Jatropha Genome Database
- JcCB0897541.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0897541.10 + phase: 2 /pseudo/partial
(1272 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00626 2391 0.0
KJC_s19270 646 0.0
KJC_s18264 462 e-129
KJC_s18012 359 1e-98
>KJC_c00626
Length = 2027
Score = 2391 bits (1206), Expect = 0.0
Identities = 1254/1273 (98%), Gaps = 18/1273 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 tgttgcctgatgctttcaaggggattaagcagattggagttnttggctggggatcccagg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1691 tgttgcctgatgctttcaaggggattaagcagattggagttattggctggggatcccagg 1632
Query: 61 ggccagcccaagcacagaatttgagggattctcttgctgatgcaaactctgacatcgtag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1631 ggccagcccaagcacagaatttgagggattctcttgctgatgcaaactctgacatcgtag 1572
Query: 121 taaagccgttttgctattgcagattgggttgaggaagggctcccgctcttttgctgaagc 180
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1571 taaag-----------------attgggttgaggaagggctcccgctcttttgctgaagc 1529
Query: 181 tcgtgctgcggggttcactgaagagagtggaacattgggagacatttgggaaactattgc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1528 tcgtgctgcggggttcactgaagagagtggaacattgggagacatttgggaaactattgc 1469
Query: 241 tggcagtgatcttgtcttgttattgatttctgatgctgctcaggcagataactatgagaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1468 tggcagtgatcttgtcttgttattgatttctgatgctgctcaggcagataactatgagaa 1409
Query: 301 gatattctctcatatgaaaccaaacagcatccttggcctttcccatggttttcttcttgg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1408 gatattctctcatatgaaaccaaacagcatccttggcctttcccatggttttcttcttgg 1349
Query: 361 acatttgcaatcactggggcttgattttcctaagaacataagtgttattgctgtttgtcc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1348 acatttgcaatcactggggcttgattttcctaagaacataagtgttattgctgtttgtcc 1289
Query: 421 caagggaatggggccttctgttcgtaggctctatgttcagggcaaagaaataaatggtgc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1288 caagggaatggggccttctgttcgtaggctctatgttcagggcaaagaaataaatggtgc 1229
Query: 481 aggaattaattcaagttttgctgtccaccaggatgttgatggtagagctgca-gatgttg 539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 1228 aggaattaattcaagttttgctgtccaccaggatgttgatggtagagctgcacgatgttg 1169
Query: 540 ccttgggatggtctgttgctttgggctctccttttacatttgccaccacattggagcagg 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1168 ccttgggatggtctgttgctttgggctctccttttacatttgccaccacattggagcagg 1109
Query: 600 agtacaagagtgacattttcggggaacgtggcatactacttggcgctgtccatggggttg 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1108 agtacaagagtgacattttcggggaacgtggcatactacttggcgctgtccatggggttg 1049
Query: 660 tggaatgcttgttcagaaggtacactgagaatggaatgaatgaagatgtggcttacaaga 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1048 tggaatgcttgttcagaaggtacactgagaatggaatgaatgaagatgtggcttacaaga 989
Query: 720 ataccgttgagagcataacaggaataatatcaaaaactatctcaacaaagggcatgttgg 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 988 ataccgttgagagcataacaggaataatatcaaaaactatctcaacaaagggcatgttgg 929
Query: 780 ctgtttataactcattatccgatgagggaaaaagggactttgagactgcatacagtgcag 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 928 ctgtttataactcattatccgatgagggaaaaagggactttgagactgcatacagtgcag 869
Query: 840 cgtattatccctgtatggacattctatatgagtgttatgaagatgttgctagtggtagtg 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 868 cgtattatccctgtatggacattctatatgagtgttatgaagatgttgctagtggtagtg 809
Query: 900 agattcgaagtgttgtgttggctgggcgtcgattctatgaaaaggagggcctaccagctt 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 808 agattcgaagtgttgtgttggctgggcgtcgattctatgaaaaggagggcctaccagctt 749
Query: 960 tcccaatgggtaagatagatcaaacgcgaatgtggaaagtgggtgaacgtgttcgagcaa 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 748 tcccaatgggtaagatagatcaaacgcgaatgtggaaagtgggtgaacgtgttcgagcaa 689
Query: 1020 cacgacctaaggatgacttgggtcctttatatcctttcactgctggagtatttgtagcat 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 688 cacgacctaaggatgacttgggtcctttatatcctttcactgctggagtatttgtagcat 629
Query: 1080 tgatgatggctcagatcgaggtgttgcggaagaagggacactcgtactctgaaatcataa 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 628 tgatgatggctcagatcgaggtgttgcggaagaagggacactcgtactctgaaatcataa 569
Query: 1140 atgagagtttgattgaagctgtggattcactaaatccattcatgcatgcccgaggtgtct 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 568 atgagagtttgattgaagctgtggattcactaaatccattcatgcatgcccgaggtgtct 509
Query: 1200 cattcatggttgataattgttcgacaactgctcgattaggatcaaggaagtgggcacctc 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 508 cattcatggttgataattgttcgacaactgctcgattaggatcaaggaagtgggcacctc 449
Query: 1260 gttttgattacat 1272
|||||||||||||
Sbjct: 448 gttttgattacat 436
>KJC_s19270
Length = 348
Score = 646 bits (326), Expect = 0.0
Identities = 347/350 (99%), Gaps = 3/350 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 515 gttgatggtagagctgcagatgttgccttgggatggtctgttgctttgggctctcctttt 574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gttgatggtagagctgcagatgttgccttgggatggtctgttgctttgggctctcctttt 60
Query: 575 acatttgccaccacattggagcaggagtacaagagtgacattttcggggaacgtggcata 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 acatttgccaccacattggagcaggagtacaagagtgacattttcggggaacgtggcata 120
Query: 635 ctacttggcgctgtccatggggttgtggaatgcttgttcagaaggtacactgagaatgga 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ctacttggcgctgtccatggggttgtggaatgcttgttcagaaggtacactgagaatgga 180
Query: 695 atgaatgaagatgtggcttacaagaataccgttgagagcataacaggaataatatcaaaa 754
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 atgaatgaagatgtggcttac-agaataccgttgagagcataacaggaataatatc-aaa 238
Query: 755 actatctcaacaaagggcatgttggctgtttataactcattatccgatgagggaaaaagg 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 239 actatctcaacaaagggcatgttggctgtttataactcattatccgatgagggaaaaagg 298
Query: 815 gacttt-gagactgcatacagtgcagcgtattatccctgtatggacattc 863
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299 gactttagagactgcatacagtgcagcgtattatccctgtatggacattc 348
>KJC_s18264
Length = 372
Score = 462 bits (233), Expect = e-129
Identities = 233/233 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 538 tgccttgggatggtctgttgctttgggctctccttttacatttgccaccacattggagca 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 359 tgccttgggatggtctgttgctttgggctctccttttacatttgccaccacattggagca 300
Query: 598 ggagtacaagagtgacattttcggggaacgtggcatactacttggcgctgtccatggggt 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299 ggagtacaagagtgacattttcggggaacgtggcatactacttggcgctgtccatggggt 240
Query: 658 tgtggaatgcttgttcagaaggtacactgagaatggaatgaatgaagatgtggcttacaa 717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 239 tgtggaatgcttgttcagaaggtacactgagaatggaatgaatgaagatgtggcttacaa 180
Query: 718 gaataccgttgagagcataacaggaataatatcaaaaactatctcaacaaagg 770
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 179 gaataccgttgagagcataacaggaataatatcaaaaactatctcaacaaagg 127
>KJC_s18012
Length = 509
Score = 359 bits (181), Expect = 1e-98
Identities = 193/197 (97%)
Strand = Plus / Minus
Query: 979 tcaaacgcgaatgtggaaagtgggtgaacgtgttcgagcaacacgacctaaggatgactt 1038
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 509 tcaaacacgaatgtggaaagtgggtgaacgtgttcgagcaacacgacctaaggatgactt 450
Query: 1039 gggtcctttatatcctttcactgctggagtatttgtagcattgatgatggctcagatcga 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 449 gggtcctttatatcctttcactgctggagtatttgtagcattgatgatggctcagatcga 390
Query: 1099 ggtgttgcggaagaagggacactcgtactctgaaatcataaatgagagtttgattgaagc 1158
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 389 ggtgctgaggaagaagggacactcgtactctgaaatcataaatgagagtttgattgaagc 330
Query: 1159 tgtggattcactaaatc 1175
||||||||||||||||
Sbjct: 329 cgtggattcactaaatc 313