SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K18G13.P2 (Universal genetic code) : 474 aa
 vs  library
 searching spac3h57 library

    855 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
SPAC3H57, 855 bases, 1134 checksum.                (855) 824

>>SPAC3H57, 855 bases, 1134 checksum.                (855 aa)
Smith-Waterman score: 824;   33.402% identity in 488 aa overlap

SPAC3H MKRTRSEKTLSFLNPSRASSNTHLSREGTNRSSNVTRTVSGRKSNHGSSLTDTGESDQLS
               10        20        30        40        50        60

SPAC3H LKSFGAIRQPSQHRSSLFSRMLGSTSHIFGIREDMDNESSEEERDGIPRVEGNAADPFSW
               70        80        90       100       110       120

SPAC3H IPDGKNVWDSPPKYIRVLSHNKKEKSLDHLFLAQELYCKPTLAATHDRYYEPRATDFPNL
              130       140       150       160       170       180

                                                             10    
K18G13                                               ALFKSQEIQAHKGS
                                                     :. ...  .. ...
SPAC3H AHESSEPSSSRHTADAQSITNASVHLHNSSSPLNRTPSVISDTLAVAITSNSSSNSSNNA
              190       200       210       220       230       240

           20        30        40        50        60        70    
K18G13 IWSIKFSLDGRYLASAGEDCVIQIWKVVESERKGELLSMDKQEDGSINLFLLANGSPEPV
       ::..::: :::::: .:.: ...:: :..::.   . :    :  :         : .: 
SPAC3H IWAMKFSRDGRYLAVGGQDRILRIWAVLDSEHARSVAS----ETCS---------S-DP-
              250       260       270           280                

           80        90       100       110       120       130    
K18G13 SMSPKRRGRTSFSRKSVSLDNVLVPEAVFGLSEKPVCSFVGHLDDVLDLSWSKSQHLLSS
         .::             : :. .:  ::  :: :.  ..::  :.::::::... ::::
SPAC3H -NNPK-------------L-NLKAP--VF--SEAPIREYAGHTADILDLSWSRNNFLLSS
                       290            300       310       320      

          140       150       160       170       180       190    
K18G13 SMDKTVRLWDLSSKTCLKVFSHSDYVTCIQFNPVDDNYFISGSLDAKVRIWSIPDHQVVD
       :::::.:::    : ::  : :::.:: : :.: :: .:.::::: :.:.::: .. :  
SPAC3H SMDKTARLWHPVRKDCLCCFEHSDFVTSIAFHPKDDRFFLSGSLDCKLRLWSIKEKAVSF
        330       340       350       360       370       380      

          200       210        220       230       240        250  
K18G13 WNDLHEMVTAACYTPDGQG-ALVGSYKGTCCLYNTHDNKLQQRREINLKN-RKKKTHHKK
       ::.: :..::. ..::: : :..:.. : : .:.:.   :. : ...... : :... .:
SPAC3H WNELPELITAVAFSPDG-GLAIAGTFVGLCLFYDTRG--LRFRTQMSIRSSRGKNAKGSK
        390       400        410       420         430       440   

                   260       270       280         290       300   
K18G13 ITGFQF-------VAGSSSEVLVTSADSRTRVVDGVD--LVHKFKGFRNTNSQISASLTS
       .::.:        .::.. :.:::. ::: :. .  :  :  ::::  :..::  : . .
SPAC3H VTGIQTRTQMIDNIAGDT-EMLVTTNDSRIRIYNLRDKSLELKFKGHANAQSQNRAYFDD
           450       460        470       480       490       500  

           310       320       330       340         350       360 
K18G13 NGKFLVSASEDSNVYVWNYDSDSRAGRSKRVTVTNSYENFYC--RDVSVAAPWPGKISNN
       .:.... .::: .:..:.   . .  ..:.    ...:.:    : ...:.  : :    
SPAC3H DGNYVICGSEDHQVFIWDLPPQ-HMHKTKK----KKHEHFKASVRPITAAVFAPTK----
            510       520        530           540       550       

             370       380       390       400       410       420 
K18G13 HTNNSPEQSSFTANNNPPTPVNDPTNNKTVTNGIISSATNRYFFDRVSATWPEEKLLLAA
        :    .:  .: ...: . .   .  ..   ..::.:.       .  : :  . :   
SPAC3H -T----KQL-LTLSGDP-VYLAAISARRS---SVISNAS-------IE-TGPSLRNL---
                 560        570          580               590     

              430       440       450       460        470         
K18G13 KNRARTS-PRVSVDMSNIQVNTKPSASAWSMVIVTGSLRGEIRIF-QNFGFPVRL     
       :. ...  : . . :       :      . .:: :.: :.::.: :.  : .:      
SPAC3H KSLSHSYLP-IEI-M-------K------GHIIVCGDLDGRIRVFRQDSVFAARKLIEKK
            600                      610       620       630       

SPAC3H NIERKNSETLSNSSFFPQALKAHMNSISSPKRHFSLRHKKNASQITNNENNGNDDIKKGD
       640       650       660       670       680       690       

SPAC3H EPEEEHVGLRKNSTQEKNANLDPNEALKRADMMMLQEGASSMVYYSLTNLDNPGATVNEA
       700       710       720       730       740       750       

SPAC3H AKTAATIEQNEHEIQTSVDPISNVKAILPNADDVSSKNSSTEDQLECLRCGNSLFNVFSR
       760       770       780       790       800       810       

SPAC3H SFVFEGAKFSIVCSHCNRKLLKSGSDDGSETHEMSTLP
       820       830       840       850     

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