SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >K11J9.18 (Universal genetic code) : 850 aa vs library searching ddu66526 library 1336 residues in 1 sequences The best scores are: s-w DDU66526, 1336 bases, 1622 checksum. (1336)1219 >>DDU66526, 1336 bases, 1622 checksum. (1336 aa) Smith-Waterman score: 1219; 32.723% identity in 819 aa overlap 10 20 30 40 50 60 K11J9. MKASDASSSAYKNITDPTLLVSPPILPCEDKFFVKLPCYDFVWSGNNSRRVTDIVSAIMA 70 80 90 100 110 K11J9. NNPGRPIPTNKVQSFKEPDEVDTWLLSHPL--QVPGA----LHFVERNASVISYGVQTNS : :: :. :: ... ... . ..: .:. DDU665 SIPLGFQINGAPPKNEPLLKMDGNSLEFNVVVNT 10 20 30 120 130 140 150 160 K11J9. SSESKRGQTEDPTFKFLVPLQVAAEREIA-------RSL-LGDPNFGWGLGFKEFAR-PA . . . : .. . . .: :. . :. . :....: . : : : DDU665 TCPNILATC--PDYS--IAITTAIEKAVITYYSQKIRNEKIPPPTISYGSN--AFPRYPP 40 50 60 70 80 170 180 190 200 210 220 K11J9. IITETTSALSVMGPVFFLAFSMFGFVLQLGALVTEKELKLRQAMTMMGVYDSAYWLSW-L : .: : : .:. ::..:.. : . ::: ::.:.:.:::. . ::.:: . DDU665 ---EQGAA-RVWGGLFYYCGSMISFIFLLYKVSFEKENKLKQGMVMMGLSVNQYWISWFI 90 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 280 K11J9. TWEGILTLVSSLFLVLFGMIFRFDFFL-KNSFVLVFLLFLLFQFNMIGLAFALSSIISKS : : :.: :. .. :. .. ::: .: :::. . : :: ..: ..:: : ..:... DDU665 TSFTIDILIS-LITIIVGLACQLPFFLGSNFFVLI-ITFSLFTISMSSVAFFLLTFIQST 150 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 K11J9. SSATTVGFLVFLIGFITQFV-SATG---FP--Y--SSSYAVSRRVMWSLFPPNTFSAGLK .:: .:. .:..: : :.: :. : : : .:. :.. :.. .: : : : DDU665 KSAIGIGMGIFIVGSIFQLVFSGMGTMIFELIYQTNSNGALAARIIL-FFIP-MFHF-TK 210 220 230 240 250 340 350 360 370 K11J9. LLLD----ATSTP----KSSGISWS-N------RAVCEG-GQATCNIIYQWLLGTFLFWF .: : .:. : : : .: . : ..: ::. : .. :.:.. DDU665 VLTDIGNVTTNYPLLTYKFSDLSTDLNIGGTVLKTVIPTTGQSICYLLA--LIGVYT--- 260 270 280 290 300 310 380 390 400 410 420 430 K11J9. VLAIYFDNIIPNASGVRKPIFYFLAPGYWTGKGGNKVEEH-NTP--NDKDVLEEETEVKQ ::: ::..:::. .:. .: ..:. :.:: : . .::. : :: .:.:: .. . . DDU665 VLAWYFEHIIPGNDGTSSPPWFFVLPSYW-GLSLKKVR-HIPTPYFDDEDV---RAAITK 320 330 340 350 360 440 450 460 470 480 490 K11J9. QAMDGIADPNIA-VQIHGLAKTYPGTTKLGCCKCTKTSPFHAVKGLWMNIAKDQLFCLLG : : :. : : . : ::.:.: ::: . :: :::: : ... : .. .:: DDU665 -AHD--AS-NRAPLIICGLSKSY---TKL--FRPKKT--VHAVKYLSLSVEKGTILGFLG 370 380 390 400 410 500 510 520 530 540 550 K11J9. PNGAGKTTTISCLTGI-NPVTGGDALIYGDSIRSSVGISNIRKMIGVCPQFDILWDALSS :: ::.:::. :::. .: :.::::.:: :. :. :. .:.. .: :: :::: ... DDU665 SNGCGKSTTIGMLTGLLEP-TAGDALVYGHSVISN--IAAVRRITSVVPQHDILWAEMTA 420 430 440 450 460 470 560 570 580 590 600 610 K11J9. EQHLHLFASIKGLPPASIKSTAEKLLADVKLTGAAKVRAGSYSGGMKRRLSVAVALIGDP ..::.::. .::.: .: .:.: .:.:. .. ..::::::::::::.: :::: DDU665 REHLQLFSELKGIPAQERESQIQKVLDQVRLSKISNNLISTYSGGMKRRLSVAIACIGDP 480 490 500 510 520 530 620 630 640 650 660 K11J9. KL------TTGMDPITRRHVWDIIQESKKGRAIILTTHSMEEADILSDRIGIMAKGRLRC :. :::.:: ..::. :... :. ..::::.:.:.:..::.:.: :: .: . : DDU665 KIIFMDEPTTGVDPSSKRHLIDLVKSIKNDKVIILTSHDMHEVEILADKIVIMNEGVMAC 540 550 560 570 580 590 670 680 690 700 710 720 K11J9. IGTSIRLKSRFGTGFVATVSFIENKNDNNIG-----VGASHEPLKKFFKEGFFEELQ-NR :.:..:::..: :. .:... :. ..: : : : ::.:.. :: : DDU665 NGNSLQLKSKYGEGY--SVNIVA-KSPESIPAVVEFVTLSI-PGCKFMKQS---ALQLN- 600 610 620 630 640 730 740 750 760 770 K11J9. ESEFG--IS-DIQLGLA-TLEEVFL-N--IAR-QAELESATAEGNMV--TLELASGI-S- :: .. : :: .. ..: : . . .. :. . :. . .: . . : DDU665 ---FGFPVTID-QLKYDWFVKCILLENRKMPHFRSTLQYIKDQENFYPHSWQLITKLESK 650 660 670 680 690 700 780 790 800 810 K11J9. LEIPVGAR----FV-GI--PDTENAE--NPSGVMV--EVYWQQDGS-GSMCISGHSSEMR :.: . . :. .: : :. : .. . :.:..:. : :...: . DDU665 LKIKLTDEYYHLFIHSILTYDLESILKLNTLNLKFKDQSYYQSNGNVG--FASSNNSVLL 710 720 730 740 750 760 820 830 840 850 K11J9. VPQNVPVTRPPSPNALGHKSLRQGVRGIVIDL .:: DDU665 --NNVVNDENYNNNDHIDEYYHYNSNKNFNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNRRNN 770 780 790 800 810 DDU665 NNNKNRYRFRNRYGIDVGAMIIGSSGGGGGGGGGGGGVNNDEENEDNNSNIDNINNSDEN 820 830 840 850 860 870 DDU665 DENCEIKTKFKIPETFDKVLNLFTYFNITQFKSFTAQIFKNMIKLFLNSPGITLEELSMV 880 890 900 910 920 930 DDU665 PCNFNIFKRESLYLLLTFIYQIKFEKVCFIIKNTKFQFNLNGIQFPPDSIINKFHRDHQF 940 950 960 970 980 990 DDU665 DDNSVDPKTFKLLNFKNHLQIIQIINSLFDWISLVTNLEQQQQQQQNNNGNNNFYDQKKM 1000 1010 1020 1030 1040 1050 DDU665 LTLFLPVFDYLYKRLLQTSGTTLKDIEMVIVLFKKFGITIQEDFFNIFFYFLIKSNKFKK 1060 1070 1080 1090 1100 1110 DDU665 YFNYKLSNLLTTPYDLIDKKKQPKLEKYFNSSAFSFNQILNTNFYDLFLILKNHLNYQIN 1120 1130 1140 1150 1160 1170 DDU665 LMPPQPQQPQQPQQPHHQQQQQHYLNFNNFIENINNHNNHSIQQIENLYHQANSIHAQYN 1180 1190 1200 1210 1220 1230 DDU665 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSGNDEIKNKLNQKDRMIEDLKFL 1240 1250 1260 1270 1280 1290 DDU665 LDIGLIGLALKLIREEEVLSKEELKQVIEEILKSLVS 1300 1310 1320 1330 Library scan: 0:00:01 total CPU time: 0:00:05