SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K21P3.9 (Universal genetic code) : 663 aa
 vs  library
 searching gnl:PID:e327494 library

    661 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
gnl|PID|e327494                                    (661)3051

>>gnl|PID|e327494                                    (661 aa)
Smith-Waterman score: 3051;   64.502% identity in 662 aa overlap

               10           20         30        40        50      
K21P3. MGVLLPIFFGVLLLFT---VTPP-SMSQLPPTIMVPAPAPAPISPSDLCNGIFLSYDFIL
            : :.  :::..   :. : . ::   .   :.:.: : : ::::::.:.::    
gnl|PI  MDSAPNFIPRLLLLSLLIVSIPLTSSQSDANTTNPSPSP-P-SDSDLCNGVFVSYTHTK
                10        20        30         40         50       

         60        70        80        90       100       110      
K21P3. GRKIPPNDTADQPYRFESVLTVLNNGREELKEWRVFVGFQHNEILISATDALIVNGTELP
       : ::::::::.::::::::.::::.::.::: ::::: : : :::.::..:.. .:. ::
gnl|PI GSKIPPNDTANQPYRFESVITVLNHGRDELKSWRVFVKFAHREILVSASNAVLSDGSSLP
        60        70        80        90       100       110       

        120       130       140       150       160       170      
K21P3. ALVGNGTIFGGYPVSDLKTAIQTAGDLKQMTAEIELVGTQFMVAPPAVPLPSNISLVNEG
       . : :::.:.::: ::::.:::::::. :: :..::::::: :::: ::::.::.:...:
gnl|PI VSVENGTVFAGYPSSDLKSAIQTAGDVTQMQARVELVGTQFGVAPPNVPLPKNITLATDG
       120       130       140       150       160       170       

        180       190       200       210       220       230      
K21P3. WLCPVPTLQSKRELTTCCIRDASIIVNTTITTKFLPRQPGDLTIMYDVIRAYDQNYLTEV
       : ::  : ..   : .::: : .      : ..::::. :::::::::.:.:..::...:
gnl|PI WKCPKATQKGTNVLQVCCIPDPDYDNREIIDNEFLPRKDGDLTIMYDVVRSYSSNYMAQV
       180       190       200       210       220       230       

        240       250       260       270       280       290      
K21P3. TMENHNPLGRLDHWELSFDWMRDEFIQKMQGAYPTVVDATKCIFGPQSLIYTGLDFADVL
       ::::::::::::.:.:::::::::::  :.::::..::.. :. :::.  :  :::..::
gnl|PI TMENHNPLGRLDNWKLSFDWMRDEFIYTMKGAYPSIVDSSDCVDGPQAKHYQDLDFSNVL
       240       250       260       270       280       290       

        300       310       320       330       340       350      
K21P3. TCERRPIIIDLPPTKKDDSTLGNIPSCCRNGTILPRIMDPSKSVSVFTMQVAKMPPDFNR
       .: ::: .::::::: .:::.: :: :::::::::: :::::: ::: ::: :::::.: 
gnl|PI SCARRPTVIDLPPTKYNDSTFGLIPFCCRNGTILPRSMDPSKSSSVFQMQVYKMPPDLNI
       300       310       320       330       340       350       

        360       370       380       390       400       410      
K21P3. SALFPPQNWRIKGTLNPDYSCGPPVRVTPTFYPDPSGMPTNKSSFASWQIVCNITQAKTE
       ::: :::::::.:::::::.:::::::.:. . ::::.:.:...:::::.:::::: :  
gnl|PI SALSPPQNWRINGTLNPDYKCGPPVRVSPSQFVDPSGLPSNRTAFASWQVVCNITQPKDA
       360       370       380       390       400       410       

        420       430       440        450       460       470     
K21P3. IPKCCVSFSAFFNDSIIPCNTCACGCVS-ETRRTCSAETPSLLIPPDALLLPFENRTALT
        :.:::::::.:::::.::.:::::: : .. :.::: .::::.: .:::.:::::: ::
gnl|PI SPRCCVSFSAYFNDSIVPCKTCACGCSSNKAARACSATAPSLLLPQQALLVPFENRTELT
       420       430       440       450       460       470       

         480       490       500       510       520       530     
K21P3. LAWNALKHKTLPNPMPCGDNCGVSINWHMASDYRGGWTVRITIFNWGEIDFPNWFLAVQM
       .::  ::.. .:::::::::::::::::.:.:::::::.:.:.::::: :: .:: ::::
gnl|PI VAWAYLKQRPVPNPMPCGDNCGVSINWHLATDYRGGWTARVTVFNWGETDFVDWFTAVQM
       480       490       500       510       520       530       

         540       550       560       570       580       590     
K21P3. KKPALLGFEKAYSFNASLLSVDGGVNNTIFMEGLPGLDYLVAEADEKDPKKKNIRIPGKQ
       :. :  ::::::::::: ....:  ::::::::::::.::::: : ..: : : ::::::
gnl|PI KNAAP-GFEKAYSFNASTIGINGK-NNTIFMEGLPGLNYLVAERDGENPLK-NPRIPGKQ
       540        550       560        570       580        590    

         600       610       620       630       640       650     
K21P3. QSVIQFSKKLTPGINVAERDGFPAKVIFNGEECLLPDLLPMASGGRRNGAITVLSFITFY
       :::..:.:::::::::   ::::.::.:::::: :: .::: :. .:.  :.:. .... 
gnl|PI QSVMSFTKKLTPGINVPGGDGFPSKVFFNGEECSLPTILPMRSSQHRKH-ISVF-LLALP
          600       610       620       630       640         650  

         660    
K21P3. VAAFMVLL 
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gnl|PI VLALLILRA
            660 

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