SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >K16L22.P2 (Universal genetic code) : 1169 aa vs library searching atac00238724 library 1374 residues in 1 sequences The best scores are: s-w ATAC00238724, 1374 bases, 2224 checksum. (1374)3342 >>ATAC00238724, 1374 bases, 2224 checksum. (1374 aa) Smith-Waterman score: 3342; 41.933% identity in 1221 aa overlap 10 20 30 40 50 K16L22 GLGSSMTVHRLREMRRSFFPEVLFLMETKNQDEYVGRVFQWLGYAHSFTVP :.:.. ::..:::.: .::::.:: :::.. .:. : ::. :: ATAC00 MRILSWNCQGVGNTPTVRHLREIRGLYFPEVIFLCETKKRRNYLENVVGHLGFFDLHTVE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 K16L22 PSGLSGGLALFWKHETDLEILSFSPNFIDVKIQVKAKSFFLTLVYGDPVQQNRRAVWDQI : : ::::::.:: .....:. . .::. . . : :.:: .::.::: .: .:... ATAC00 PIGKSGGLALMWKDSVQIKVLQSDKRLIDALLIWQDKEFYLTCIYGEPVQAERGELWERL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 K16L22 SSLRGFSEEA-WLLAGDFNELLDNSEKRGGPPRSQNSFINFRSFVSQNGLWDLKHSGNPF . : :.:. . :.:.::::::.: ::: ::: :...: ..::..... :::...::: : ATAC00 TRL-GLSRSGPWMLTGDFNELVDPSEKIGGPARKESSCLEFRQMLNSCGLWEVNHSGYQF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 K16L22 SWRGMRYDCLVRQRLDRAMANNSWLESFPSGRAEYLRFEGSDHRPVVI-FV-DESRAKRR :: : : : ::. ::::..::..:.: ::...: ::. ::: :.. .: :. : : ATAC00 SWYGNRNDELVQCRLDRTVANQAWMELFPQAKATYLQKICSDHSPLINNLVGDNWR-KWA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 K16L22 GLFRFDNRL--REN-KDIHKLIQDTWSN-TRETSVL--SKMNSCRLEIIKWTKLQNLNSA : :..:.: ::. :: :. . ::. . .:..: :. ::: :: :: .... .:: ATAC00 G-FKYDKRWVQREGFKD---LLCNFWSQQSTKTNALMMEKIASCRREISKWKRVSKPSSA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 K16L22 SAIRDYQMALEEALSSDPPDPEVIGDLTVKLEQAYKLEEQFWQQRSRVQWLHSGDRNSSY :.. :. :. : .. : : . .. : .: : :. ::::::..::..:...::::..: ATAC00 VRIQELQFKLDAATKQIPFDRRELARLKKELSQEYNNEEQFWQEKSRIMWMRNGDRNTKY 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 K16L22 FHAITRNRRFQNRITVLEDSSGVPRH--EDHQLSQIISEYFQQIFTSESD-GDFRVVN-E ::: :.::: :::: : : : :. :..:... ::...:.:: : : . : . : ATAC00 FHAATKNRRAQNRIQKLIDEEG--REWTSDEDLGRVAEAYFKKLFASE-DVG-YTVEELE 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 K16L22 AIEPMVS-QEDNVRLTRIPDAEEIKVAVFNINATKAPGPDGFTAGF-YHSYWQIIAPEVI . :.:: : .: :. : ::.. :.:.:: : :::::.. :: :...:. .. .. ATAC00 NLTPLVSDQMNNNLLAPITK-EEVQRATFSINPHKCPGPDGMN-GFLYQQFWETMGDQIT 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 K16L22 REVQLFFSTRSFPRRMNETHICLIPKGLGPRKVADYRPIALCNIFYKIVAKILTNRMQQI . :: :: . :. . ::.:.:::::: : .:..:.:::.:::..::...:...::...: ATAC00 EMVQAFFRSGSIEEGMNKTNICLIPKILKAEKMTDFRPISLCNVIYKVIGKLMANRLKKI 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 K16L22 LPKLVSENQSAFVPGRAISDNVLITHEILHYLRLSSATKYGS--MAIKTDMSKAYDRVEW ::.:.::.:.::: :: ::::.::.::.:: ::: .: . .:::::.::::::::: ATAC00 LPSLISETQAAFVKGRLISDNILIAHELLHA--LSSNNKCSEEFIAIKTDISKAYDRVEW 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 K16L22 DFL-KAVLIR-FGFHEIW--MVLECVTSVSYSFLLNGAPQGKVFPTRGLRQGDPLSPYLF :: :: .: .:: . : ...::: :: :. :.::.:.:...:.:::::::::::::: ATAC00 PFLEKA--MRGLGFADHWIRLIMECVKSVRYQVLINGTPHGEIIPSRGLRQGDPLSPYLF 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 K16L22 ILCTEVLSGLCKRAQLLNQLPGISVSQNGPRINHLLFADDTMFFIKSDPKSCSKLAEILL ..:::.: . . :. ::. :..:....: :.:::::::.::. : . .. ... .:. ATAC00 VICTEMLVKMLQSAEQKNQITGLKVARGAPPISHLLFADDSMFYCKVNDEALGQIIRIIE 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 K16L22 RYGKASGQSINFHKSSITFSSKTPNGVRRR--AKRSLKITKEGGAGKYLGLPEHF-GRSK .:. :::: .:. :::: :... . .:: .::.: : .::: : :::::: : : :: ATAC00 EYSLASGQRVNYLKSSIYFGKHISE--ERRCLVKRKLGIEREGGEGVYLGLPESFQG-SK 710 720 730 740 750 760 750 760 770 780 790 800 K16L22 RDVFGAIVDKIRQKSHSWATRFLSSAGKQVMLKAVLASMPLYAMTCFKLPISLCKKIQSL ... . :.. .: .: . ::: .::...:::: ..: :.:.:::.: ..:..:.:. ATAC00 VATLSYLKDRLGKKVLGWQSNFLSPGGKEILLKAVAMALPTYTMSCFKIPKTICQQIESV 770 780 790 800 810 820 810 820 830 840 850 860 K16L22 LTRFWWDDKPDKRKTSWVAWTKLSTPKNAGGLGFRDIERCNDSLLAKLGWRIIQNPDSLL ...::: .: . : : :: .:: :: .:::::..:: : .::.: ::.: . :::. ATAC00 MAEFWWKNKKEGRGLHWKAWCHLSRPKAVGGLGFKEIEAFNIALLGKQLWRMITEKDSLM 830 840 850 860 870 880 870 880 890 900 910 920 K16L22 ARMLTSKYCRDSSFMECKITSRPSHGWRSIIAGRAILKQGLGWLIVNGDKVNLWQDPWLS :... :.: :. .. . :::: .:.:: .....:::. .: ::. .:.: :::.. ATAC00 AKVFKSRYFSKSDPLNAPLGSRPSFAWKSIYEAQVLIKQGIRAVIGNGETINVWTDPWIG 890 900 910 920 930 940 930 940 950 960 970 K16L22 ISKPLTPVGPAAREHQELKVSHLINQ-------VTKQ--------WDWERISQILPG--Y .:: . :: : .: :::..: :.:. :.:. .: ..: ATAC00 -AKP----AKAA---QAVKRSHLVSQYAANSIHVVKDLLLPDGRDWNWNLVSLLFPDNTQ 950 960 970 980 990 980 990 1000 1010 1020 K16L22 EPLISQLPG-PACRGEDKLVWLPVKSGCYTSRSGYG-LTSV--------EFVPPALTRFN : ... :: : :...: .:: :. .::: .: . : . :.: . ATAC00 ENILALRPGGKETR--DRFTWEYSRSGHYSVKSGYWVMTEIINQRNNPQEVLQPSLDPI- 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1030 1040 1050 1060 1070 K16L22 WQRQLWKLPTMPKIKTFLWKAARDALPVGLQLVRRHITPQGECHRCGAL-ESTTHMLFHC .: :.::: . :::. :::. . . : :. .:. ::.. . : :: . :...:.::.: ATAC00 FQ-QIWKLDVPPKIHHFLWRCVNNCLSVASNLAYRHLAREKSCVRCPSHGETVNHLLFKC 1060 1070 1080 1090 1100 1080 1090 1100 1110 1120 1130 K16L22 EFAVQVWNLAPIQMENIP---WGSSVTDALS-LLKRSRNLPPSGLHKACLFAWISWHIWK :: .: ..:. : :. :. . .:. .. : . :.: :. :: :..:: ATAC00 PFARLTWAISPLPAP--PGGEWAESLFRNMHHVLSVHKSQPEESDHHA-LIPWILWRLWK 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1140 1150 1160 K16L22 ARNHLIFNNTNYSAIEIITKAVQDARAWQSAQII :: :.:.. ...: ..: ::..: ::.. ATAC00 NRNDLVFKGREFTAPQVILKATEDMDAWNNRKEPQPQVTSSTRDRCVKWQPPSHGWVKCN 1170 1180 1190 1200 1210 1220 ATAC00 TDGAWSKDLGNCGVGWVLRNHTGRLLWLGLRALPSQQSVLETEVEALRWAVLSLSRFNYR 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ATAC00 RVIFESDSQYLVSLIQNEMDIPSLAPRIQDIRNLLRHFEEVKFQFTRREGNNVADRTARE 1290 1300 1310 1320 1330 1340 ATAC00 SLSLMNYDPKMYSITPDWIKNLVDLETV 1350 1360 1370 Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:01