Jatropha Genome Database
- JcCB0428411.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0428411.10 + phase: 0 /partial
(1065 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01174 1739 0.0
>KJC_c01174
Length = 1221
Score = 1739 bits (877), Expect = 0.0
Identities = 902/909 (99%), Gaps = 6/909 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 94 aggaaattggagaaagaattgccaggaggaagaactcattttgttgagacttctggtttg 153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 910 aggaaattggagaaagaattgccaggaggaagaactcattttgttgagacttctggtttg 851
Query: 154 ccaataagcacttattttagtgcaatgaaaatattatggttgatggaaaatgtggatgct 213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 850 ccaataagcacttattttagtgcaatgaaaatattatggttgatggaaaatgtggatgct 791
Query: 214 gttaaattggctaccaaaacgggggatgctttgtttggaactgtagatacttggttaatc 273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 790 gttaaattggctaccaaaacgggggatgctttgtttggaactgtagatacttggttaatc 731
Query: 274 tggaatttaaccggtggagtgtcaggtggcctgcatgtcactgatgtctctaatgcatct 333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 730 tggaatttaaccggtggagtgtcaggtggcctgcatgtcactgatgtctctaatgcatct 671
Query: 334 cgaactatgctcatgaatatcaaaactcttgattgggataaaaccacattgcaaacccta 393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 670 cgaactatgctcatgaatatcaaaactcttgattgggataaaaccacattgcaaacccta 611
Query: 394 ggaattccagctggaattttgcccaaaatagttagcaactctgagattattggaaatgtt 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 610 ggaattccagctggaattttgcccaaaatagttagcaactctgagattattggaaatgtt 551
Query: 454 ggcaaggggtggccagttctgggtgttcctattgcaggatgtctaggtgaccaacatgct 513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 550 ggcaaggggtggccagttctgggtgttcctattgcaggatgtctaggtgaccaacatgct 491
Query: 514 gcaatggtaggacaaggttgtagaaaaggagaggccaaaagcacttatggaactggtgct 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 490 gcaatggtaggacaaggttgtagaaaaggagaggccaaaagcacttatggaactggtgct 431
Query: 574 ttcatacttcttaacacaggcgagaagatagttaagtcaaatcatggacttctaaccaca 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 430 ttcatacttcttaacacaggcgagaagatagttaagtcaaatcatggacttctaaccaca 371
Query: 634 ttagcttttaagcttggtcccaaagcacctacaaattatgctctagagggttcaattgct 693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 370 ttagcttttaagcttggtcccaaagcacctacaaattatgctctagagggttcaattgct 311
Query: 694 attgctggagctgcagtccagtggcttagggatggccttgggataattaatgttgcaagt 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 310 attgctggagctgcagtccagtggcttagggatggccttgggataattaatgttgcaagt 251
Query: 754 gagagtgaggtacttgcaaagcaggttgattcgagtggtggggtttattttgtacctgct 813
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct: 250 gagagtgaggtacttgcaaagcaggttgattcgagtggcgggg-ttattttgtacctgct 192
Query: 814 tttaatggattgtttgctccacattggcgtgatgatgctcgtggggtttgtgttgggatc 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 tttaatggattgtttgctccacattggcgtgatgatgctcgtggggtttgtgttgggatc 132
Query: 874 acaaggtttacaactaaggctcacattgctcgagctgtgcttgagagcat-----gtgtt 928
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 131 acaaggtttacaactaaggctcacattgctcgagctgtgcttgagagcatcccccgtgtt 72
Query: 929 ttcaagttaaagatgttttggattcgatgcagaaagatactggcgaaaagggagagcaaa 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 71 ttcaagttaaagatgttttggattcgatgcagaaagatactggcgaaaagggagagcaaa 12
Query: 989 acaatgcga 997
|||||||||
Sbjct: 11 acaatgcga 3
Score = 85.7 bits (43), Expect = 2e-16
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgcaattgtttggatggatgctcgcactagtgccatctgcag 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 951 atgcaattgtttggatggatgctcgcactagtgccatctgcag 909