SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K2A18.17 (Universal genetic code) : 523 aa
 vs  library
 searching atcrk library

    601 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
ATCRK, 601 bases, 1F54 checksum.                   (601)1436

>>ATCRK, 601 bases, 1F54 checksum.                   (601 aa)
Smith-Waterman score: 1436;   45.242% identity in 557 aa overlap

ATCRK, MGLCTSKPNSSNSDQTPARNSPLPASESVKPSSSSVNGEDQCVTTTNNEGKKSPFFPFYS
               10        20        30        40        50        60

                     10        20          30           40         
K2A18.    MGVCFSA---IRVTGASSSRRSSQTK--SKAAPTPIDTK---ASTKRRTGS------
              ::     : . :..:  :.  .  ..  : :  .:   :   :: ::      
ATCRK, PSPAHYFFSKKTPAR-SPATNSTNSTPKRFFKRPFPPPSPAKHIRAVLARRHGSVKPNSS
               70         80        90       100       110         

             50                 60        70        80           90
K2A18. -IPCGKRT-------D--FGYSKDFHDHYTIGKLLGHGQFGYTYVAIHRP--N-GDRVAV
        :: :...       :  ::.::.: ..: .:  .:.:.:::: .:  .   : :..:::
ATCRK, AIPEGSEAEGGGVGLDKSFGFSKSFASKYELGDEVGRGHFGYTCAAKFKKGDNKGQQVAV
     120       130       140       150       160       170         

              100       110       120       130       140          
K2A18. KRLDKSKMVLPIAVEDVKREVQILIALSGHENVVQFHNAFEDDDYVYIVME---------
       : . :.::.  ::.:::.:::.:: :::::.:. .:..:.:: : ::::::         
ATCRK, KVIPKAKMTTAIAIEDVRREVKILRALSGHNNLPHFYDAYEDHDNVYIVMELCEGGELLD
     180       190       200       210       220       230         

                 150       160       170       180        190      
K2A18. ----KGNRYSEKDAAVVVRQMLKVAGECHLHGLVHRDMKPENFLFKSAQLD-SPLKATDF
           .:..:.:.:: .:. :.:.:.. :::.:.::::.::::::: : . : : ::: ::
ATCRK, RILSRGGKYTEEDAKTVMIQILNVVAFCHLQGVVHRDLKPENFLFTSKE-DTSQLKAIDF
     240       250       260       270       280        290        

        200       210       220       230       240       250      
K2A18. GLSDFIKPGKRFHDIVGSAYYVAPEVLKRRSGPESDVWSIGVITYILLCGRRPFWDRTED
       ::::...: .:..::::::::::::::.:  . :.:.::.:::.:::::: :::: :::.
ATCRK, GLSDYVRPDERLNDIVGSAYYVAPEVLHRSYSTEADIWSVGVIVYILLCGSRPFWARTES
      300       310       320       330       340       350        

        260       270       280       290       300       310      
K2A18. GIFKEVLRNKPDFSRKPWATISDSAKDFVKKLLVKDPRARLTAAQALSHAWVREGGNATD
       :::. ::.  :.:.  ::  .:. :.::::.:: :::: :::::::::: :......:  
ATCRK, GIFRAVLKADPSFDDPPWPLLSSEARDFVKRLLNKDPRKRLTAAQALSHPWIKDSNDAK-
      360       370       380       390       400       410        

        320       330       340       350       360       370      
K2A18. IPVDISVLNNLRQFVRYSRLKQFALRALASTLDEAEISDLRDQFDAIDVDKNGVISLEEM
       .:.:: :.. .: ..: : :.. :::::..::   :.  ::.::  .. .:::.::::..
ATCRK, VPMDILVFKLMRAYLRSSSLRKAALRALSKTLTVDELFYLREQFALLEPSKNGTISLENI
       420       430       440       450       460       470       

        380       390       400       410       420       430      
K2A18. RQALAKDLPWKLKDSRVAEILEAVVIFLFSIAIASLGIDSNTDGLVDFTEFVAAALHVHQ
       ..:: :     .::::. :       :: ..  ..:         .:: :: :::: :::
ATCRK, KSALMKMATDAMKDSRIPE-------FLGQL--SALQYRR-----MDFEEFCAAALSVHQ
       480       490              500              510       520   

        440       450       460          470        480            
K2A18. LEEHDSEKWQLRSRAAFEKFDLDKDGYITP---EELRMHTGLRG-SIDPLLDEADI-D--
       ::  :  .:. ..: :.: :.  :.:   :   .::  . :: : :. :.  .: . :  
ATCRK, LEALD--RWEQHARCAYELFE--KEGN-RPIMIDELASELGL-GPSV-PV--HAVLHDWL
             530       540          550       560           570    

     490         500       510       520   
K2A18. R--DGKISLHEFRRLLRTASISSQRAPSPAGHRNLR
       :  :::.:.  : .: .  ..::.            
ATCRK, RHTDGKLSFLGFVKLQH--GVSSRTIKAH       
          580       590         600        

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