Jatropha Genome Database
- JcCB0336411.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0336411.10 - phase: 1 /partial
(806 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02571 1362 0.0
>KJC_c02571
Length = 1183
Score = 1362 bits (687), Expect = 0.0
Identities = 697/699 (99%), Gaps = 1/699 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 10 tttcaaactgcttgagatcaagtgggcgtacggggatcatagcatcagaagaagaggatg 69
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 698 tttctaactgcttgagatcaagtgggcgtacggggatcatagcatcagaagaagaggatg 639
Query: 70 taccagtagcagtggaggagagttactctggaaactacatagtggtctttgacccacttg 129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 638 taccagtagcagtggaggagagttactctggaaactacatagtggtctttgacccacttg 579
Query: 130 atgggtcatccaacattgatgctgctgtgtccactggttccatctttggaatatacagcc 189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 578 atgggtcatccaacattgatgctgctgtgtccactggttccatctttggaatatacagcc 519
Query: 190 caaacgatgagtgcctagctgatgttggtgatgacaacactcttgacagcacagaacaaa 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 518 caaacgatgagtgcctagctgatgttggtgatgacaacactcttgacagcacagaacaaa 459
Query: 250 ggtgtattgtgaatgtctgccagccaggaagcaaccttcttgctgctggctactgcatgt 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 458 ggtgtattgtgaatgtctgccagccaggaagcaaccttcttgctgctggctactgcatgt 399
Query: 310 attcaagttcagtgatttttgttatcaccattggaacaggcgtgtacgccttcaccttgg 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 398 attcaagttcagtgatttttgttatcaccattggaacaggcgtgtacgccttcaccttgg 339
Query: 370 atccaatgtatggagaatttgttttaactcaagaaaagattcagataccaaaggccggaa 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 338 atccaatgtatggagaatttgttttaactcaagaaaagattcagataccaaaggccggaa 279
Query: 430 aaatttatgcatttaatgaaggaaactaccaattgtgggacgataagttgaagaagtaca 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 278 aaatttatgcatttaatgaaggaaactaccaattgtgggacgataagttgaagaagtaca 219
Query: 490 ttgatgaccttaaagaccctggccctagtggcaagccctactccgctagatacattggca 549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 218 ttgatgaccttaaagaccctggccctagtggcaagccctactccgctagatacattggca 159
Query: 550 gtttggttggtgacttccaccggacacttttatatggtggaatttatggttatcccagag 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 158 gtttggttggtgacttccaccggacacttttatatggtggaatttatggttatcccagag 99
Query: 610 acaagaaaagcaagaatggaaagctgaggctcttgtacgagtgtgcacctatgagcttta 669
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 98 acaag-aaagcaagaatggaaagctgaggctcttgtacgagtgtgcacctatgagcttta 40
Query: 670 tagtcgaacaagctggtgggaaaggatcagatgggcatc 708
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39 tagtcgaacaagctggtgggaaaggatcagatgggcatc 1