Jatropha Genome Database
- JcCB0343111.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0343111.10 - phase: 0 /partial
(906 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c04559 1584 0.0
>KJC_c04559
Length = 1111
Score = 1584 bits (799), Expect = 0.0
Identities = 834/839 (99%), Gaps = 5/839 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 42 gatgatttttggctatgcttatcctgcctatgagtgctacaaaactgttgagaagaataa 101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 839 gatgatttttggctatgcttatcctgcctatgagtgctacaaaactgttgagaagaataa 780
Query: 102 gccagaaattgagcatcttcgattttggtgccagtactggattttggtggctgtgttgac 161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 779 gccagaaattgagcatcttcgattttggtgccagtactggattttggtggctgtgttgac 720
Query: 162 tgtttgtgagagaattggggatgcttttatttcgtgggttccaatgtacagtgaagctaa 221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 719 tgtttgtgagagaattggggatgcttttatttcgtgggttccaatgtacagtgaagctaa 660
Query: 222 gctcgcattcatcatatacttgtggtaccccaagactaagggaactacttatgtgtatga 281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 659 gctcgcattcatcatatacttgtggtaccccaagactaagggaactacttatgtgtatga 600
Query: 282 ttctttcttcaaaccatatgttgcaaagcatgagaatgaaattgatcgcagtttgttgga 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 599 ttctttcttcaaaccatatgttgcaaagcatgagaatgaaattgatcgcagtttgttgga 540
Query: 342 actaagaacgagagctggagatatgtttattttatactggcagagggctgcaagctatgg 401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 539 actaagaacgagagctggagatatgtttattttatactggcagagggctgcaagctatgg 480
Query: 402 tcaaacaag-agtttttgatattttgcaatatgttgcttcacagtcaacaacaccaaggc 460
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 479 tcaaacaagtagtttttgatattttgcaatatgttgcttcacagtcaacaacaccaaggc 420
Query: 461 ctcgtgctgctcagccacagcaaggtactaggactcgccaacctgctaatgctccaaccc 520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 419 ctcgtgctgctcagccacagcaaggtactaggactcgccaacctgctaatgctccaaccc 360
Query: 521 gccaaccttctactacttccaactgtcagccagctgtgcagcaaccagagactgaagaac 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 359 gccaaccttctactacttccaactgtcagccagctgtgcagcaaccagagactgaagaac 300
Query: 581 ctccatcccccacttctagcacatcttcaagtcggcaccaagcggaggtaaacgaagagg 640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299 ctccatcccccacttctagcacatcttcaagtcggcaccaagcggaggtaaacgaagagg 240
Query: 641 taattcctgcacaagcacgagaagcagctcctcccgcagcagctttaattggtccaaaag 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 239 taattcctgcacaagcacgagaagcagctcctcccgcagcagctttaattggtccaaaag 180
Query: 701 ctcctaccgcaccttccaatgct-caaaaaacaaatgcttctgaaacttccagccagcct 759
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 179 ctcctaccgcaccttccaatgctacaaaaaacaaatgcttctgaaacttccagccagcct 120
Query: 760 tcatcaagcaaggcagaggc-aatggagattgaagctgaacctt-caaaaaatgaaaatg 817
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 119 tcatcaagcaaggcagaggcgaatggagattgaagctgaaccttacaaaaaatgaaaatg 60
Query: 818 -caaatcctcctccaaaagacactaacatggacgaagccattcggagaacaagtgccag 875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 59 acaaatcctcctccaaaagacactaacatggacgaagccattcggagaacaagtgccag 1