SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K19M22.13 (Universal genetic code) : 509 aa
 vs  library
 searching pir::S29851 library

    462 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
pir||S29851                                        (462)1847

>>pir||S29851                                        (462 aa)
Smith-Waterman score: 1847;   55.513% identity in 526 aa overlap

               10        20        30        40        50        60
K19M22 MDEEATSWIRRAKFSQTVSYRLNSSKLASLPFMINQDKFSGLKAIPQRSSSSSSASSSDP
       : :...:::::..::.:: .::. ..:.:.:. . :..        :.:          :
pir||S MGEDGNSWIRRTNFSHTVCHRLDPARLGSIPISV-QSE--------QKSR---------P
               10        20        30                 40           

               70        80        90       100       110       120
K19M22 KLVSSNSQTTGDTSSLEAADVYVVDSEIQTNPVTHKQRSVSPSPQMAVPDVFKEARSERK
          ::           .:          : .:.:.::::.:: :.  . ..:.::: :.:
pir||S ---SS-----------KA----------QRHPMTYKQRSLSPLPETYLSEAFREARLEQK
                                     50        60        70        

              130       140        150        160       170        
K19M22 RFSTPHPRRVESEKGMKPKLSHKNSFD-KRSFNLRSPS-GPIRDLGTLRIQERVKSKKDT
       :::::.:::   :: .  :: .:.: . :.: . .::: .: :       : . :..::.
pir||S RFSTPNPRR---EKRIMGKLLNKDSRETKESSS-KSPSRSPNR-------QVKSKNRKDS
       80           90       100        110              120       

      180       190       200       210       220       230        
K19M22 GWSKLFDNTGRRVSAVEASEEFRVDMSKLFFGLKFAHGLYSRLYHGKYEDKAVAVKLITV
       .:.::.:: : ...:::..::. ::::.:::::::::: .:::::: :.:.:::::.: :
pir||S AWTKLLDNGGGKITAVETAEEWNVDMSQLFFGLKFAHGAHSRLYHGVYKDEAVAVKIIMV
       130       140       150       160       170       180       

      240       250       260       270                       280  
K19M22 PDDDDNGCLGARLEKQFTKEVTLLSRLTHPNVIK----------------YLPEGSLRSF
       :.:: :: :..:::::: .:::::::: : ::::                :: :::::..
pir||S PEDDGNGALASRLEKQFIREVTLLSRLHHQNVIKFSAACRKPPVYCIITEYLAEGSLRAY
       190       200       210       220       230       240       

            290       300       310       320       330       340  
K19M22 LHKPENRSLPLKKLIEFAIDIARGMEYIHSRRIIHRDLKPENVLIDEEFHLKIADFGIAC
       ::: :.... :.::: ::.:::::::::::. .:::::::::.::.:. :::::::::::
pir||S LHKLEHQTISLQKLIAFALDIARGMEYIHSQGVIHRDLKPENILINEDNHLKIADFGIAC
       250       260       270       280       290       300       

            350       360       370       380       390       400  
K19M22 EEEYCDMLADDPGTYRWMAPEMIKRKPHGRKADVYSFGLVLWEMVAGAIPYEDMNPIQAA
       ::  ::.::::::::::::::::::: .:.:.:::::::.::::..:.::::::::::::
pir||S EEASCDLLADDPGTYRWMAPEMIKRKSYGKKVDVYSFGLILWEMLTGTIPYEDMNPIQAA
       310       320       330       340       350       360       

            410       420       430       440       450       460  
K19M22 FAVVHKNIRPAIPGDCPVAMKALIEQCWSVAPDKRPEFWQIVKVLEQFAISLEREGNLNL
       ::::.:: :: ::..:: ::.::::::::. :::::::::.::.::::  ::  .:.:.:
pir||S FAVVNKNSRPIIPSNCPPAMRALIEQCWSLQPDKRPEFWQVVKILEQFESSLASDGTLSL
       370       380       390       400       410       420       

            470       480       490       500         
K19M22 SSSKICKDPRKGLKHWIQKLGPVHAGGGGGSSSSGLGGSALPKPKFA
         .  : : .::: ::::::::.:       ..::     .:::::.
pir||S VPNP-CWDHKKGLLHWIQKLGPLH-------QNSG----PVPKPKFT
       430        440       450                  460  

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