SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K21P3.10 (Universal genetic code) : 964 aa
 vs  library
 searching gnl:PID:e1245811 library

    806 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
gnl|PID|e1245811                                   (806)1282

>>gnl|PID|e1245811                                   (806 aa)
Smith-Waterman score: 1282;   33.817% identity in 964 aa overlap

               10        20        30        40        50        60
K21P3. MRNTAQFITGINKKSLKFRIVIFCFDRIPYSCIFSDSMGIGSHGNATSVLTVLSVDHLFG
                                                  : .  :. .: :  :: 
gnl|PI                                           MGCVKLVFFMLYV-FLF-
                                                         10        

                     70        80           90        100       110
K21P3. RELKSS------CIEKERKALLELKK-FVMS--RCEECEYDS-VLPTWTNDTKSDCCQWE
        .: ::      : : .  ::::.:. :...    . : ::  .: .: : . : ::.:.
gnl|PI -QLVSSSSLPHLCPEDQALALLEFKNMFTVNPNASDYC-YDRRTL-SW-NKSTS-CCSWD
          20        30        40        50          60          70 

              120       130       140       150       160       170
K21P3. NIKCNRTSRRLTGLSLYTSYYLEISLLNLSLLHPFEEVRSLDLSNSRLNGLVDDVEGYKS
       ...:..:    ::        .:..:  ..:   :.       :::             :
gnl|PI GVHCDET----TG------QVIELDLRCIQLQGKFH-------SNS-------------S
                  80              90              100              

              180       190        200       210       220         
K21P3. LRRLRNLQILNFSSNEFNNS-IFPFLNAATSLTTLSLRRNNMYGPIPLKELKNLTNLELL
       : .: ::. :..: :.:..: : : ..  ..:: :.: .... : :: .:...:..: .:
gnl|PI LFQLSNLKRLDLSYNDFTGSPISPKFGEFSDLTHLDLSHSSFRGVIP-SEISHLSKLYVL
             110       120       130       140        150       160

     230        240        250        260       270           280  
K21P3. DLSGNRID-GSMPVRGL-KNLTNLEVLSL-GYNYFDGPIPIEVFC-EMKNLQEL---DLR
        .: :..  :    . : ::::.:.::.: . : ... ::.. :  .. ::  :   .::
gnl|PI RISLNELTFGPHNFELLLKNLTQLKVLDLESIN-ISSTIPLN-FSSHLTNLW-LPYTELR
              170       180       190        200        210        

            290        300        310       320       330       340
K21P3. GINFVGQLPL-CFGNLNKLRFLDLSSN-QLTGNIPPSFSSLESLEYLSLSDNSFEGFFSL
       ::     ::   : .:. :.::::::: :::  .: .       ..     ::     : 
gnl|PI GI-----LPERVF-HLSDLEFLDLSSNPQLTVRFPTT-------KW-----NS-----S-
            220        230       240              250              

              350        360       370       380       390         
K21P3. NPLTNLTKLKVFIFSSK-DDMVQVKIESTWQPLFQLSVLVLRLCSLEKIPNFLMYQKNLH
          ..: ::  .... . :: .    ::     :  :    .: ::.:.  . : ..:: 
gnl|PI ---ASLMKL--YLYNVNIDDRIP---ES-----F--S----HLTSLHKL--Y-MSRSNL-
                260       270                     280          290 

     400       410       420       430       440          450      
K21P3. VVDLSGNRISGIIPTWLLENNPELEVLQLKNNSFTIFQMPTSV---HNLQVLDFSENNIG
           ::  :    : : : :   .  :.:.:: .    .:..:   .:::.: .: ::..
gnl|PI ----SGP-IPK--PLWNLTN---IVFLDLNNNHLEG-PIPSNVSGLRNLQILWLSSNNLN
                     300          310        320       330         

        460        470       480          490       500       510  
K21P3. GLFPD-NFGRVLPNLVHMNGSNNGFQGN---FPSSMGEMYNISFLDLSYNNLSGELPQSF
       : .:.  :.  ::.:. .. ::: :.:.   : :.     ..: . :. :.:.: .:.:.
gnl|PI GSIPSWIFS--LPSLIGLDLSNNTFSGKIQEFKSK-----TLSTVTLKQNKLKGPIPNSL
     340         350       360       370            380       390  

            520       530       540       550       560       570  
K21P3. VSSCFSLSILQLSHNKFSGHFLPRQTNFTSLIVLRINNNLFTGKIGVGLLTLVDLCILDM
       ...  .:..: ::::..:::.       .: :      ::   :      ::.   .::.
gnl|PI LNQK-NLQFLLLSHNNISGHI-------SSAIC-----NL---K------TLI---LLDL
             400       410                      420                

             580        590       600       610          620       
K21P3. -SNNFLEGELPPLLLVF-EYLNFLDLSGNLLSGALPSHVSLDNVLF---LHNNNFTGPIP
        ::: ::: .:  ..   :::. ::::.: :::.. .  :. :.:    ::.:..:: .:
gnl|PI GSNN-LEGTIPQCVVERNEYLSHLDLSNNRLSGTINTTFSVGNILRVISLHGNKLTGKVP
       430        440       450       460       470       480      

       630         640       650         660       670         680 
K21P3. DTFLGS--IQILDLRNNKLSGNIPQFVDT--QDISFLLLRGNSLTGYIPST--LCEFSKM
        ....   . .::: :: :. ..:...    : ...: ::.:.: : : :.     :  .
gnl|PI RSMINCKYLTLLDLGNNMLNDTFPNWLGYLFQ-LKILSLRSNKLHGPIKSSGNTNLFMGL
        490       500       510        520       530       540     

             690        700       710       720       730       740
K21P3. RLLDLSDNKLNGFIPS-CFNNLSFGLARKEEITNYYVAVALESFYLGFYKSTFVVENFRL
       ..::::.: ..: .:   ..::.   . :: :         ::   :: .  .. . . .
gnl|PI QILDLSSNGFSGNLPERILGNLQ---TMKE-ID--------ES--TGFPE--YISDPYDI
         550       560          570                  580           

              750        760       770       780       790         
K21P3. DYSNYFEIDVKFATK-QRYDSYIGAFQFSEGTLNSMYGLDLSSNELSGVIPAELGDLFKL
        : ::.   . ..:: : ::: .   ..    :.: . ..::.:.. : ::. .:::  :
gnl|PI -YYNYL---TTISTKGQDYDS-V---RI----LDSNMIINLSKNRFEGHIPSIIGDLVGL
      590          600               610       620       630       

     800       810       820       830       840       850         
K21P3. RALNLSHNFLSSHIPDSFSKLQDIESLDLSYNMLQGSIPHQLTNLTSLAIFNVSYNNLSG
       :.:::::: : .::: ::..:. .:::::: : ..: ::.::..:: : ..:.:.:.: :
gnl|PI RTLNLSHNVLEGHIPASFQNLSVLESLDLSSNKISGEIPQQLASLTFLEVLNLSHNHLVG
       640       650       660       670       680       690       

     860       870             880         890       900       910 
K21P3. IIPQGKQFNTFDENSYLGN------PL--LCGPPTDTSCETKKNSEENANGGEEDDKEVA
        ::.::::..: ..:: ::      ::  :::   ...  .. ..::     ::.:.   
gnl|PI CIPKGKQFDSFGNTSYQGNDGLRGFPLSKLCGGEDQVTTPAELDQEE-----EEEDSP--
       700       710       720       730       740            750  

             920          930       940           950       960    
K21P3. IDMLVFYWS--TAGTYVTAL-IGILVLMCVDCSWRR---AWL-RLVDAFIASAKNSSMYG
         :.   :.   .: :  .: ::. :.. .   :     ::. :. :             
gnl|PI --MIS--WQGVLVG-YGCGLVIGLSVIYIM---WSTQYPAWFSRM-DLKLEHIITTKMKK
                  760        770          780        790       800 

gnl|PI HKKRY
            

Library scan:  0:00:00  total CPU time:  0:00:01