SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K1F13.21 (Universal genetic code) : 614 aa
 vs  library
 searching atac0036745 library

    503 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
ATAC0036745, 503 bases, 1220 checksum.             (503) 620

>>ATAC0036745, 503 bases, 1220 checksum.             (503 aa)
Smith-Waterman score: 620;   27.748% identity in 555 aa overlap

               10        20        30        40        50        60
K1F13. MGFGVGGGGGRMLDLRIVQNHKRSKSASFPEKKRVEGDKTSNSSHEASQRMKLDMGRSNE

               70        80        90            100       110     
K1F13. SKHNQYHSNTETSLKQEITHLETRLQDQFK---VRCALEK--ALGYRTASSYVLTETNDI
                              :. : :    :   : :   : .. .:.   .. .: 
ATAC00                    MKCHRM-DPFPSSYVSLKLMKFEELLMEDSSQLHSNKRHD-
                                   10        20        30          

         120       130       140       150         160       170   
K1F13. AMPKPATDLIKDVAVLEMEVIHLEQYLLSLYRKAF-EQ-QISSVSPNLENKKPKSPPVTT
        . .  ..::...:..: :.. :.. .  :  : . :: : . .  .:.        .: 
ATAC00 -LEEGFSELIQELAIVEAEILCLDRKIEELKLKLYSEQRQTQEI--QLQ--------MTE
       40        50        60        70        80                  

           180       190       200       210       220       230   
K1F13. PRRRLDFSEDDDTPSKTDQHTVPLLDDNQNQSKKTEIAAVDRDQMDPSFRRSHSQRSAFG
        .: :  ...    :.. : :.::  :  .: . ..    .:. .: .   .:: : .: 
ATAC00 QKRTL--ARQ----SHVRQSTLPLRHD-LHQRSLSH--CYQRSTLDTA-STTHS-RLSF-
       90             100        110         120        130        

           240       250       260        270        280       290 
K1F13. SRKASPEDSWGKASRSCHSQPLYVQNGDNLISLAE-HLGTRISD-HVPETPNKLSEGMVK
       :  : : :    .: .  .. .   .: . ..... . : :. . .. . ::..:: ...
ATAC00 SY-A-P-DFLDATSSGGFTDEF---DGVTRMQMGRVRKGLRLVEAKTKDDPNEVSEQLIN
          140        150          160       170       180       190

             300       310            320       330       340      
K1F13. CMSEIYCKLAEPPSVLHRG---LSS-PNS-SLSSSAFSPSDQYDTSSPGFGNSSSFDVRL
       :.  :: .: .  :   .:   ::  :.: : .:...:    :...     : . . : :
ATAC00 CLIGIYLELNHVSSKT-KGDVSLSRRPSSCSRKSNTYS---YYQNAM----NLDPYHV-L
              200        210       220          230           240  

         350       360       370          380        390       400 
K1F13. -DNSFHVEGEKDFSGPYSSIVEVLCIYR---DAKKASEV-EDLLQNFKSLISRLEEVDPR
        :.:  :   .:. :::.....   : :   :. . ..     .  .. :. .: :::  
ATAC00 PDSSGGVT--RDI-GPYKNFIH---ISRSSIDVTHFTHYCSPAVPRLSVLMEKLSEVDLS
               250        260          270       280       290     

             410       420       430       440        450       460
K1F13. KLKHEEKLAFWINVHNALVMHAFLAYGIPQNNVKRVLLLL-KAAYNIGGHTISAEAIQSS
        : ...:::::::..:: .::::: ::.:... .:.: :. ::. :.:: ...: ::.  
ATAC00 FLTYKQKLAFWINIYNACIMHAFLEYGLPSSH-NRLLTLMNKASLNVGGIVLNALAIEHF
         300       310       320        330       340       350    

              470       480            490       500       510     
K1F13. ILGCKMSHPGQWLRLLFASRKFKAGDER--L---AYAIDHPEPLLHFALTSGSHSDPAVR
       .:     :: .         :  . ::.  :   .:.. . :: . :::  :: :.::.:
ATAC00 VL----RHPCE------PEDK-DSLDEKETLLRHTYGLGYSEPNVTFALCRGSWSSPALR
              360              370       380       390       400   

         520       530       540        550       560       570    
K1F13. VYTPKRIQQELETSKEEYIRMNLSIR-KQRILLPKLVETFAKDSGLCPAGLTEMVNRSIP
       :::  .. ..:  .. ::.. ....  :..:..:.:..   :: .    .: : .  ..:
ATAC00 VYTADEVVNDLGRARVEYLEASVGVSSKKKIVVPQLLQWHMKDFADDIESLLEWIYSQLP
           410       420       430       440       450       460   

            580       590         600       610    
K1F13. ESSR-K-CVKRCQSSTSK-P-RKTIDWIPHSFTFRYLILREAAK
       .:.  :  . .: .  .: :  : ..   ..  ::::.      
ATAC00 RSGNLKGMIMECLKRKAKVPLAKIVEIQTYGHEFRYLLSL    
           470       480       490       500       

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