SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K21P3.P1 (Universal genetic code) : 436 aa
 vs  library
 searching gi:3600057 library

   1095 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
gi|3600057                                         (1095)1777

>>gi|3600057                                         (1095 aa)
Smith-Waterman score: 1777;   58.998% identity in 439 aa overlap

               10        20        30        40        50        60
K21P3. MAPCSSSGSSSCWKYDVFPSFRGEDVRGNFLSHLMKEFESKGIVTFKDDLIERSQTIGLE
       ::  ::: :.: :.:::::::::::::.::::::.:::::::::::.:: :.::.::: :
gi|360 MA--SSS-SNS-WRYDVFPSFRGEDVRNNFLSHLLKEFESKGIVTFRDDHIKRSHTIGHE
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90         100       110        
K21P3. LKEAVRQSKIFVVIFSKNYASSSWCLDELVEILKCKEER--RLIPIFYKVNPSDVRNQTG
       :. :.:.::: ::.::.::::::::::::.::.:::::.  ...:.::::.:::.:.:::
gi|360 LRAAIRESKISVVLFSENYASSSWCLDELIEIMKCKEEQGLKVMPVFYKVDPSDIRKQTG
         60        70        80        90       100       110      

      120       130       140       150       160       170        
K21P3. KFGRGFRETCEGKNDETQNKWKAALTEAANIAGEDSQSWKNEADFLTKIAKDILAKLNGT
       ::: .: ::: ::..: :..:. :::.:::: :.  :.: :::  .: :.::.: :::.:
gi|360 KFGMSFLETCCGKTEERQHNWRRALTDAANILGDHPQNWDNEAYKITTISKDVLEKLNAT
        120       130       140       150       160       170      

      180       190       200       210       220       230        
K21P3. PSNDFENIIGIESHMEKMVQLLCLNDDDVRMVGIWGPAGIGKTTIARVLHSRFSGDFRFT
       :: ::....:.:.:. :: .::::... ::.::::::::.:::::::.:....  .: ..
gi|360 PSRDFNDLVGMEAHIAKMESLLCLESQGVRIVGIWGPAGVGKTTIARALYNQYHENFNLS
        180       190       200       210       220       230      

      240       250        260       270       280       290       
K21P3. VFMENVRGNYQRIVDSG-GEYNLQARLQKEFLPIIFNQKDRKINHLWKIEERLKKQKVLI
       .:::::: .:    ..:  .:.:. .::..::  ...::: .. ::  ::::::.:::::
gi|360 IFMENVRESYG---EAGLDDYGLKLHLQQRFLSKLLDQKDLRVRHLGAIEERLKSQKVLI
        240          250       260       270       280       290   

       300       310       320       330       340       350       
K21P3. VLGDVDKVEQLEALANETRWFGPGSRIIVTTKDKQILVGHEINHIYEVKLPCRKTALEIL
       .: :::..:::.:::.:..:::  :::.:::..::.::.:.:::.:.:  : .. :: :.
gi|360 ILDDVDNIEQLKALAKENQWFGNKSRIVVTTQNKQLLVSHDINHMYQVAYPSKQEALTIF
           300       310       320       330       340       350   

       360        370       380       390       400       410      
K21P3. CLYAFKQNVAP-DDFMDVVVEVAELSGHLPLGLRVLGSHMRGKSKDRWKLELGRLTTSLD
       : .::::. .: ::.  ...: . :.:::::.:::::: ::::.:..:.. :  : . ::
gi|360 CQHAFKQS-SPSDDLKHLAIEFTTLAGHLPLALRVLGSFMRGKGKEEWEFSLPTLKSRLD
           360        370       380       390       400       410  

        420       430                                              
K21P3. EKVEKILKISYDDLHIRDKA                                        
        .:::.::..:: :: ..:                                         
gi|360 GEVEKVLKVGYDGLHDHEKDLFLHIACIFSGQHENYLKQMIIANNDTYVSFGLQVLADKS
            420       430       440       450       460       470  

gi|360 LIQKFENGRIEMHSLLRQLGKEVVRKQSIYEPGKRQFLMNAKETCGVLSNNTGTGTVLGI
            480       490       500       510       520       530  

gi|360 SLDMCEIKEELYISEKTFEEMRNLVYLKFYMSSPIDDKMKVKLQLPEEGLSYLPQLRLLH
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gi|360 WDAYPLEFFPSSFRPECLVELNMSHSKLKKLWSGVQPLRNLRTMNLNSSRNLEILPNLME
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gi|360 ATKLNRLDLGWCESLVELPSSIKNLQHLILLEMSCCKKLEIIPTNINLPSLEVLHFRYCT
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gi|360 RLQTFPEISTNIRLLNLIGTAITEVPPSVKYWSKIDEICMERAKVKRLVHVPYVLEKLCL
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gi|360 RENKELETIPRYLKYLPRLQMIDISYCINIISLPKLPGSVSALTAVNCESLQILHGHFRN
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Library scan:  0:00:00  total CPU time:  0:00:00