SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K16L22.12 (Universal genetic code) : 388 aa
 vs  library
 searching atac0023435 library

    498 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
ATAC0023435, 498 bases, 234 checksum.              (498)1365

>>ATAC0023435, 498 bases, 234 checksum.              (498 aa)
Smith-Waterman score: 1365;   47.648% identity in 489 aa overlap

                         10        20        30        40        50
K16L22          MGIA-RWLNRTVGFFVFALLDIADFLLCYTYKTLDYFLESERKPCYCSSPP
                  .:  :::..:.: :: .:::.: .::  ::. ::..:.: ::::: :  
ATAC00 MAVMKIKGAATVAGTWLNEAVSFVVFCILDIVDSFLCLLYKAADYLFEAEWKPCYCLSDK
               10        20        30        40        50        60

                60        70               80        90            
K16L22 EAKAKTE-KIIVSERGGYSKVVSLT-------RSKIHFDEISDTLYSRGPSLLT------
       :  . :. ::..:. .: ::...:.       ::::....::.:::.: :::..      
ATAC00 EPITTTRGKILLSHNNGESKILTLSPLQELGGRSKIELEDISETLYTR-PSLISDISTIS
               70        80        90       100        110         

              100          110                                     
K16L22 ------RLSKLVRS-VKC--FNYK-------GL-------------IMRGNV--------
             :. :..::  .:   : :       .:             ..::..        
ATAC00 VNELNKRFVKVTRSESECSGHNEKTKNKRRRSLTKSSLTVNFTVVEMLRGKIRPQNLNHD
     120       130       140       150       160       170         

     120                                  130                      
K16L22 VE--S-CD-------------HH----ESK-------KK--------ISK----------
       .   : ::             .:    ...       :.        ::.          
ATAC00 ISRWSDCDCGFCTSWASTSDKNHSLFVKTQIPNGVTAKEDVLFIHGFISSSAFWTETVFP
     180       190       200       210       220       230         

              140       150       160       170       180       190
K16L22 ---AKSN-YRFIAVDLLGYGRSPKPNDSLYTLREHLEMIEKSVISKFKLKTFHIVAHSLG
          :.:. .:..::::::.:.:::: :::::::::.:::::::. :...:.:::::::::
ATAC00 SLSASSSTHRLFAVDLLGFGKSPKPADSLYTLREHVEMIEKSVLHKYNVKSFHIVAHSLG
     240       250       260       270       280       290         

              200       210       220        230       240         
K16L22 CILALALAVKHPGAIKSLTLLAPPYYKVPKGVQ-PAQYVMREVARKEVWPPMQFGASVLS
       :::::.::..: : :::::::::::: :::: . : ::::..:: ..::::. .:::.  
ATAC00 CILALSLAARHGGLIKSLTLLAPPYYPVPKGEKKPRQYVMKKVAPRKVWPPIALGASMAC
     300       310       320       330       340       350         

     250       260       270       280         290       300       
K16L22 WYEHLGRTIGLVLIKNHQLIEFVTRLLTLNRMRT--YLIEGFLCHTHNGSFHTLHNIIFG
       ::::..::: :.. :.:.. .:.. .:: :  ::  .:::::.:::::...::::::: :
ATAC00 WYEHISRTICLLICKHHRVWQFIAGVLTRNN-RTVNFLIEGFMCHTHNAAWHTLHNIICG
     360       370       380       390        400       410        

       310       320       330       340       350       360       
K16L22 SGAKLDSYLDHVRDHVDCDVAIFHGGKDELIPVECSYSVKSKVPRATVHVIPDKDHITIV
       .:.:::.::: :::.. :.:.::::: ::::::::::.::...::: :.::  :::::.:
ATAC00 TGSKLDTYLDIVRDKLKCNVTIFHGGDDELIPVECSYNVKQRIPRARVKVIEHKDHITMV
      420       430       440       450       460       470        

       370       380        
K16L22 VGRQKDFARELELIWQRTKST
       :::: .:::::. :: .:.: 
ATAC00 VGRQDEFARELQEIW-KTSSC
      480       490         

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