本データベースは、 農林水産省「先端技術を活用した農林水産研究高度化事業」と
かずさDNA研究所のサポートを受けています。
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MiBASE |
本データベースは、 農林水産省「先端技術を活用した農林水産研究高度化事業」と
かずさDNA研究所のサポートを受けています。
これまでに、トマト品種Micro-Tomの果実由来の19,883 ＥＳＴと葉由来の12,168 ＥＳＴ(合計36,427 ＥＳＴ)を本データベースで公開しています。 |
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| UNIGENE Search | アノテーション、シロイヌナズナの相同性遺伝子やGO、遺伝子発現パターンからUNIGENEの検索ができます。 | News KTU3 (Kazusa Tomato Unigene 3) が、新しいMiBASEから公開されました。2009/Dec Unigene情報を更新しました。"UNIGENE search"もしくはBLASTから検索できます。完全長cDNAを含む、マイクロトムの約9.7万ESTが含まれます。2007/Mar 総アクセス数が35万件に達しました。2007/Mar 完全長cDNAクローンの配布を開始しました。 完全長cDNAライブラリーのクローン情報を追加しました。EST検索ページから利用可能です。 MiBASEがSGNに、Kazusa Microtom Siteとしてリンクが張られました。2005/Jan/19 |
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| EST Search | ESTや完全長ｃDNAクローンを名前やアノテーションから検索できます。 | ||||
| GO Search | シロイヌナズナとの相同性に基づいた、トマトのUNIGENEのGOが検索できます。 | ||||
| Pathway Search | シロイヌナズナとの相同性に基づいた、トマトのUNIGENEの代謝パスウェイが検索できます。 | ||||
| Marker Search | SNP, indels, SSRの検索ができます。 | ||||
| Macroarray Search | 配布しているマクロアレイ上の遺伝子についてのアノテーションの検索や、発現強度のデータから遺伝子の絞込みができます。 マクロアレイの配布についてはこちら。 | ||||
| BLAST | 任意の塩基・タンパク質配列から、トマトESTとUNIGENEの相同性検索ができます。 | ||||
| Tool | 解析や開発に用いたperlなど | ||||
| Link | 関連サイトや論文情報 | ||||
| About us | 矮性トマト品種Micro-TomとcDNAライブラリーについて | ||||
| クローン・リクエスト | リクエスト可能なクローンは、クローン名がFA, FB, FC, LA, LB, LCで始まるものです。 | ||||
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本データベースは、 農林水産省「先端技術を活用した農林水産研究高度化事業」と |
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