SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >K16H17.P3 (Universal genetic code) : 374 aa
 vs  library
 searching gi:1839597 library

    625 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
gi|1839597                                         (625)1802

>>gi|1839597                                         (625 aa)
Smith-Waterman score: 1802;   67.342% identity in 395 aa overlap

gi|183 MGQCYGKARGASSRADHDADPSGAGSVAPPSPLPANGAPLPATPRRHKSGSTTPVHHHQA
               10        20        30        40        50        60

gi|183 ATPGAAAWPSPYPAGGASPLPAGVSPSPARSTPRRFFKRPFPPPSPAKHIKATLAKRLGG
               70        80        90       100       110       120

gi|183 GKPKEGTIPEEGGAGAGAGAGAGAGAAVGAADSAEADRPLDKTFGFAKNFGAKYDLGKEV
              130       140       150       160       170       180

                                                                 10
K16H17                                                   ALSGHRHMVK
                                                         ::::: ..:.
gi|183 GRGHFGHTCSAVVKKGEHKGHTVAVKIISKAKMTTAISIEDVRREVKILKALSGHDNLVR
              190       200       210       220       230       240

               20        30        40        50        60        70
K16H17 FYDVYEDADNVFVVMELCEGGELLDRILARGGRYPEVDAKRILVQILSATAFFHLQGVVH
       :::. ::: ::..::::::::::::::::::::: : ::: :.:::::..:: :::::::
gi|183 FYDACEDALNVYIVMELCEGGELLDRILARGGRYTEEDAKAIIVQILSVVAFCHLQGVVH
              250       260       270       280       290       300

               80        90       100       110       120       130
K16H17 RDLKPENFLFTSRNEDAILKVIDFGLSDFIRYDQRLNDVVGSAYYVAPEVLHRSYSTEAD
       :::::::::::.:.:.: .:.:::::::::: :.::::.::::::::::::::::: :::
gi|183 RDLKPENFLFTTRDESAPMKLIDFGLSDFIRPDERLNDIVGSAYYVAPEVLHRSYSMEAD
              310       320       330       340       350       360

              140       150       160       170       180       190
K16H17 MWSIGVISYILLCGSRPFYGRTESAIFRCVLRANPNFEDMPWPSISPTAKDFVKRLLNKD
       .::::::.::::::::::..::::.::: ::::.:::.: ::::.:  :::::::.::::
gi|183 IWSIGVITYILLCGSRPFWARTESGIFRSVLRADPNFDDSPWPSVSAEAKDFVKRFLNKD
              370       380       390       400       410       420

              200       210       220       230       240       250
K16H17 HRKRMTAAQALAHPWLRDENPGLLLDFSVYKLVKSYIRASPFRRSALKALSKAIPDEELV
       .::::::.:::.:::::::.  . ::. ...:::.:.::.:..: ::::::::. ..::.
gi|183 YRKRMTAVQALTHPWLRDEQRQIPLDILIFRLVKQYLRATPLKRLALKALSKALSEDELL
              430       440       450       460       470       480

              260       270                            280         
K16H17 FLKAQFMLLDPKDGGLSLNCF-T---------M-----------MQPLAQKKLDFEEFCA
       .:. :: ::.:.:: .::. : :         :           ..::: .:.:::::::
gi|183 YLRLQFKLLEPRDGFVSLDNFRTALTRYSTDAMRESRVLEFQHALEPLAYRKMDFEEFCA
              490       500       510       520       530       540

     290       300       310       320       330       340         
K16H17 AAVSVYQLEALEEWEQIATSAFEHFEHEGNRIISVQELAGEMSVGPSAYPLLKDWIRSSD
       ::.: :::::::.::.:: .::.:::.::::.:::.::: :....:. : ...::::.::
gi|183 AAISPYQLEALERWEEIAGTAFQHFEQEGNRVISVEELAQELNLAPTHYSIVQDWIRKSD
              550       560       570       580       590       600

     350       360       370     
K16H17 GKLSFLGYAKFLHGVTVRSSSSRPR 
       :::.:::..:::::::.:.:..: : 
gi|183 GKLNFLGFTKFLHGVTIRGSNTR-RH
              610       620      

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