Jatropha Genome Database
- JcCB0456011.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0456011.10 + phase: 2 /pseudo/partial
(1288 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c06916 932 0.0
KJC_c07988 928 0.0
KJC_c06982 488 e-137
>KJC_c06916
Length = 738
Score = 932 bits (470), Expect = 0.0
Identities = 489/493 (99%), Gaps = 3/493 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 796 aacaaatgtacctggtgtgcatgcaattggggatgtaattccaggaccgatgttggctca 855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 aacaaatgtacctggtgtgcatgcaattggggatgtaattccaggaccgatgttggctca 679
Query: 856 caaggcagaagaggatggagttgcatgtgtggagtttatagctggtaagcaaggccatgt 915
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 678 caaggcacaagaggatggagttgcatgtgtggagtttatagctggtaagcaaggccatgt 619
Query: 916 agactacgacaaggtccctggagttgtctatacccaccctgaggttgcttctgttggtaa 975
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 618 agactacgacaaggtccctggagttgtctatacc-accctgaggttgcttctgttggtaa 560
Query: 976 gactgaggagcaggttaaggcacttggtgttgaataccgcgttggcaagttccctttctt 1035
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 559 gactgaggagcaggttaaggcacttggtgttgaataccgcgttggcaagt--cctttctt 502
Query: 1036 ggcaaatagccgtgcaaaggcaattgatgatgctgaagggttggtcaagatattggctga 1095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 501 ggcaaatagccgtgcaaaggcaattgatgatgctgaagggttggtcaagatattggctga 442
Query: 1096 gaaggagacagacaaaatattgggagtccatatcatggcacctaatgcaggtgaactgat 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 441 gaaggagacagacaaaatattgggagtccatatcatggcacctaatgcaggtgaactgat 382
Query: 1156 tcatgaggcagtgctggctcttacttacgatgcttcaagcgaggatatagctcgtgtttg 1215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 381 tcatgaggcagtgctggctcttacttacgatgcttcaagcgaggatatagctcgtgtttg 322
Query: 1216 ccatgcgcatccaacaatgagtgaggcattgaaggaagctgcaatggccactcatgacaa 1275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 321 ccatgcgcatccaacaatgagtgaggcattgaaggaagctgcaatggccactcatgacaa 262
Query: 1276 gcccattcatata 1288
|||||||||||||
Sbjct: 261 gcccattcatata 249
>KJC_c07988
Length = 475
Score = 928 bits (468), Expect = 0.0
Identities = 475/476 (99%), Gaps = 1/476 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 291 ttaaaggcaagaatatcataattgcaactgggtctgatgtcaaatctctacctggaatca 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 ttaaaggcaagaatatcataattgcaactgggtctgatgtcaaatctctacctggaatca 416
Query: 351 ccattgatgaagagaaaattgtatcatcgactggtgctttggctttgaaagaaattccta 410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 ccattgatgaagagaaaattgtatcatcgactggtgctttggctttgaaagaaattccta 356
Query: 411 agaaacttgtggtcattggggcaggctacattgggcttgagatgggctctgtgtggggac 470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 agaaacttgtggtcattggggcaggctacattgggcttgagatgggctctgtgtggggac 296
Query: 471 ggcttggctcagaagtcactgttgttgagtttgctccagatattgtcccaagcatggatg 530
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 295 ggcttggctcagaagtcactgt-gttgagtttgctccagatattgtcccaagcatggatg 237
Query: 531 gagaaattcgcaagcaattccagcggacactcgagaagcagaagatgaaattcatgctca 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 236 gagaaattcgcaagcaattccagcggacactcgagaagcagaagatgaaattcatgctca 177
Query: 591 aaactaaggtggtaggagttgatacttctggagatggtgtgaagttgacacttgagccag 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 176 aaactaaggtggtaggagttgatacttctggagatggtgtgaagttgacacttgagccag 117
Query: 651 cagctggtggtgatcaaacaacacttgaagccgacgtggttcttgtctctgctggcaggt 710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 116 cagctggtggtgatcaaacaacacttgaagccgacgtggttcttgtctctgctggcaggt 57
Query: 711 ctccgttcacttctggacttggtcttgacaagataggcgtggaaacagataaggtg 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 56 ctccgttcacttctggacttggtcttgacaagataggcgtggaaacagataaggtg 1
>KJC_c06982
Length = 558
Score = 488 bits (246), Expect = e-137
Identities = 267/270 (98%), Gaps = 3/270 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 39 aggcacttcttcattcatcccacatgttccatgaagctcagcattcatttgcaagtcatg 98
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 291 aggcacttcttcattcatcccacatgttccatgaagctcagcattcatttgcaagtcatg 350
Query: 99 gtgtgaagttttcatctgtcgaagtcgatttgcctgccatgatgggccaaaaagacaaag 158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 351 gtgtgaagttttcatctgtcgaagtcgatttgcctgccatgatgggccaaaaagacaaag 410
Query: 159 ctgttgctaatcttacccgaggtattgaaggtttgttcaagaagaacaaagtgacctatg 218
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 411 ctgttgctaatctta-ccgaggtattgaaggtttgttcaagaagaacaaagtgacctatg 469
Query: 219 tgaaagggtatggcaaattcctctccccttctgaggtgtctgtagacaccattgacggtg 278
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 470 tg-aagggtatggcaaattcctctccccttctgaggtgtctgtagacaccattgacggtg 528
Query: 279 gaaatactgtt-gttaaaggcaagaatatc 307
||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 529 gaaatactgttagttaaaggcaagaatatc 558