELEED-F
     220       230       240       250        260       270        

            300       310          320         330       340       
K9L2.1 IRVIVSISGGSVQTTFQANYLG---GIDKLIP--LMNQKFPELGLTFQDCSEMTWIDSIM
           .:. ::. .     ..::   :. : .    ..  ::::::. .:  ::.: .:. 
RETO_E T---LSVLGGADEKQVWLTMLGFHFGL-KTVAKSTFDLLFPELGLVEEDYLEMSWGESFA
          280       290       300        310       320       330   

       350       360          370       380       390       400    
K9L2.1 YFNWKKGQPLETL--LD-RGQRYNDLYFKAKSDFVKNPIPEIGLEGIWTRFHEVESP--I
       :.    :  :::.  :. :  ....  ::.: :..:.:.:  .. :.  :. . : :  .
RETO_E YLA---G--LETVSQLNNRFLKFDERAFKTKVDLTKEPLPSKAFYGLLERLSK-E-PNGF
                340       350       360       370       380        

            410       420       430       440       450       460  
K9L2.1 MIMEPLGGKMYEIGETETPFPHRRGNLYNIQYMVKWRLKDIGVMEKHVTWMRLLYRYMRV
       . .. .::.: .:.   :::::: :.   ..:.: :  ..     . . :.. .:..:. 
RETO_E IALNGFGGQMSKISSDFTPFPHRSGTRLMVEYIVAWNQSEQKKKTEFLDWLEKVYEFMKP
        390       400       410       420       430       440      

             470       480            490       500       510      
K9L2.1 YVSASPR-GAYLNYRDLDLG-MNRG----VNTSFEDAKLWGFRYFGSNFKRLAIVKGK--
       .:: .:: : :.:. ::::: .. :    ::...: .. ::  :: ::..::  ...:  
RETO_E FVSKNPRLG-YVNHIDLDLGGIDWGNKTVVNNAIEISRSWGESYFLSNYERL--IRAKTL
        450        460       470       480       490         500   

          520       530                   
K9L2.1 IDPTNFFRNEQSVPPLIV                 
       :::.: : . ::.::.                   
RETO_E IDPNNVFNHPQSIPPMANFDYLEKTLGSDGGEVVI
           510       520       530        

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