SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K9I9.11 (Universal genetic code) : 469 aa
 vs  library
 searching s61029 library

    471 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
S61029, 471 bases, 18C3 checksum.                  (471)2037

>>S61029, 471 bases, 18C3 checksum.                  (471 aa)
Smith-Waterman score: 2037;   67.532% identity in 462 aa overlap

                 10        20        30        40        50        
K9I9.1   MAELKLSESRDLTRVERIGAHSHIRGLGLDSALEPRAVSEGMVGQVKARKAAGVILQM
               .:. ::  .  :.::::: :::::  :.:: .:::::::..::.::::::.:
S61029 MSIQTSDPNETSDLKSLSLIAAHSHITGLGLDENLQPRPTSEGMVGQLQARRAAGVILKM
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
K9I9.1 IREGKIAGRAILIAGQPGTGKTAIAMGMAKSLGLETPFAMIAGSEIFSLEMSKTEALTQS
       ...: :::::.:.:: :.:::::.:::...::: ..::. ::::::::::.::::::::.
S61029 VQNGTIAGRAVLVAGPPSTGKTALAMGVSQSLGKDVPFTAIAGSEIFSLELSKTEALTQA
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
K9I9.1 FRKAIGVRIKEETEVIEGEVVEVQIDRPASSGVASKSGKMTMKTTDMETVYDMGAKMIEA
       :::.::..::::::.:::::::.::::  ..:   :.::.:.:::::::.:..: :::..
S61029 FRKSIGIKIKEETELIEGEVVEIQIDRSITGG--HKQGKLTIKTTDMETIYELGNKMIDG
              130       140       150         160       170        

      180       190       200       210       220       230        
K9I9.1 LNKEKVQSGDVIAIDKATGKITKLGRSFSRSRDYDAMGAQTKFVQCPEGELQKRKEVVHC
       :.:::: .::::.::::.::::::::::.::::::::::.:.::::::::::::: ::: 
S61029 LTKEKVLAGDVISIDKASGKITKLGRSFARSRDYDAMGADTRFVQCPEGELQKRKTVVHT
      180       190       200       210       220       230        

      240       250       260       270       280       290        
K9I9.1 VTLHEIDVINSRTQGFLALFTGDTGEIRSEVREQIDTKVAEWREEGKAEIVPGVLFIDEV
       :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::.:::::::::::::::::
S61029 VSLHEIDVINSRTQGFLALFTGDTGEIRSEVRDQINTKVAEWKEEGKAEIVPGVLFIDEV
      240       250       260       270       280       290        

      300       310       320       330       340       350        
K9I9.1 HMLDIECFSFLNRALENEMSPILVVATNRGVTTIRGTNQKSPHGIPIDLLDRLLIITTQP
       ::::::::::.:::::.:..::...::::::.  :::: :::::.:.::::: .::::. 
S61029 HMLDIECFSFINRALEDEFAPIVMMATNRGVSKTRGTNYKSPHGLPLDLLDRSIIITTKS
      300       310       320       330       340       350        

      360       370       380       390       400       410        
K9I9.1 YTDDDIRKILEIRCQEEDVEMNEEAKQLLTLIGRDTSLRYAIHLITAAALSCQKRKGKVV
       :....:. :: :: :::.::.. .: .:::  : .:::::. .::..:    .:::...:
S61029 YNEQEIKTILSIRAQEEEVELSSDALDLLTKTGVETSLRYSSNLISVAQQIAMKRKNNTV
      360       370       380       390       400       410        

      420       430       440       450        460           
K9I9.1 EVEDIQRVYRLFLDVRRSMQYLVEYQSQYMFSEP-IKNDEAAAEDEQDAMQI  
       ::::..:.: ::::  ::..:. : .:::. ..  .. . : . :  :::.   
S61029 EVEDVKRAYLLFLDSARSVKYVQENESQYIDDQGNVQISIAKSADP-DAMDTTE
      420       430       440       450       460        470 

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