Jatropha Genome Database
- JcCB0471671.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0471671.10 + phase: 0
(951 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01897 1421 0.0
>KJC_c01897
Length = 1200
Score = 1421 bits (717), Expect = 0.0
Identities = 738/741 (99%), Gaps = 3/741 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgctcgaggattatcgaatcggtgagttagttgattccacagcttatgcatctgactcc 60
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 739 atgctcgaggattatcgaatcggtgagt-agttgattccacagcttatgcatctgactcc 681
Query: 61 agcgtttcctcgcctaacaactcagttcacggcgcatctgatatgactcaaacacactta 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 680 agcgtttcctcgcctaacaactcagttcacggcgcatctgatatgactcaaacacactta 621
Query: 121 gcgcctattaaagaagtttcatttgctcctgtaagaaatatagctctgataccacgtgag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 620 gcgcctattaaagaagtttcatttgctcctgtaagaaatatagctctgataccacgtgag 561
Query: 181 aaaatctcatgcaagcttataaaaaaggagtctttatctcatgacgtgcgtctctttcgc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 560 aaaatctcatgcaagcttataaaaaaggagtctttatctcatgacgtgcgtctctttcgc 501
Query: 241 tttgcattgccatctgaggatcaagtgttaggcttaccagtaggtaagcacatatatttg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500 tttgcattgccatctgaggatcaagtgttaggcttaccagtaggtaagcacatatatttg 441
Query: 301 tgtgccactattgaagacaagctatgcatgagagcctacacaccaacgagcactattgag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 440 tgtgccactattgaagacaagctatgcatgagagcctacacaccaacgagcactattgag 381
Query: 361 gctgt-ggggtacttcgatcttgtcatcaagatttacttcaagggtgtccacccaaagtt 419
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 gctgtgggggtacttcgatcttgtcatcaagatttacttcaagggtgtccacccaaagtt 321
Query: 420 ccctaatggagggctaatgtcccagtatcttaactcgctacaacttggggcatcaataga 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 320 ccctaatggagggctaatgtcccagtatcttaactcgctacaacttggggcatcaataga 261
Query: 480 cgtgaagggtccattaggccacattgagtacgtcggacgaggaaagtttatggtacatgg 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 cgtgaagggtccattaggccacattgagtacgtcggacgaggaaagtttatggtacatgg 201
Query: 540 taaaccaaaatctgctaaaaaattaaccatgttggctggcgggacaggaattactccgat 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 200 taaaccaaaatctgctaaaaaattaaccatgttggctggcgggacaggaattactccgat 141
Query: 600 ttatcaagtggttcaagccatcttgaaggacccagaagatgatactgaaatgtatgtggt 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 140 ttatcaagtggttcaagccatcttgaaggacccagaagatgatactgaaatgtatgtggt 81
Query: 660 gtatgcgaaccggacagaagatgatattttgttaagagaagagcttgatagctgggctaa 719
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 80 gtatgcgaaccggacagaagatgata-tttgttaagagaagagcttgatagctgggctaa 22
Query: 720 agaatacagcgataggttaaa 740
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 21 agaatacagcgataggttaaa 1