Jatropha Genome Database
- JcCB0468911.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0468911.10 + phase: 0 /partial
(985 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03071 1427 0.0
KJC_s17403 735 0.0
KJC_c00979 111 3e-24
>KJC_c03071
Length = 891
Score = 1427 bits (720), Expect = 0.0
Identities = 788/806 (97%), Gaps = 8/806 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtttattgagaagtttaaggtcgagagtcctaatgttaagtacacggatgatgagatt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 94 atgtttattgagaagtttaaggtcgagagtcctaatgttaagtacacggatgatgagatt 153
Query: 61 cactctgtgtataactatgaaaccactgagctggtttatgagaacagaaatggtacctat 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 154 cactctgtgtataactatgaaaccactgagctggtttatgagaacagaaatggtacctat 213
Query: 121 caatggattgtcaagcccaaatctgtcaaatacgaatttaggactgatatccatgtacct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 214 caatggattgtcaagcccaaatctgtcaaatacgaatttaggactgatatccatgtacct 273
Query: 181 aaattaggggttatgcttgttggatggggaggaaacaacggttctactctcaccgctggg 240
|||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 274 aaata--gggttatgcttgt-ggatggga--gaaacaacggt-ctactctcaccgctggg 327
Query: 241 gttatagcgaacagagaaggaatctcatgggcaaccaaagacaaagtgcaacaggccaat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 328 gttatagcgaacagagaaggaatctcatgggcaaccaaagacaaagtgcaacaggccaat 387
Query: 301 tactttggttcacttactcaagcatcatcaattagagttgggtctttcaatggcgaggag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 388 tactttggttcacttactcaagcatcatcaattagagttgggtctttcaatggcgaggag 447
Query: 361 atttatgctcctttcaagagcctccttcccatggtgaacccagatgatattgtgtttggg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 448 atttatgctcctttcaagagcctccttcccatggtgaacccagatgatattgtgtttggg 507
Query: 421 ggatgggacataagcgacatgaatttggcagatgctatggccagggctaaagtcctggac 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 508 ggatgggacataagcgacatgaatttggcagatgctatggccagggctaaagtcctggac 567
Query: 481 attgatcttcaaaagcaattgaggccctacatggaatctatggtcccactccctggaatc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 568 attgatcttcaaaagcaattgaggccctacatggaatctatggtcccactccctggaatc 627
Query: 541 tatgaccctgatttcattgctgctaaccaaggctcacgtgccaacaacgtgattaaaggc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 628 tatgaccctgatttcattgctgctaaccaaggctcacgtgccaacaacgtgattaaaggc 687
Query: 601 accaagaaagagcaagttgagcaaattgtcaaggacattagggagtttaaggnnnnnnnc 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 688 accaagaaagagcaagttgagcaaattgtcaaggacattagggagtttaagg-aaaaaac 746
Query: 661 aatgtggacaaggtggtagtgttgtggacagccaacacagagaggtacagtaatgttctt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 747 aatgtggacaaggtggtagtgttgtggacagccaacacagagaggtacagtaatgttctt 806
Query: 721 gtagggctaaatgacactgtggagagtctgttggcttctttggagagaaatgaagatgaa 780
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct: 807 gtagggctaaatgacactgnggagagtctgttggcttctttgganag-aatgaagatgaa 865
Query: 781 atatctccatcaaccctgtatgcttt 806
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 866 atatctccatcaaccctgtatgcttt 891
>KJC_s17403
Length = 425
Score = 735 bits (371), Expect = 0.0
Identities = 421/436 (96%), Gaps = 12/436 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 344 ctttcaatggcgaggagatttatgctcctttcaagagcctccttcccatggtgaacccag 403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 425 ctttcaatggcgaggagatttatgctcctttcaagagcctcct-cccatggtgaacccag 367
Query: 404 atgatattgtgtttgggggatgggacataagcgacatgaatttggcagatgctatggcca 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 366 atgatattgtgtttgggggatgggacataagcgacatgaatttggcagatgctatggcca 307
Query: 464 gggctaaagtcctggacattgatcttcaaaagcaattgaggccctacatggaatctatgg 523
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 306 gggctaaagtcctggacattgatct-caaaagcaattgaggccctacatggaatctatgg 248
Query: 524 tcccactccctggaatctatgaccctgatttcattgctgctaaccaaggctcacgtgcca 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 247 tcccactccctggaatctatgaccctgatttcattgctgctaaccaaggctcacgtgcca 188
Query: 584 acaacgtgattaaaggcaccaagaaagagcaagttgagcaaattgtcaaggacattaggg 643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 187 acaacgtgattaaaggcaccaagaaagagcaagttgagcaaattgtcaaggacattaggg 128
Query: 644 agtttaaggnnnnnnncaatgtggacaaggtggtagtgttgtggacagccaacacagaga 703
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 127 a----aa------aaacaatgtggacaaggtggtagtgttgtggacagccaacacagaga 78
Query: 704 ggtacagtaatgttcttgtagggctaaatgacactgtggagagtctgttggcttctttgg 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 ggtacagtaatgttcttgtagggctaaatgacactgtggagagtctgttggcttctttgg 18
Query: 764 agagaaatgaagatga 779
||||||||||||||||
Sbjct: 17 agagaaatgaagatga 2
>KJC_c00979
Length = 782
Score = 111 bits (56), Expect = 3e-24
Identities = 63/64 (98%), Gaps = 1/64 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 918 cttcaagagtggtcagaccaagatgaaatctgttctggttgatttcctttgttggggctg 977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 782 cttcaagagtggtcagaccaagatgaaatctgttctggttgatttcc-ttgttggggctg 724
Query: 978 gtat 981
||||
Sbjct: 723 gtat 720