SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >K2A18.14 (Universal genetic code) : 1092 aa vs library searching at81kbgen15 library 1019 residues in 1 sequences The best scores are: s-w AT81KBGEN15, 1019 bases, 223A checksum. (1019)3766 >>AT81KBGEN15, 1019 bases, 223A checksum. (1019 aa) Smith-Waterman score: 3766; 53.388% identity in 1092 aa overlap 10 20 30 40 50 K2A18. MEKPGMSLLKGSLCVIVFLLLLSLVESVKGG---GYVKYGTEAKVVPGKLNVHLVPHSHD : ..:.: ..: . :: :..:.:. ..:: :.:::::::::: AT81KB MAVKCFSLYLILAAIV--I-GGVTSEYIEYNTKPRIVPEKINVHLVPHSHD 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 K2A18. DVGWLKTVDQYYVGSNNRIQVCYLQMNDESYICMYVETSLTYYISQMNCEFQNACVRNVL ::::::::::::::::: :. .:::.::: AT81KB DVGWLKTVDQYYVGSNNSIR--------------------------------GACVQNVL 50 60 70 120 130 140 150 160 170 K2A18. DSVVDSLLRDPNRKFVFAEMAFFTRWWEEQSPERQEQVRRLVKSGQLEFVNGGWAMNDEA :::. ::: : ::::...::::: :::..:: .. .:..:: ::::::.::: :.::: AT81KB DSVIASLLDDENRKFIYVEMAFFQRWWRQQSNAKKVKVKKLVDSGQLEFINGGMCMHDEA 80 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 K2A18. TCHYIDMIDQTTKGHRFIKQQFNTTPRAAWQIDPFGHSSVQAYLLGAELGLDSVHFARID : :::::::::: ::.::: .:. .::..:::::::::.:::::::::.:.::. ::::: AT81KB TPHYIDMIDQTTLGHQFIKTEFGQVPRVGWQIDPFGHSAVQAYLLGAEFGFDSLFFARID 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 K2A18. YQDREKRKAEKSLEVIWRGSKTLDSSSQIFTNIFFVHYGPPTGFHYEVTDDYVPLQDNPR :::: :: ::.:::::.:::.: :::::::..: :: :: :: .:..: .:.::.: AT81KB YQDRAKRLREKTLEVIWQGSKSLGSSSQIFTGVFPRHYDPPEGFTFEINDVSAPIQDDPL 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 K2A18. -FDGYNIKEAVNDFVNASLVYANVSRGNHVMWTMGDDFQYQFAESWFRQMDRLIHYVNKD :: ::..: ::::: :.:. .::.: ::.:: :: ::.::.: :::::.:..::::::: AT81KB LFD-YNVQERVNDFVAAALAQVNVTRTNHIMWLMGTDFRYQYAYSWFRQIDKFIHYVNKD 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 K2A18. GRVNALYSTPSLYVDAKNVANVTWPLKTHDFFPYADRAYAYWTGYFTSRPALKRYVRALS ::.:.::::::.:.::: .:: .::::: :::::::. ::::::::::::.:.::: :: AT81KB GRLNVLYSTPSIYTDAKYAANESWPLKTDDFFPYADKPNAYWTGYFTSRPAFKKYVRDLS 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 K2A18. GYYMAARQLEFLVGKNSGGPNTYSLGDALGIAQHHDAVTGTAKQHVTNDYMKRLALGASE :::.:::::::: :..:.::.: :.:::.::::::::.:: .:::. :: ::..: . AT81KB GYYLAARQLEFLRGRDSSGPTTDMLADALAIAQHHDAVSGTQRQHVAADYALRLSMGYLQ 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 K2A18. AEAVVNSALACLMNKAPKGGCTK--PAIAFSQCSLMNISYCPSTE-ETLPGQKSLILVAY :: .: :.:. : .: :.. : :. :.:: :.::::::..: . : : :::..:.: AT81KB AEKLVASSLSFL--SAAKSSTEKKNPGTKFQQCPLLNISYCPASEARLLSG-KSLVVVVY 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 K2A18. NSLGWNRTEIIRIPVNDAGLSVEDSSGNTLDAQYIPMDNVTSNLRSFYTKAYLGISSLQR :::::.: :..:.::.. .. :.:.::. . : .:..... .:. :.::::: : . AT81KB NSLGWKREEVVRVPVSSENVIVKDASGKEVVFQLLPLSEIALRIRNEYVKAYLGRSPRDT 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 650 K2A18. PKYWLVFKAKVPPLGWNTFFISKASAQGMQTQAHAIHRKLNSCLSLIIHFFFIIHDIGSN :. :.: :.:::::.... :: . : .: : : :.. : .. :: AT81KB AKHVLAFTASVPPLGFSSYVISDT---G-RT---A--RGLSA--S------YVTS--GS- 560 570 580 590 660 670 680 690 700 710 K2A18. NHKHSSVMLSPMNNTTEIGPGNLKMVFSSDSG-RLERMYNSRTGADIKVDQNYFWY-ASN ::...:.: ::::. .: . : .. : .... .. ..:.: .: .:: AT81KB -----------MNQNVEVGQGNLKLRYSEE-GVKITRHLSTKN--QVTAEQSYAYYIGSN 600 610 620 630 720 730 740 750 760 770 K2A18. VGDAKDPQVSGAYIFRPNGSLAYPVSSSKICTVTSAFIGNGNVQSKLQIVRGPLIDEVHQ : ::::.::::.:::.: : :..:.. ...: ::.:::.::::: AT81KB -GTDKDPQASGAYVFRPDGVL--PIKSKE--------------EAQLTIVQGPLFDEVHQ 640 650 660 670 680 780 790 800 810 K2A18. QFSPWVAQIGPISVGKGH----LT-G---------KEIITRMVTDMTTAKEFYTDSNGRD ... :..:: . ::.: .: : :::::...: : : ::::::::: AT81KB ELNSWISQITRVYKGKNHAEIEFTIGPIPADDGISKEIITKLTTTMKTNGTFYTDSNGRD 690 700 710 720 730 740 820 830 840 850 860 870 K2A18. FLKRVRDNRTDWHLEVNEPIAGNYYPLNLGMYIKDEKAELSVLVDRATGGASIKDGEIEL :.::.:: :::: :.: .:.::::::::::.:..:. .:::::::::.::.:...:.::: AT81KB FIKRIRDFRTDWDLQVYQPVAGNYYPLNLGIYMQDKTSELSVLVDRAVGGSSLENGQIEL 750 760 770 780 790 800 880 890 900 910 920 930 K2A18. MLHRRTSMDDSRGVEESLVETVCVNDTCAGLTIRGNYYVSINKVGEGGRWRRETGQEIYS ::::: . :: ::: : : ::::. . : ::::.:..::.:.: :.:..::: :::::: AT81KB MLHRRMQHDDIRGVGEILNETVCLPEGCKGLTIQGKFYVQIDKPGDGAKWRRTFGQEIYS 810 820 830 840 850 860 940 950 960 970 980 990 K2A18. PLLMAFAHENKEKWKASNTVKGYAMDHLYTLPQNIALITLEELDLGNVLLRLAHLYEAGE :::.::.... ..: :. . :.. :.::.:.::.::.::. :.::::::::.:.:: AT81KB PLLIAFTEQEGDSWINSHKTTFSAFEPSYSLPKNVALLTLQELENGEVLLRLAHLFEVGE 870 880 890 900 910 920 1000 1010 1020 1030 1040 1050 K2A18. DSDYSKIAKVELKKLFSGKMIKEVTEMSLSANQEKVKM-KEKMKWKVEGEA-EQPSSPLR ::.:: .::::::::: .: :.:: : :::.::::..: :... ::::: : :. . : AT81KB DSEYSVMAKVELKKLFHNKKIREVKETSLSGNQEKAEMEKRRLIWKVEGSAGEEVK---R 930 940 950 960 970 1060 1070 1080 1090 K2A18. GGPVDKSTLVVELGPMEIRTFVVQFYQKQRRRKLFVG : :: ::::: ::::::....: AT81KB GEAVDAEKLVVELVPMEIRTLLIKFDDQIEMVGDKEQQHRL 980 990 1000 1010 Library scan: 0:00:01 total CPU time: 0:00:07