Jatropha Genome Database
- JcCB0279231.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0279231.10 - phase: 0 /pseudo
(1296 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01787 2000 0.0
KJC_s13833 404 e-112
>KJC_c01787
Length = 1048
Score = 2000 bits (1009), Expect = 0.0
Identities = 1039/1049 (99%), Gaps = 2/1049 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 11 aggttgtgctatattggtgcnnnnnnngaaggaatcctacttgaccatccttactttagc 70
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1048 aggttgtgctatattggtnccttttttgaaggaatcctacttgaccatccttactttagc 989
Query: 71 agtagctatgctacccactgggttgaaagataaccaactccgtgagagcaacagccaaaa 130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 988 agtagctatgctacccactgggttgaaagataaccaactccgtgagagcaacagccaaaa 929
Query: 131 ggtccacccccaacccatggaagaatctatgaatcaaaatcctgaagctgtggaagccct 190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 928 ggtccacccccaacccatggaagaatctatgaatcaaaatcctgaagctgtggaagccct 869
Query: 191 ggtatccaaaatattcacaaacatctcctcgttgaagtcagcttacattcagcttcaagc 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 868 ggtatccaaaatattcacaaacatctcctcgttgaagtcagcttacattcagcttcaagc 809
Query: 251 tgctcatactccgtatgatcctngaaaaaattcaggcggctgacaaacttgtaatttccg 310
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 808 tgctcatactccgtatgatcct-gaaaaaattcaggcggctgacaaacttgtaatttccg 750
Query: 311 agctgaagaatttatctgaactcaagcatttttacagggagaattaccccaaaccggtat 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 749 agctgaagaatttatctgaactcaagcatttttacagggagaattaccccaaaccggtat 690
Query: 371 gtgtttctcctcaggactctcgcttagctgccgagatccaagaacaacagagcctactga 430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 689 gtgtttctcctcaggactctcgcttagctgccgagatccaagaacaacagagcctactga 630
Query: 431 aaacatatgaggttatggtgaagaaattccaatctgaaattcagaataaagattctgaga 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 629 aaacatatgaggttatggtgaagaaattccaatctgaaattcagaataaagattctgaga 570
Query: 491 ttattcagttgcagcagcagattgaggaggcaactcagaagcgagctaagctggaaaaga 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 569 ttattcagttgcagcagcagattgaggaggcaactcagaagcgagctaagctggaaaaga 510
Query: 551 atcttaagcttagaggcttgtcaaccaaagaatcagaaggttctggggaagaaaacgggt 610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 509 atcttaagcttagaggcttgtcaaccaaagaatcagaaggttctggggaagaaaacgggt 450
Query: 611 attatcctgtagatcttactcctgagctcttcatgactgctgtagaagtagcttttaaag 670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 449 attatcctgtagatcttactcctgagctcttcatgactgctgtagaagtagcttttaaag 390
Query: 671 ccattcatgatttttctaaacctttgatcaacatgatgaaagcagctgggtgggaccttg 730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 389 ccattcatgatttttctaaacctttgatcaacatgatgaaagcagctgggtgggaccttg 330
Query: 731 atgctgctgctaactccattgaacctgatgttgtttatgcaaagagggctcacaaaaagt 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 329 atgctgctgctaactccattgaacctgatgttgtttatgcaaagagggctcacaaaaagt 270
Query: 791 atgcatttgaatctcatatatgtcaaagaatgttcagtgggttccagcaggaaagcttct 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 269 atgcatttgaatctcatatatgtcaaagaatgttcagtgggttccagcaggaaagcttct 210
Query: 851 caataaaatcagacaatgtgatggtctctagagaaagtttctttcaccaatatcttgcac 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 209 caataaaatcagacaatgtgatggtctctagagaaagtttctttcaccaatatcttgcac 150
Query: 911 tcagagagatggatccattagatgtactaggacaggacccagattccga-ttttggtaaa 969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 149 tcagagagatggatccattagatgtactaggacaggacccagattccgatttttggtaaa 90
Query: 970 ttttgcaggagcaagtacctggtggtggttcatccaaagatggaaggttcattctttgga 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 89 ttttgcaggagcaagtacctggtggtggttcatccaaagatggaaggttcattctttgga 30
Query: 1030 aatttggatcagagaaattatgtaatggg 1058
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29 aatttggatcagagaaattatgtaatggg 1
>KJC_s13833
Length = 353
Score = 404 bits (204), Expect = e-112
Identities = 232/236 (98%), Gaps = 4/236 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 769 gcaaagagggctcacaaaaagtatgcatttgaatctcatatatgtcaaagaatgttcagt 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 118 gcaaagagggctcacaaaaagtatgcatttgaatctcatatatgtcaaagaatgttcagt 177
Query: 829 gggttccagcaggaaagcttctcaataaaatcagacaatgtgatggtctctagagaaagt 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 178 gggttccagcaggaaagcttctcaataaaatcagacaatgtgatggtctctagagaaagt 237
Query: 889 ttctttc-accaa-tatcttgcactcagagagatggatccattagatgtactaggacagg 946
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 238 ttctttctaccaattatcttgcactcagagagatggatccattagatgtactaggacagg 297
Query: 947 acccagattccgattttggt-aaattttg-caggagcaagtacctggtggtggttc 1000
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 298 acccagattccgattttggtaaaattttgtcaggagcaagtacctggtggtggttc 353
Score = 238 bits (120), Expect = 3e-62
Identities = 120/120 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 720 gtgggaccttgatgctgctgctaactccattgaacctgatgttgtttatgcaaagagggc 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gtgggaccttgatgctgctgctaactccattgaacctgatgttgtttatgcaaagagggc 60
Query: 780 tcacaaaaagtatgcatttgaatctcatatatgtcaaagaatgttcagtgggttccagca 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tcacaaaaagtatgcatttgaatctcatatatgtcaaagaatgttcagtgggttccagca 120