Jatropha Genome Database
- JcCB0279111.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0279111.10 - phase: 0
(1017 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00527 1957 0.0
KJC_c00897 773 0.0
KJC_c08227 448 e-125
KJC_s18589 446 e-125
KJC_s19954 100 1e-20
>KJC_c00527
Length = 1425
Score = 1957 bits (987), Expect = 0.0
Identities = 1008/1011 (99%), Gaps = 3/1011 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgccatcctcgatgcttgccttgagcaagatcctgacagcaaggttgcttgcgagactt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1253 atgccatcctcgatgcttgccttgagcaagatcctgacagcaaggttgcttgcgagactt 1194
Query: 61 gcaccaagaccaacatggtcatggtctttggtgagatcacaaccaaaagccaatgtagac 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 1193 gcaccaagaccaacatggtcatggtctttggtgagatcacaaccaaa-gccaatgtagac 1135
Query: 121 tatgaaaagattgttcgtgacacctgccgttcaattggatttgtttctgatgatgttggt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1134 tatgaaaagattgttcgtgacacctgccgttcaattggatttgtttctgatgatgttggt 1075
Query: 181 cttgatgctgacaaatgcaaggtcctagtttacattgagcagcagagccctgatattgct 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1074 cttgatgctgacaaatgcaaggtcctagtttacattgagcagcagagccctgatattgct 1015
Query: 241 cagggtgtccatggccatcttaccaagcggcctgaggagattggtgctggtgaccaaggt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1014 cagggtgtccatggccatcttaccaagcggcctgaggagattggtgctggtgaccaaggt 955
Query: 301 cacatgtttggttatgccactgatgaaacccccgagtttatgccccttagtcatgttctt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 954 cacatgtttggttatgccactgatgaaacccccgagtttatgccccttagtcatgttctt 895
Query: 361 gcaaccaagcttggtgcccgcctcactgacgtccgcaagaacggcacctgcccttggttg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 894 gcaaccaagcttggtgcccgcctcactgacgtccgcaagaacggcacctgcccttggttg 835
Query: 421 agacctgatggcaaaacccaagtcactgtcgagtactacaatgacaatggtgcaatggtt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 834 agacctgatggcaaaacccaagtcactgtcgagtactacaatgacaatggtgcaatggtt 775
Query: 481 ccagtgcgtgtacacactgttctcatttcaacccaacatgatgaaactgtcactaacgat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 774 ccagtgcgtgtacacactgttctcatttcaacccaacatgatgaaactgtcactaacgat 715
Query: 541 gagattgcagctgatttgaaagagcatgttattaagcctgtgatccctgagaagtacctt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 714 gagattgcagctgatttgaaagagcatgttattaagcctgtgatccctgagaagtacctt 655
Query: 601 gatgagaagaccatcttccatcttaacccatcaggcaggtttgtcattggtggtcctcac 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 654 gatgagaagaccatcttccatcttaacccatcaggcaggtttgtcattggtggtcctcac 595
Query: 661 ggtgacgctggactcaccggtcgcaagattatcattgatacctacggtggctggggagcc 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 594 ggtgacgctggactcaccggtcgcaagattatcattgatacctacggtggctggggagcc 535
Query: 721 cacggaggtggtgcattctctggcaaggatcccaccaaagtagacaggagtggtgcctac 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 534 cacggaggtggtgcattctctggcaaggatcccaccaaagtagacaggagtggtgcctac 475
Query: 781 attgttaggcaggctgccaagagcattgttgcaaatgggcttgctcgcagatgcattgtt 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 474 attgttaggcaggctgccaagagcattgttgcaaatgggcttgctcgcagatgcattgtt 415
Query: 841 caagtgtcttatgctattggcgtgccagaaccattatccgtgtttgttgattcctatggc 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 414 caagtgtcttatgctattggcgtgccagaaccattatccgtgtttgttgattcctatggc 355
Query: 901 accggaaagatcccagacaaaggagattctcaagattgtaaaagaaaacttcgacttcag 960
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 354 accggaaagatcccagac-aaggagattctcaagattgtaaaagaaaacttcgacttcag 296
Query: 961 gcctggtatgattgcta-taacttagatctcaagagaggcggcaatggtag 1010
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 295 gcctggtatgattgctattaacttagatctcaagagaggcggcaatggtag 245
>KJC_c00897
Length = 1428
Score = 773 bits (390), Expect = 0.0
Identities = 846/994 (85%), Gaps = 3/994 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 12 gatgcttgccttgagcaagatcctgacagcaaggttgcttgcgagacttgcaccaagacc 71
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||
Sbjct: 1277 gatgcctgccttgagcaagatcctgacagcaaggttgcctgtgaaacatgcaccaagacc 1218
Query: 72 aacatggtcatggtctttggtgagatcacaaccaaaagccaatgtagactatgaaaagat 131
|||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||| |||||
Sbjct: 1217 aacatggtcatggtctttggagagattaccaccaaa-gccaaggtagactatgagaagat 1159
Query: 132 tgttcgtgacacctgccgttcaattggatttgtttctgatgatgttggtcttgatgctga 191
|||||| | || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1158 agttcgtcagacatgccgtggaattggatttatttccgatgatgttggtcttgatgctga 1099
Query: 192 caaatgcaaggtcctagtttacattgagcagcagagccctgatattgctcagggtgtcca 251
||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1098 caaatgcaaggtccttgttaacattgagcaacagagccctgatattgctcagggtgtcca 1039
Query: 252 tggccatcttaccaagcggcctgaggagattggtgctggtgaccaaggtcacatgtttgg 311
|||||| | |||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||
Sbjct: 1038 tggccacttcaccaagcgcccagaagagattggtgctggtgatcagggacatatgtttgg 979
Query: 312 ttatgccactgatgaaacccccgagtttatgccccttagtcatgttcttgcaaccaagct 371
||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||
Sbjct: 978 ttatgccactgatgagacccctgagtatatgcctttgagccatgtccttgcaaccaagct 919
Query: 372 tggtgcccgcctcactgacgtccgcaagaacggcacctgcccttggttgagacctgatgg 431
|| || || ||||| || | ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||
Sbjct: 918 cggggcaaagctaactgaggttaggaagaacggcacctgcccatggctaaggcctgatgg 859
Query: 432 caaaacccaagtcactgtcgagtactacaatgacaatggtgcaatggttccagtgcgtgt 491
||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||
Sbjct: 858 caagactcaggttactgttgagtactacaatgacaatggtgccatggtcccagtccgcgt 799
Query: 492 acacactgttctcatttcaacccaacatgatgaaactgtcactaacgatgagattgcagc 551
||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||
Sbjct: 798 acacactgtcctcatctccacccaacatgatgagactgtaacaaacgatgaaattgctgc 739
Query: 552 tgatttgaaagagcatgttattaagcctgtgatccctgagaagtaccttgatgagaagac 611
||| | || ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 tgacctcaaggagcacgtcatcaagccggtcatccctgagaagtaccttgatgagaagac 679
Query: 612 catcttccatcttaacccatcaggcaggtttgtcattggtggtcctcacggtgacgctgg 671
||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct: 678 catcttccacctcaacccatcagggcgttttgtcattggtggtcctcacggtgatgcagg 619
Query: 672 actcaccggtcgcaagattatcattgatacctacggtggctggggagcccacggaggtgg 731
|||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||
Sbjct: 618 actcactggacgcaagatcattattgatacctatggtggatggggagcccatggtggcgg 559
Query: 732 tgcattctctggcaaggatcccaccaaagtagacaggagtggtgcctacattgttaggca 791
||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct: 558 tgctttctcaggaaaggacccaaccaaggtggacaggagtggtgcttatattgtcaggca 499
Query: 792 ggctgccaagagcattgttgcaaatgggcttgctcgcagatgcattgttcaagtgtctta 851
|||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||
Sbjct: 498 ggctgccaagagcattgtagcaaatggtcttgcccgcaggtgcattgtgcaggtctccta 439
Query: 852 tgctattggcgtgccagaaccattatccgtgtttgttgattcctatggcaccggaaagat 911
|| ||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || ||||||||
Sbjct: 438 cgccattggtgtgcctgagcctttgtctgtctttgtggacagttatggaactggaaagat 379
Query: 912 cccagacaaaggagattctcaagattgtaaaagaaaacttcgacttcaggcctggtatga 971
|| ||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||
Sbjct: 378 tcctgac-aaggagatcctcaagattgtgaaggagaacttcgacttcagacccggaatga 320
Query: 972 ttgctat-aacttagatctcaagagaggcggcaa 1004
| | || ||| ||||||||||||| || |||||
Sbjct: 319 tgaccatcaacctagatctcaagaggggtggcaa 286
>KJC_c08227
Length = 830
Score = 448 bits (226), Expect = e-125
Identities = 539/642 (83%), Gaps = 1/642 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 36 gacagcaaggttgcttgcgagacttgcaccaagaccaacatggtcatggtctttggtgag 95
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||
Sbjct: 693 gacagcaaggtggcttgcgaaacttgcaccaagaccaacctggtcatggtttttggagag 634
Query: 96 atcacaaccaaaagccaatgtagactatgaaaagattgttcgtgacacctgccgttcaat 155
||||| || ||| |||||| ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||
Sbjct: 633 atcaccactaaa-gccaatatagactacgagaagattgtgcgcgacacttgccgttctat 575
Query: 156 tggatttgtttctgatgatgttggtcttgatgctgacaaatgcaaggtcctagtttacat 215
|||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| || || | ||
Sbjct: 574 tggattcacttccgatgatgtgggtctcgatgctgaccattgtaaggtgcttgtcaatat 515
Query: 216 tgagcagcagagccctgatattgctcagggtgtccatggccatcttaccaagcggcctga 275
|||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct: 514 tgagcaacagagtcctgatattgctcaaggtgtccatggccatctcactaagcgccctga 455
Query: 276 ggagattggtgctggtgaccaaggtcacatgtttggttatgccactgatgaaacccccga 335
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct: 454 ggaaattggtgctggtgaccaaggtcacatgtttggctatgctactgatgagacccctga 395
Query: 336 gtttatgccccttagtcatgttcttgcaaccaagcttggtgcccgcctcactgacgtccg 395
|| |||||| | ||||||||| | || ||||| || ||||| || |||||||| || ||
Sbjct: 394 attaatgcccttgagtcatgttttggctaccaaactcggtgctcgtctcactgaggttcg 335
Query: 396 caagaacggcacctgcccttggttgagacctgatggcaaaacccaagtcactgtcgagta 455
|||||| || || ||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||
Sbjct: 334 caagaatggtacttgcccctggctcaggcctgatggtaaaactcaagttactgtcgagta 275
Query: 456 ctacaatgacaatggtgcaatggttccagtgcgtgtacacactgttctcatttcaaccca 515
||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||
Sbjct: 274 ctacagtgataatggtgccatggttcctgtccgtgtccacactgttctcatctctaccca 215
Query: 516 acatgatgaaactgtcactaacgatgagattgcagctgatttgaaagagcatgttattaa 575
|| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | || |||||||| || ||
Sbjct: 214 gcacgatgagactgtgacaaacgatgaaattgctgctgatctcaaggagcatgtcatcaa 155
Query: 576 gcctgtgatccctgagaagtaccttgatgagaagaccatcttccatcttaacccatcagg 635
|||| | || |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||
Sbjct: 154 gcctattattcctgccaagtatttggatgagaagaccatctttcatctgaatccatctgg 95
Query: 636 caggtttgtcattggtggtcctcacggtgacgctggactcac 677
| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||
Sbjct: 94 gcgttttgttattggtggtcctcatggagatgctggtctcac 53
>KJC_s18589
Length = 384
Score = 446 bits (225), Expect = e-125
Identities = 246/249 (98%), Gaps = 3/249 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 748 gatcccaccaaagtagacaggagtggtgcctacattgttaggcaggctgccaagagcatt 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gatcccaccaaagtagacaggagtggtgcctacattgttaggcaggctgccaagagcatt 60
Query: 808 gttgcaaatgggcttgctcgcagatgcattgttcaagtgtcttatgctattggcgtgcca 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gttgcaaatgggcttgctcgcagatgcattgttcaagtgtcttatgctattggcgtgcca 120
Query: 868 gaacca-ttatccgtgtttgttgattcctatggcaccggaaagatcccagacaaaggaga 926
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 121 gaaccatttatccgtgtttgttgattcctatggcaccggaaagatcccagac-aaggaga 179
Query: 927 ttctcaagattgtaaaagaaaacttcgacttcaggcctggtatgattgcta-taacttag 985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 180 ttctcaagattgtaaaagaaaacttcgacttcaggcctggtatgattgctattaacttag 239
Query: 986 atctcaaga 994
|||||||||
Sbjct: 240 atctcaaga 248
>KJC_s19954
Length = 393
Score = 99.6 bits (50), Expect = 1e-20
Identities = 50/50 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 513 ccaacatgatgaaactgtcactaacgatgagattgcagctgatttgaaag 562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 393 ccaacatgatgaaactgtcactaacgatgagattgcagctgatttgaaag 344