Jatropha Genome Database
- JcCB0461221.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0461221.10 + phase: 2 /partial
(811 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00592 1487 0.0
KJC_c02737 86 2e-16
>KJC_c00592
Length = 1386
Score = 1487 bits (750), Expect = 0.0
Identities = 794/812 (97%), Gaps = 1/812 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 catttctgttgatggaaaggtcattaaggttgtttccgaccgtaaccccgtcaaccttcc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 442 catttctgttgatggaaaggtcattaaggttgtttccgaccgtaaccccgtcaaccttcc 501
Query: 61 atnnnnnnnagttgggattgacttggtgattgaagggactggagtttttgttgatagaga 120
|| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 502 atggggggagttggggattgacttggtgattgaagggactggagtttttgttgatagaga 561
Query: 121 tggtgcagggaaacacattcaggctggagccaagaaggttctaattacagctcctggaaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 562 tggtgcagggaaacacattcaggctggagccaagaaggttctaattacagctcctggaaa 621
Query: 181 gggtgatatcccaacttatgttgttggggtaaatgctgatgcttacaatcctgctgagcc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 622 gggtgatatcccaacttatgttgttggggtaaatgctgatgcttacaatcctgctgagcc 681
Query: 241 tatcatcagcaacgcttcttgcactactaattgtcttgctcccttcgtcaaggtccttga 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 682 tatcatcagcaacgcttcttgcactactaattgtcttgctcccttcgtcaaggtccttga 741
Query: 301 ccagaaatttgggatcatcaagggaaccatgacaaccactcactcatacaccggtgacca 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 742 ccagaaatttgggatcatcaagggaaccatgacaaccactcactcatacaccggtgacca 801
Query: 361 aaggctactcgacgccagccaccgtgacttgaggcgtgcaagagctgctgcccttaacat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 802 aaggctactcgacgccagccaccgtgacttgaggcgtgcaagagctgctgcccttaacat 861
Query: 421 agttccaacttcaaccggagcagcaaaggcagttgcacttgtacttccaactctcaaggg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 862 agttccaacttcaaccggagcagcaaaggcagttgcacttgtacttccaactctcaaggg 921
Query: 481 taaactaaatggcattgcattgcgtgttccaacaccaaacgtctcggtggttgatcttgt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 922 taaactaaatggcattgcattgcgtgttccaacaccaaacgtctcggtggttgatcttgt 981
Query: 541 cgttcaggtatccnnnnnnncctttgctgaagaggtaaatgcagcgttcagagaaagt-g 599
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 982 cgttcaggtatccaaaaaaacctttgctgaagaggtaaatgcagcgttcagagaaagtag 1041
Query: 600 cagacaaggagctgaagggtattctatcagtatgcgatgagccacttgtttcagttgact 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1042 cagacaaggagctgaagggtattctatcagtatgcgatgagccacttgtttcagttgact 1101
Query: 660 tcaggtgcacagatgtttcatcaacagttgactcatccttaacaatggtgatgggagatg 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1102 tcaggtgcacagatgtttcatcaacagttgactcatccttaacaatggtgatgggagatg 1161
Query: 720 atatggtgaaggtgattgcttggtatgataatgaatggggatattctcaaagggttgttg 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1162 atatggtgaaggtgattgcttggtatgataatgaatggggatattctcaaagggttgttg 1221
Query: 780 atttggctgacattgttgccaataactggaag 811
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1222 atttggctgacattgttgccaataactggaag 1253
>KJC_c02737
Length = 1233
Score = 85.7 bits (43), Expect = 2e-16
Identities = 118/143 (82%)
Strand = Plus / Plus
Query: 644 cttgtttcagttgacttcaggtgcacagatgtttcatcaacagttgactcatccttaaca 703
||||| || ||||||||| | ||||| |||||||| || || ||||||| || || ||
Sbjct: 1008 cttgtgtctgttgacttccgatgcactgatgtttcttccaccattgactcttcattgacc 1067
Query: 704 atggtgatgggagatgatatggtgaaggtgattgcttggtatgataatgaatggggatat 763
||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||
Sbjct: 1068 atggtcatgggagatgacatggtcaaggtagttgcctggtacgacaatgaatggggatac 1127
Query: 764 tctcaaagggttgttgatttggc 786
||||||||||||||||||||
Sbjct: 1128 agccaaagggttgttgatttggc 1150