Jatropha Genome Database
- JcCB0531841.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0531841.10 + phase: 1 /pseudo/partial
(961 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01185 1857 0.0
KJC_c02682 615 e-176
KJC_c06199 70 1e-11
>KJC_c01185
Length = 1410
Score = 1857 bits (937), Expect = 0.0
Identities = 958/961 (99%), Gaps = 3/961 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgctctttccggttcgattccacctcaaatctgtacctggttgcctttatattgttact 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 1065 atgctctttccggttcgattccacctcaaatctgtacctggttgcctt-atattgttact 1007
Query: 61 ctagatctctccggtaacagctttctccggtgcccattcctccagaaatcgttaactgca 120
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1006 ctagatctctccggtaacagctt-ctccggtgcc-attcctccagaaatcgttaactgca 949
Query: 121 agttcttgaataatctcattctgaacgacaacaagctgtccggttcgataccgtacggtc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 948 agttcttgaataatctcattctgaacgacaacaagctgtccggttcgataccgtacggtc 889
Query: 181 tcggtggtctttctcggttgaaacgattctcggtggcagacaacgatctgtccggtcagt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 888 tcggtggtctttctcggttgaaacgattctcggtggcagacaacgatctgtccggtcagt 829
Query: 241 taccggctgatttggcgacgtttccagaggctgattttgatgggaacgatggactttgtg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 828 taccggctgatttggcgacgtttccagaggctgattttgatgggaacgatggactttgtg 769
Query: 301 gtagacctcttggtaagtgcggtgggttgagtggtaagagccttggaattataattgttg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 768 gtagacctcttggtaagtgcggtgggttgagtggtaagagccttggaattataattgttg 709
Query: 361 ctggtgttattggtgctgctgggtcactgattttagggtttgtgatttggtggttgttat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 708 ctggtgttattggtgctgctgggtcactgattttagggtttgtgatttggtggttgttat 649
Query: 421 atgttagaacaagcgcgaaaaagaaaggttatggtgatggtagtggcaaggatgattcta 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 648 atgttagaacaagcgcgaaaaagaaaggttatggtgatggtagtggcaaggatgattcta 589
Query: 481 gctgggttgagctattaaggtcacataaacttgttcaagtctcattgtttcaaaaaccca 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 588 gctgggttgagctattaaggtcacataaacttgttcaagtctcattgtttcaaaaaccca 529
Query: 541 ttgttaagatcaagttggctgatctattactagccactaacaattttgatttggaaaata 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 528 ttgttaagatcaagttggctgatctattactagccactaacaattttgatttggaaaata 469
Query: 601 tccagatttctactagaactggagtttcgtacaaggctgttttgcctgatgggtctgctc 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 468 tccagatttctactagaactggagtttcgtacaaggctgttttgcctgatgggtctgctc 409
Query: 661 ttgccattaaaaggcttagtgcttgtaagctgagtgagaagcagtttaggtctgagatga 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 408 ttgccattaaaaggcttagtgcttgtaagctgagtgagaagcagtttaggtctgagatga 349
Query: 721 ataggttaggccaactcaggcatccaaatttggtgcctttgttagggttttgtattgttg 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 348 ataggttaggccaactcaggcatccaaatttggtgcctttgttagggttttgtattgttg 289
Query: 781 aagaagagagactgttggtttataagcatatgcctaatggtactttgtattctcaactgc 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 288 aagaagagagactgttggtttataagcatatgcctaatggtactttgtattctcaactgc 229
Query: 841 atgggagtggatttggtgttagtccctctggtgttttggattggcctgctagaattagga 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 228 atgggagtggatttggtgttagtccctctggtgttttggattggcctgctagaattagga 169
Query: 901 tcggtgttggtgcagctagagggcttgcttggctccaccatggctgccaaccaccatata 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 168 tcggtgttggtgcagctagagggcttgcttggctccaccatggctgccaaccaccatata 109
Query: 961 t 961
|
Sbjct: 108 t 108
>KJC_c02682
Length = 1155
Score = 615 bits (310), Expect = e-176
Identities = 345/350 (98%), Gaps = 5/350 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 614 tagaactggagtttcgtac-aaggctgttttg-cctgatgggtctgctcttgccattaaa 671
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1155 tagaactggagtttcgtactaaggctgttttgtcctgatgggtctgctcttgccattaaa 1096
Query: 672 aggcttagtgcttgtaagctgagtgagaagcagtttaggtctgagatgaataggttaggc 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1095 -ggcttagtgcttgtaagctgagtgagaagcagtttag-tctgagatgaataggttaggc 1038
Query: 732 caactcaggcatccaaatttggtgcctttgttagggttttgtattgttgaagaagagaga 791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1037 caactcaggcatccaaatttggtgcctttgttagggttt-gtattgttgaagaagagaga 979
Query: 792 ctgttggtttataagcatatgcctaatggtactttgtattctcaactgcatgggagtgga 851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 978 ctgttggtttataagcatatgcctaatggtactttgtattctcaactgcatgggagtgga 919
Query: 852 tttggtgttagtccctctggtgttttggattggcctgctagaattaggatcggtgttggt 911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 918 tttggtgttagtccctctggtgttttggattggcctgctagaattaggatcggtgttggt 859
Query: 912 gcagctagagggcttgcttggctccaccatggctgccaaccaccatatat 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 858 gcagctagagggcttgcttggctccaccatggctgccaaccaccatatat 809
>KJC_c06199
Length = 611
Score = 69.9 bits (35), Expect = 1e-11
Identities = 138/171 (80%), Gaps = 1/171 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 660 cttgccattaaaaggcttagtgcttgtaagctgagtgagaagcagtttaggtctgagatg 719
||||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||
Sbjct: 570 cttgcaattaagaggcttagtacttgtaaggttggtgagaagcagtttcgatctgagatg 511
Query: 720 aataggttaggccaactcaggcatccaaatttggtgcctttgttagggttttgtattgtt 779
| | | ||||| | || || |||||||||||| || || || || |||||| ||||
Sbjct: 510 agtcgattaggtgagcttagacatccaaatttgacaccctt-ttgggattttgtgttgtg 452
Query: 780 gaagaagagagactgttggtttataagcatatgcctaatggtactttgtat 830
|| || || | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||
Sbjct: 451 gaggatgaaaaacttttggtttataagcacatgtctaatgggactttgtat 401