Jatropha Genome Database
- JcCB0394911.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0394911.10 - phase: 0 /partial
(1419 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c05467 1681 0.0
>KJC_c05467
Length = 863
Score = 1681 bits (848), Expect = 0.0
Identities = 862/864 (99%), Gaps = 2/864 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 269 ccttgcaaccacgtctttttct-agatcctactcccaaattggataggctttgtaataac 327
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 863 ccttgcaaccacgtctttttcttagatcctactcccaaattggataggctttgtaata-c 805
Query: 328 ccaactgccacaaacctcaatttaggtctgagcagcttgcgacgaaaaagattgaggcag 387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 804 ccaactgccacaaacctcaatttaggtctgagcagcttgcgacgaaaaagattgaggcag 745
Query: 388 atgcctgaagttacggtcacgtctagcagcagaatccatgggaagaaagtttgcatagat 447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 744 atgcctgaagttacggtcacgtctagcagcagaatccatgggaagaaagtttgcatagat 685
Query: 448 cgagtgctagaaagctccaacagcaggttaggagattcaggaatgatctctggcaatatg 507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 684 cgagtgctagaaagctccaacagcaggttaggagattcaggaatgatctctggcaatatg 625
Query: 508 atgccgcagagtgtccaggagaatctgaccactcaaaaccttgttccaaacatgttaccc 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 624 atgccgcagagtgtccaggagaatctgaccactcaaaaccttgttccaaacatgttaccc 565
Query: 568 ttacgagcaagaagctttgtatctgatggcaatgtttcagcactccctttggtatcacag 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 564 ttacgagcaagaagctttgtatctgatggcaatgtttcagcactccctttggtatcacag 505
Query: 628 caatcaaggtatcagttggggttaggaaccccaagaagtatgcaggatcaggggtcaggg 687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 504 caatcaaggtatcagttggggttaggaaccccaagaagtatgcaggatcaggggtcaggg 445
Query: 688 tctcttgttaacattccaggagcttcccctgctgggcaggacatgatgatcacatatggt 747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 444 tctcttgttaacattccaggagcttcccctgctgggcaggacatgatgatcacatatggt 385
Query: 748 gaccatattaattctggtgcttctcttcatggtaagagggagaatcaagatgggcaaatg 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 384 gaccatattaattctggtgcttctcttcatggtaagagggagaatcaagatgggcaaatg 325
Query: 808 tcacccttatctagttttaataagagggcaagggtcacctcagtaggtcctgatggaatg 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 324 tcacccttatctagttttaataagagggcaagggtcacctcagtaggtcctgatggaatg 265
Query: 868 caacagcagcaattaggaccacatatcgatggtctccatgcatcagatatgaactggaag 927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 264 caacagcagcaattaggaccacatatcgatggtctccatgcatcagatatgaactggaag 205
Query: 928 aattctttattaccgcaccaagcaacagcaagagggattcactatgctaatacaggcatt 987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 204 aattctttattaccgcaccaagcaacagcaagagggattcactatgctaatacaggcatt 145
Query: 988 cagaagtatccccagcaggtgtttgaaggggttatgaatcaaaatgctatgccaacatca 1047
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 144 cagaagtatccccagcaggtgtttgaaggggttatgaatcaaaatgctatgccaacatca 85
Query: 1048 ttttctgctccacagcaaggtgtaagatttggtccaaaggaagagcagtttgaaacagaa 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 84 ttttctgctccacagcaaggtgtaagatttggtccaaaggaagagcagtttgaaacagaa 25
Query: 1108 aagttagatgtctcagagctcaat 1131
||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 24 aagttagatgtctcagagctcaat 1