SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K19M22.12 (Universal genetic code) : 470 aa
 vs  library
 searching gi:2252830 library

    341 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
gi|2252830                                         (341)1135

>>gi|2252830                                         (341 aa)
Smith-Waterman score: 1135;   52.000% identity in 350 aa overlap

               10        20        30        40        50        60
K19M22 MPMRSKTPTPLRFSNGKHQRDDSEYSWTDVGTGEKARNVSVLGAIRRAAKKVFVIIFLGQ

               70        80        90       100       110          
K19M22 RKLKPTECRSDPGESSTHDRESTLSGWTGYSSPSSFGRSTERKVSGQYRFSG-SRFQSPG
                                                        : :  :  : :
gi|225                                               MILF-GLCR--SYG
                                                                10 

     120       130       140       150       160       170         
K19M22 KDSSSSKSWHQGPVIFSFGELQRATANFSSVHQIGEGGFGTVFKGKLDDGTIVAIKRARK
          ..... :     :.: :.  :: :::   .::.::::::.: :: ::   :.:::.:
gi|225 ---NANETEHTR---FTFDEIYDATKNFSPSFRIGQGGFGTVYKVKLRDGKTFAVKRAKK
                 20           30        40        50        60     

     180           190       200       210       220       230     
K19M22 NNY----GKSWLLEFKNEIYTLSKIEHMNLVKLYGFLEHGDEKVIVVEYVANGNLREHLD
       . .    : .   :: .:: ::... :..::: :::. :.:::..::::::::.::.:::
gi|225 SMHDDRQGAD--AEFMSEIQTLAQVTHLSLVKYYGFVVHNDEKILVVEYVANGTLRDHLD
          70          80        90       100       110       120   

                  240       250       260              270         
K19M22 G-------L--RGNRLEMAERLEIAIDVAHALTYLHTYT-------DSPIIHRDIKASNI
               :  .:. :.:: ::.:: :::::.:::: ::       . ::::::::.:::
gi|225 CEYTSYYYLLFEGKTLDMATRLDIATDVAHAITYLHMYTRKSIVYIEPPIIHRDIKSSNI
           130       140       150       160       170       180   

     280       290       300        310       320       330        
K19M22 LITNKLRAKVADFGFARLVSE-DLGATHISTQVKGSAGYVDPDYLRTFQLTDKSDVYSFG
       :.:.. ::::::::::::. . : ::::.::::::.:::.::.:: :.:::.::::::::
gi|225 LLTENYRAKVADFGFARLAPDTDSGATHVSTQVKGTAGYLDPEYLTTYQLTEKSDVYSFG
           190       200       210       220       230       240   

      340       350       360       370       380       390        
K19M22 VLLVEILTGRRPIELKRPRKDRLTVKWALRRLKDDEAVLIMDPFLKRNRAAIEVA-EKML
       :::::.:::::::::.: .:.:.:..::.... . ... ..:: :..: :  ..: ::.:
gi|225 VLLVELLTGRRPIELSRGQKERITIRWAIKKFTSGDTISVLDPKLEQNSAN-NLALEKVL
           250       260       270       280       290        300  

       400       410       420       430       440       450       
K19M22 RLASECVTPTRATRPAMKGIAEKLWAIRREMKETMICSSASNSSCSSTTHSFIGRDSDRY
       ..: .:..: : .::.::  .: ::.::....: .. .:                     
gi|225 EMAFQCLAPHRRSRPSMKKCSEILWGIRKDYRE-LLNTSL                    
            310       320       330        340                     

       460       470
K19M22 ALPRIEDNENSIE

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