SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K19E1.9 (Universal genetic code) : 601 aa
 vs  library
 searching atac0031059 library

    658 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
ATAC0031059, 658 bases, 22F9 checksum.             (658)1615

>>ATAC0031059, 658 bases, 22F9 checksum.             (658 aa)
Smith-Waterman score: 1615;   43.598% identity in 656 aa overlap

                  10        20        30        40        50       
K19E1.  MKCQVVL--ILIVVIFNVCIEAETIKEDKHTLLQFVNNINHSHSLNWSPSLSICTKWTG
             ::  .. .....  ...:.  : :..:: :...: : . :.:. : : :. :.:
ATAC00 MASISWVLNSLFSILLLTQRVNSESTAE-KQALLTFLQQIPHENRLQWNESDSACN-WVG
               10        20         30        40        50         

        60        70        80        90       100       110       
K19E1. VTCNSDHSSVDALHLAATGLRGDIELSIIARLSNLRFLILSSNNISGTFPTTLQALKNLT
       : :::..::. .:.: .::: :.:  . ..::..:: : : :: .:: .:. .. : .: 
ATAC00 VECNSNQSSIHSLRLPGTGLVGQIPSGSLGRLTELRVLSLRSNRLSGQIPSDFSNLTHLR
       60        70        80        90       100       110        

       120       130       140       150       160       170       
K19E1. ELKLDFNEFSGPLPSDLSSWERLQVLDLSNNRFNGSIPSSIGKLTLLHSLNLAYNKFSGE
        : :. ::::: .:..... . :  ::.:.: :.:::: :...:: : .: :. : :::.
ATAC00 SLYLQHNEFSGEFPTSFTQLNNLIRLDISSNNFTGSIPFSVNNLTHLTGLFLGNNGFSGN
      120       130       140       150       160       170        

       180       190       200       210             220           
K19E1. IPDLHIPGLKLLNLAHNNLTGTVPQSLQRFPLSAFVGNKV------LAPVHS--------
       .:.. . ::  .:...:::.:..:.::.::   .:.:: :      : : .:        
ATAC00 LPSISL-GLVDFNVSNNNLNGSIPSSLSRFSAESFTGN-VDLCGGPLKPCKSFFVSPSPS
      180        190       200       210        220       230      

                    230       240        250       260         270 
K19E1. -SL-----R---KHTKHHNHVVLGIAL-SVCFAILALLAILLVIIIHNRE--EQRRSSKD
        ::     :   :..:  . ....: . :.  :.: :::.:: . ...:.  .. :... 
ATAC00 PSLINPSNRLSSKKSKLSKAAIVAIIVASALVALL-LLALLLFLCLRKRRGSNEARTKQP
        240       250       260       270        280       290     

                280                       290       300       310  
K19E1. KPS---KRRKDSDPN-------V--------GEGD-NKIVFFEGKNLVFDLEDLLRASAE
       ::.    :  :  :.       :        :: . ::.:: ::    ::::::::::::
ATAC00 KPAGVATRNVDLPPGASSSKEEVTGTSSGMGGETERNKLVFTEGGVYSFDLEDLLRASAE
         300       310       320       330       340       350     

            320       330       340       350       360       370  
K19E1. VLGKGPFGTTYKVDLEDSATIVVKRIKEVSVPQREFEQQIENIGSIKHENVATLRGYFYS
       :::::  ::.::. ::...:.::::.:.: . ..::: :.: .:.::: ::  ::.:.::
ATAC00 VLGKGSVGTSYKAVLEEGTTVVVKRLKDVMASKKEFETQMEVVGKIKHPNVIPLRAYYYS
         360       370       380       390       400       410     

            380       390       400       410       420       430  
K19E1. KDEKLVVYDYYEHGSLSTLLHGQKGLRDRKRLEWETRLNMVYGTARGVAHIHSQSGGKLV
       :::::.:.:..  ::::.::::..:   :  :.:..:. ..  .:::.::.: ..  :::
ATAC00 KDEKLLVFDFMPTGSLSALLHGSRG-SGRTPLDWDNRMRIAITAARGLAHLHVSA--KLV
         420       430       440        450       460         470  

            440       450       460          470       480         
K19E1. HGNIKSSNIFLNGKGYGCISGTGMATLM-HSLP--RHAVGYRAPEITDTRKGTQPSDVYS
       :::::.:::.:. .   :.:  :.  :. .: :  : : ::.:::. .::: :  :::::
ATAC00 HGNIKASNILLHPNQDTCVSDYGLNQLFSNSSPPNRLA-GYHAPEVLETRKVTFKSDVYS
            480       490       500       510        520       530 

     490       500               510       520       530       540 
K19E1. FGILIFEVLTGKS--------EVANLVRWVNSVVREEWTGEVFDEELLRCTQVEEEMVEM
       ::.:..:.:::::        :  .: ::: ::::::::.:::: ::.:  ..:::::..
ATAC00 FGVLLLELLTGKSPNQASLGEEGIDLPRWVLSVVREEWTAEVFDVELMRYHNIEEEMVQL
             540       550       560       570       580       590 

             550       560        570         580         590      
K19E1. LQVGMVCTARLPEKRPNMIEVVRMVEEI-RPEKLASGYR--SE-VSTGAT-TTPIGSLSG
       ::..:.:.. .:..:: : ::.::.:.. : :   .: :  :.  : :.   :: :  : 
ATAC00 LQIAMACVSTVPDQRPVMQEVLRMIEDVNRSETTDDGLRQSSDDPSKGSEGQTPPGE-SR
             600       610       620       630       640        650

        600    
K19E1. SPYIL   
       .:      
ATAC00 TPPRSVTP
               

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