SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >K19M22.16 (Universal genetic code) : 724 aa vs library searching gi:2367392 library 702 residues in 1 sequences The best scores are: s-w gi|2367392 (702)1791 >>gi|2367392 (702 aa) Smith-Waterman score: 1791; 40.053% identity in 749 aa overlap 10 20 30 40 50 K19M22 MTRWSMSMHCTLFLLFLLRLTCIFSDSDYLMGLGSYDITGPAADVNMMGYANME-QVA ..:. .::.: .: : ::::::.:..:::::: : :.. gi|236 ILLLSVGFIDAFKISIENHIKLS---DDSSYQIGTGIYDITGPGAETNMMGYA-MPGQIT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 K19M22 SGVHFRLRARAFIVAEPYKKRIAFVNLDAGMASQLVTIKVIERLKQ-------------- .:.::: :::::. . .: ..:. :. : : : :.::. :.. gi|236 GGIHFRQRARAFVFIDSEGNRAVYVSTDSCMIFQEVKIQVIQDLQEIFGPTLYTHDNVLL 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 K19M22 -------------RY----VTSLGFVHQSFNALVDGIEQSIIQAHENLRPGSILINKDIS .: .:.::: ...:... ::: :.:..::....:. .: .. gi|236 SGTHTHSGPAGFSEYALYGITALGFYKKNFDTICDGIVQAIVKAHKSVQPARMLTQQ--- 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 K19M22 FGAELAGELLDAGVNRSPSAYLNNPAHERSKYEYDVDKEMTLVKFVDDQWG-PVGSFNCG ::: ....:::: :: ::: .:.. :. .:::.::... ..:. : : : gi|236 ------GELWNSNINRSPYAYDNNPEEEKAMYDANVDKNMTVIR-IEDMSGNP---F--- 180 190 200 210 220 210 220 230 240 250 260 K19M22 DNKGTAARIMEDWFERENG--CRSVDVESPRRVSSIIS-DPYDQDLMEMASSLLSTGGKT :: : ..: : : :.. .. .:: : .. .:: : : gi|236 -----AA-I--SFF----GVHCTSMN-----NTNHLISGD--NKG---YASYLWE---KH 230 240 250 270 280 290 300 310 320 K19M22 VTRMSSVARRVRSRFRHADKPRFVSAFCQTNCGDVSPNVLGAFCIDTGLPCEFNQSTCGG .. .::. . : :..:: :.: ::::::. : : : : ::... :::.: gi|236 ANGQSSLP---------GTGP-FIAAFGQSNEGDVSPNTRGPTCRD-GKPCDYKTSTCNG 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 K19M22 KNEQCYGRGPGYP-DEFESTRIIGERQFKKAADLFTKASEEIQGKVDYRHAYVDFSQLEV : :.:.. ::: : ::::.::: ::.:: .::..:. ...::..:::.. :.. : gi|236 KVEECWALGPGTDGDMFESTQIIGGNQFNKALELFNNATIQVSGKIQYRHTWKPFTN--V 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 K19M22 TINGQ-NGGSEVVKTCPAAMGFGFAAGTTDGPGAFDFKQGDDQG-NPFWRLVRNLLKNPT .... :.: : . :: .:::..::.:::::::::.: :::.. :::: .. ... .:: gi|236 SVEAPYNSGVEGATTCRGAMGYSFAGGTTDGPGAFNFIQGDNSTTNPFWNFIGGIIAKPT 370 380 390 400 410 420 440 450 460 470 480 490 K19M22 EEQVRCQRPKPILLDTGEMKQPYDWAPSILPVQILRIGQLVILCVPGEFTTMAGRRLRDA .:. :: :::::.:.: : .: :.:...:.::. .::.:.. ::::::::.:::::.. gi|236 PQQTACQAPKPILIDVG-MVEPIPWVPDVMPLQIITLGQIVLVAVPGEFTTMSGRRLRNT 430 440 450 460 470 480 500 510 520 530 540 550 K19M22 VKTVLKEGSNGREFSVVIAGLTNSYSQYIATFEEYQVQRYEGASTLYGPHTLSGYIQEFK :. .. :.. .. :.::::.:.:: :::::::.::::::::::..:::::..: ::: gi|236 VREII--GQSIENPIVLIAGLANTYSGYIATFEEFQVQRYEGASTVFGPHTLGAYQQEFA 490 500 510 520 530 560 570 580 590 600 610 K19M22 KLANDLLSAQTTDPGPQPPDLL-HKQISLLTPVVADMTPIGTAFGDVTSDVPRLSKFRKG .::....... .::: : .. : . .: ::..:..: :::. .:: . . . gi|236 NLAQSIVDGSQADPGTFPRNMSGHTPF-FLPPVIVDVAPKFDDFGDIYTDVSTTTPYSIN 540 550 560 570 580 590 620 630 640 650 660 670 K19M22 ADIVRVQFRSANPRNDLMTEGTFALVERWLEGRETWVPVYDDDDFCLRFKWSRPFKLSTQ . : : : .:: ::..:::..: :.. :.. :. . .: :. .. : . :. gi|236 -QTVTVIFYGANLRNNFMTESSFLTVDQ-LQSNGQWTTILNDGDWDTKLYW-KMHDLGF- 600 610 620 630 640 650 680 690 700 710 720 K19M22 STATIEWRI-PETASPGVYRITHFGSAK-TPIS-SIHHFSGSSSAFVVY : :..: : : : .::.::::: : :: .:.: .. ..: :: : : gi|236 SLITVDWTISPIT-QPGTYRITHSGYAKKNPFSDNLTFYQGISSNFNVQ 660 670 680 690 700 Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:00