SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K2A18.16 (Universal genetic code) : 651 aa
 vs  library
 searching at81kbgen4 library

    615 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
AT81KBGEN4, 615 bases, 25CC checksum.              (615)1356

>>AT81KBGEN4, 615 bases, 25CC checksum.              (615 aa)
Smith-Waterman score: 1356;   40.615% identity in 650 aa overlap

                 10        20         30        40        50       
K2A18.   MADIVKQILAKPIQLSDQVVKAA-DEASSFKQECGELKAKTEKLAGLLRQAAR----A
                       :. . ...: ::: ::: ::::.  ....:: .::  .:    .
AT81KB MGEEESRIGDELSILVLTAERLRVAVDEAESFKTECGEVGKQVDRLAQMLRTLVRFVSSS
               10        20        30        40        50        60

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K2A18. SNDLYERPTRRIIDDTEQMLEKALSLVLKCRANGLMKRVFTIIPAAAFRKMSGQLENSIG
       :...:.:: ::.: :... ::....:: ::: .....:: ::: :: :::. . ::.: :
AT81KB SQQVYDRPIRRVIVDVKKNLERGFALVRKCRRHNIIRRVCTIINAADFRKVINLLESSNG
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K2A18. DVSWLLRVSAPAEDRGDAGYLG-----LPPIAANEPILCLIWEQIAILYTGSLEDRSDAA
       ::.:.:  :.   : ::... :     :::::.:.:::  .:  .: .  :.: :. :::
AT81KB DVKWIL--SVFDSD-GDGSFGGGIVISLPPIATNDPILPWVWSLVASIQMGKLVDKIDAA
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K2A18. ASLVSLARDNDRYTKLIIEEGGVVPLLKLLKEGKP-EGQENAARALGLLGRDPESVEHMI
        .: ::: ::::  :.:..:::: :::.::::..  :::  :: :::::. : ..:. ..
AT81KB NQLGSLAGDNDRNKKIIVDEGGVSPLLRLLKESSSAEGQIAAATALGLLACDEDKVRSIV
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K2A18. HG-GACSVFGKVLKEGPMKVQAVVAWATSELVSNH-PKCQDVFAQHNAIRLLVGHLAFET
       .  :.  .. .:: .. ..::  ::  .... ..: :  :: ::....:. ::  :....
AT81KB NELGV-PIIVQVLGDSSVRVQIKVATLVARM-AEHDPVAQDEFARQSVIKPLVTLLSLDV
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K2A18. -VQE-H-SKYAIATNNKATSIHHAVALAKENPNSTSATALPKGLDEDQSSIPHPTGKQMP
        :.. : ::.    :    :::  : . ::             ...:      :..:   
AT81KB FVDDIHLSKH----N----SIHSLVQMNKE-------------VEKD------PSSK---
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K2A18. NQMHNVVVNTMAVRANPPRKSTSNGVSQSNGVKQPSSVQQHQNSTSSASKTRELEDSATK
         ..         :   : ::     :.:: : .  ..    . :.. .: :. :.  .:
AT81KB --LY---------R---PLKS-----SKSN-VYR--DIGGSGSRTGNFKKERDNENPEVK
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K2A18. CQIKAMAARALWKLAKGNSTICKSITESRALLCFAVLIEK--GDEEVRYNSAMALMEITA
        ..:.  :.::: ::.:: .  . :::...:: .: ..::  :  :..::  :.::::::
AT81KB HELKVNCAEALWMLARGNVANSRRITETKGLLSLAKIVEKEVG--ELQYNCLMTLMEITA
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K2A18. VAEQDADLRRSAFKPNSPACKAVVDQVLRIIEIADSELL-IPCIRTIGNLARTFRATETR
       .::..:::::.::: :::: :::.::.: ::. .:: .: :: :..::.::::: : :::
AT81KB AAESSADLRRAAFKTNSPAAKAVIDQMLWIIKDVDSPILKIPAIQSIGSLARTFPARETR
             430       440       450       460       470       480 

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K2A18. MIGPLVKLLDEREPEVTGEAAAALTKFACTANYLHKDHSRGIIEAGGGKHLVQLAYFGEG
       :: :::. :   . ::.  :. .: ::.:  :.:  .::..::: :.   :..:    : 
AT81KB MIKPLVEKLGSSNQEVAITAVISLQKFVCPENFLCAEHSKNIIEYGAIPLLMKLIRNVEQ
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        .:.  : ::::...:. . .:: . .::.::: : . . . ..: :. :...:   :.:
AT81KB QMQLQCLALLCYLSVNASNHQQLEQAKVLTVLEGAERLAGLQNME-LRELVSKAIYQLSL
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AT81KB YNA-GSHSQMLSYVGP
               610     

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