SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K1F13.12 (Universal genetic code) : 532 aa
 vs  library
 searching atu787211 library

    727 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
ATU787211, 727 bases, 195 checksum.                (727)1051

>>ATU787211, 727 bases, 195 checksum.                (727 aa)
Smith-Waterman score: 1051;   32.176% identity in 547 aa overlap

ATU787 MHPSTFQTELNPHTSTLLKKLTHHSQQRNLVAGRAVHGQIIRTGASTCIQHANVLVNFYA
               10        20        30        40        50        60

ATU787 KCGKLAKAHSIFNAIICKDVVSWNSLITGYSQNGGISSSYTVMQLFREMRAQDILPNAYT
               70        80        90       100       110       120

                             10           20         30        40  
K1F13.          MFACLRIGR-----FIRL---GNVTVKSTNLV-LRCVFIRNFATHADHL--
                      .::      ...   :.. : .:.:: . :   .  .   : :  
ATU787 LAGIFKAESSLQSSTVGRQAHALVVKMSSFGDIYV-DTSLVGMYC---KA-GLVEDGLKV
              130       140       150        160           170     

               50        60        70           80        90       
K1F13. FDELPQRDLSSLNSQLSSHLRSGNPNDTLA---LFLQIHRASPDLSSHTFTPVLGACSLL
       :  .:.:.  . ....:..   :  ....    :::. .. . : :...:: ::.. .  
ATU787 FAYMPERNTYTWSTMVSGYATRGRVEEAIKVFNLFLREKEEGSD-SDYVFTAVLSSLAAT
         180       190       200       210        220       230    

       100       110       120        130       140       150      
K1F13. SYPETGRQVHALMIKQGAETGTIS-KTALIDMYSKYGHLVDSVRVFESVEEKDLVSWNAL
        :   :::.: . ::.:   : .. ..::. ::::   : .. ..:.:  ... ..:.:.
ATU787 IYVGLGRQIHCITIKNGL-LGFVALSNALVTMYSKCESLNEACKMFDSSGDRNSITWSAM
          240       250        260       270       280       290   

        160       170       180       190       200       210      
K1F13. LSGFLRNGKGKEALGVFAAMYRERVEISEFTLSSVVKTCASLKILQQGKQVHAMVVVTG-
       ..:. .::.. ::. .:. :.   .. ::.:. .:...:...  :..:::.:....  : 
ATU787 VTGYSQNGESLEAVKLFSRMFSAGIKPSEYTIVGVLNACSDICYLEEGKQLHSFLLKLGF
           300       310       320       330       340       350   

          220       230       240       250       260       270    
K1F13. -RDLVVLGTAMISFYSSVGLINEAMKVYNSLNVHTDEVMLNSLISGCIRNRNYKEAFLLM
        : : .  ::....:...: . .: : .. :. . : .. .::::: ..: . .::..:.
ATU787 ERHLFAT-TALVDMYAKAGCLADARKGFDCLQ-ERDVALWTSLISGYVQNSDNEEALILY
           360        370       380        390       400       410 

               280       290       300       310       320         
K1F13. SRQR-----PNVRVLSSSLAGCSDNSDLWIGKQIHCVALRNGFVSDSKLCNGLMDMYGKC
        :..     ::  ...: : .::. . : .:::.:  ....::  .  . ..:  ::.::
ATU787 RRMKTAGIIPNDPTMASVLKACSSLATLELGKQVHGHTIKHGFGLEVPIGSALSTMYSKC
             420       430       440       450       460       470 

     330       340       350       360       370       380         
K1F13. GQIVQARTIFRAIPSKSVVSWTSMIDAYAVNGDGVKALEIFREMCEEGSGVLPNSVTFLV
       :.. ..  .::  :.:.::::..::.. . ::.: .:::.:.::  ::  . :..:::. 
ATU787 GSLEDGNLVFRRTPNKDVVSWNAMISGLSHNGQGDEALELFEEMLAEG--MEPDDVTFVN
             480       490       500       510         520         

     390       400       410       420       430       440         
K1F13. VISACAHAGLVKEGKECFGMMKEKYRLVPGTEHYVCFIDILSKAGETEEIWRLVERMMEN
       .::::.: :.:..:   :.::...  : : ..::.:..:.::.::. .:  ...:    :
ATU787 IISACSHKGFVERGWFYFNMMSDQIGLDPKVDHYACMVDLLSRAGQLKEAKEFIESA--N
     530       540       550       560       570       580         

     450       460       470        480       490       500        
K1F13. DNQSIPCAIWVAVLSACSLNMDLTR-GEYVARRLMEETGPENASIYVLVSNFYAAMGKW-
        .... : .:  .::::. :    . : :....::   : ...: :: .:..:.:.:.  
ATU787 IDHGL-C-LWRILLSACK-NHGKCELGVYAGEKLMA-LGSRESSTYVQLSGIYTALGRMR
       590         600        610       620        630       640   

       510       520       530                                     
K1F13. DVVEELRGKLKNKGLVKTAGHSLFI                                   
       :: :..  ... .:. : .: :                                      
ATU787 DV-ERVWKHMRANGVSKEVGCSWIELKNQYHVFVVGDTMHPMIEETKDLVCLVSRQMIEE
            650       660       670       680       690       700  

ATU787 GFVTVLDSSFVEEEEGTQLSTSFII
            710       720       

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