Jatropha Genome Database
- JcCB0507301.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0507301.10 - phase: 0 /partial
(664 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00150 1316 0.0
KJC_c12763 765 0.0
KJC_s17919 396 e-110
KJC_s15688 385 e-106
>KJC_c00150
Length = 1583
Score = 1316 bits (664), Expect = 0.0
Identities = 664/664 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgggtgccggtggcagaatgtctgttcctccttcccccaagaagttggaagctgaggtc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 218 atgggtgccggtggcagaatgtctgttcctccttcccccaagaagttggaagctgaggtc 277
Query: 61 ttgaaacgagttccatactcgaagccaccattcacacttggtcaggtcaagaaagctatc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 278 ttgaaacgagttccatactcgaagccaccattcacacttggtcaggtcaagaaagctatc 337
Query: 121 ccacctcattgtttccagcgttctgttctccgctcattctcgtatgttgtttatgacctg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 338 ccacctcattgtttccagcgttctgttctccgctcattctcgtatgttgtttatgacctg 397
Query: 181 acccttgcctttatcttttattatgttgccaccaattacttccacctccttcctcaaccc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 398 acccttgcctttatcttttattatgttgccaccaattacttccacctccttcctcaaccc 457
Query: 241 ctctcttatgtggcctggccaatttactggtccctccaaggctgtgtcctcactggcatt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 458 ctctcttatgtggcctggccaatttactggtccctccaaggctgtgtcctcactggcatt 517
Query: 301 tgggttatagcacatgagtgtgggcatcatgcctttagtgactatcaatggcttgatgac 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 518 tgggttatagcacatgagtgtgggcatcatgcctttagtgactatcaatggcttgatgac 577
Query: 361 atagttggccttctcctccattcctgtctccttgtcccttacttttcatggaaacatagc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 578 atagttggccttctcctccattcctgtctccttgtcccttacttttcatggaaacatagc 637
Query: 421 caccgccgtcatcactctaacaccggttcccttgagcgagatgaagtatttgtccctaaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 638 caccgccgtcatcactctaacaccggttcccttgagcgagatgaagtatttgtccctaaa 697
Query: 481 aagaaatccaacatccgctggttctccaaataccttaacaacctaccaggccgcctattc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 698 aagaaatccaacatccgctggttctccaaataccttaacaacctaccaggccgcctattc 757
Query: 541 actcttaccataacacttgcccttggctggccgctatacctagcatttaatgtttcaggc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 758 actcttaccataacacttgcccttggctggccgctatacctagcatttaatgtttcaggc 817
Query: 601 aggcattatgaccgatttgcctgtcactttgacccatatggccctatctacaatgatcgc 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 818 aggcattatgaccgatttgcctgtcactttgacccatatggccctatctacaatgatcgc 877
Query: 661 gagc 664
||||
Sbjct: 878 gagc 881
>KJC_c12763
Length = 660
Score = 765 bits (386), Expect = 0.0
Identities = 400/402 (99%), Gaps = 2/402 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgggtgccggtggcagaatgtctgttcc-tccttcccccaa-gaagttggaagctgagg 58
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 602 atgggtgccggtggcagaatgtctgttccctccttcccccaacgaagttggaagctgagg 543
Query: 59 tcttgaaacgagttccatactcgaagccaccattcacacttggtcaggtcaagaaagcta 118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 tcttgaaacgagttccatactcgaagccaccattcacacttggtcaggtcaagaaagcta 483
Query: 119 tcccacctcattgtttccagcgttctgttctccgctcattctcgtatgttgtttatgacc 178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 tcccacctcattgtttccagcgttctgttctccgctcattctcgtatgttgtttatgacc 423
Query: 179 tgacccttgcctttatcttttattatgttgccaccaattacttccacctccttcctcaac 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 tgacccttgcctttatcttttattatgttgccaccaattacttccacctccttcctcaac 363
Query: 239 ccctctcttatgtggcctggccaatttactggtccctccaaggctgtgtcctcactggca 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 ccctctcttatgtggcctggccaatttactggtccctccaaggctgtgtcctcactggca 303
Query: 299 tttgggttatagcacatgagtgtgggcatcatgcctttagtgactatcaatggcttgatg 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 tttgggttatagcacatgagtgtgggcatcatgcctttagtgactatcaatggcttgatg 243
Query: 359 acatagttggccttctcctccattcctgtctccttgtccctt 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 acatagttggccttctcctccattcctgtctccttgtccctt 201
Score = 389 bits (196), Expect = e-108
Identities = 206/208 (99%), Gaps = 1/208 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 270 gtccctccaaggctgtgtcctcactggcatttgggttatagcacatgagtgtgggcatca 329
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 207 gtcccttcaaggctgtgtcctcactggcatttgggttatagcacatgagtgtgggcatca 148
Query: 330 tgcctttagtgactatcaatggcttgatgacatagttggccttctcctccattcctgtct 389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 147 tgcctttagtgactatcaatggcttgatgacatagttggccttctcctccattcctgtct 88
Query: 390 ccttgtcccttacttttcatggaaacatagccaccgccgtcatcactctaacaccggttc 449
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 87 ccttgtcccttac-tttcatggaaacatagccaccgccgtcatcactctaacaccggttc 29
Query: 450 ccttgagcgagatgaagtatttgtccct 477
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 28 ccttgagcgagatgaagtatttgtccct 1
>KJC_s17919
Length = 388
Score = 396 bits (200), Expect = e-110
Identities = 207/208 (99%), Gaps = 1/208 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgggtgccggtggcagaatgtctgttcctccttccccc-aagaagttggaagctgaggt 59
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 208 atgggtgccggtggcagaatgtctgttcctccttccccccaagaagttggaagctgaggt 149
Query: 60 cttgaaacgagttccatactcgaagccaccattcacacttggtcaggtcaagaaagctat 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 148 cttgaaacgagttccatactcgaagccaccattcacacttggtcaggtcaagaaagctat 89
Query: 120 cccacctcattgtttccagcgttctgttctccgctcattctcgtatgttgtttatgacct 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 88 cccacctcattgtttccagcgttctgttctccgctcattctcgtatgttgtttatgacct 29
Query: 180 gacccttgcctttatcttttattatgtt 207
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 28 gacccttgcctttatcttttattatgtt 1
>KJC_s15688
Length = 533
Score = 385 bits (194), Expect = e-106
Identities = 194/194 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 40 aagaagttggaagctgaggtcttgaaacgagttccatactcgaagccaccattcacactt 99
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 194 aagaagttggaagctgaggtcttgaaacgagttccatactcgaagccaccattcacactt 135
Query: 100 ggtcaggtcaagaaagctatcccacctcattgtttccagcgttctgttctccgctcattc 159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 134 ggtcaggtcaagaaagctatcccacctcattgtttccagcgttctgttctccgctcattc 75
Query: 160 tcgtatgttgtttatgacctgacccttgcctttatcttttattatgttgccaccaattac 219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 74 tcgtatgttgtttatgacctgacccttgcctttatcttttattatgttgccaccaattac 15
Query: 220 ttccacctccttcc 233
||||||||||||||
Sbjct: 14 ttccacctccttcc 1