Jatropha Genome Database
- JcCB0454241.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0454241.10 + phase: 0
(1227 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c07958 1667 0.0
>KJC_c07958
Length = 897
Score = 1667 bits (841), Expect = 0.0
Identities = 862/870 (99%), Gaps = 1/870 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 126 gtgttgtgtcgggaggaaaacagatggacatttgtatttgagtgaggcagacaagagagg 185
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29 gtgttgtgtcgggaggaaa-cagatggacatttgtatttgagtgaggcagacaagagagg 87
Query: 186 agcggttgctgttgtggccagtaaagagattgatatagaggagactttggggtgtaaagg 245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 88 agcggttgctgttgtggccagtaaagagattgatatagaggagactttggggtgtaaagg 147
Query: 246 tttggtaattgtggaggatactaatgctgttttgcctgcgttggctgcagcgttttataa 305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 148 tttggtaattgtggaggatactaatgctgttttgcctgcgttggctgcagcgttttataa 207
Query: 306 gtacccgtcaaaaaacatggctgtgattgggataactggaacagatggcaaaactactgc 365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 208 gtacccgtcaaaaaacatggctgtgattgggataactggaacagatggcaaaactactgc 267
Query: 366 agcatatttgattaaagggatgtatgaggcaatggggttgaggactgggatgttaagtac 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 268 agcatatttgattaaagggatgtatgaggcaatggggttgaggactgggatgttaagtac 327
Query: 426 agttgcgtattatatacatggcgataataagttggaatcacctaatactgcgccggatgc 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 328 agttgcgtattatatacatggcgataataagttggaatcacctaatactgcgccggatgc 387
Query: 486 ggttttagttcagaatttgatggctaagatggtacataatgggactgaagctgttgttat 545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 388 ggttttagttcagaatttgatggctaagatggtacataatgggactgaagctgttgttat 447
Query: 546 ggaggtgtcttcccaaggaccagcttctgggagttgcaatgaggttgattttgatatttc 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 448 ggaggtgtcttcccaaggaccagcttctgggagttgcaatgaggttgattttgatatttc 507
Query: 606 agtttttaccaatttaagagtggatcacctggattttcaagggactgaggaggaatatag 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 508 agtttttaccaatttaagagtggatcacctggattttcaagggactgaggaggaatatag 567
Query: 666 ggatgccaaagctgagttgtttgctaggatggttgatccagaaaggcacaggaaaattgt 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 568 ggatgccaaagctgagttgtttgctaggatggttgatccagaaaggcacaggaaaattgt 627
Query: 726 taacattgaggaccccaatgcttcnnnnnnnattgcacaggggaatccagatgtgcctgt 785
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 628 taacattgaggaccccaatgcttctttttttattgcacaggggaatccagatgtgcctgt 687
Query: 786 tgtgacctttgctatggacaataaaagtgcagatgttcatcccttgaagtttgaactgtc 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 688 tgtgacctttgctatggacaataaaagtgcagatgttcatcccttgaagtttgaactgtc 747
Query: 846 cctttttgagacacaggttttggttaatacaccccatggtatattagagatttcatctgg 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 748 cctttttgagacacaggttttggttaatacaccccatggtatattagagatttcatctgg 807
Query: 906 attgcttgggaggcataatatctataatattctagctgctgttgctgttgggattgcagt 965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 808 attgcttgggaggcataatatctataatattctagctgctgttgctgttgggattgcagt 867
Query: 966 tggggcaccattggaggacatagtcagagg 995
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 868 tggggcaccattggaggacatagtcagagg 897