Jatropha Genome Database
- JcCB0273441.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0273441.20 - phase: 0 /pseudo
(1287 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02130 1725 0.0
>KJC_c02130
Length = 1185
Score = 1725 bits (870), Expect = 0.0
Identities = 873/874 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggcattctctgagtttaggccactggatgagaacgctttggttgaatacataaaggcc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1135 atggcattctctgagtttaggccactggatgagaacgctttggttgaatacataaaggcc 1076
Query: 61 actcctgttctgtcgaacaagattggtaacgagttcgataacttagaggttaaagaagtt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1075 actcctgttctgtcgaacaagattggtaacgagttcgataacttagaggttaaagaagtt 1016
Query: 121 ggagatgggaatctcaattttgtctacattgttattggctccgctggctcttttgtcatc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1015 ggagatgggaatctcaattttgtctacattgttattggctccgctggctcttttgtcatc 956
Query: 181 aaacaggcactcccttatatacgttgtatcggagaatcatggcctatgactaaggaaaga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 955 aaacaggcactcccttatatacgttgtatcggagaatcatggcctatgactaaggaaaga 896
Query: 241 gcttattttgagggtcgtgcacttaaagagcacggaaaattgtcccctgaacatgttcct 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 895 gcttattttgagggtcgtgcacttaaagagcacggaaaattgtcccctgaacatgttcct 836
Query: 301 gaagtttatcattttgaccgtactatgtctttgattgctatgcgatacttggagccgcca 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 835 gaagtttatcattttgaccgtactatgtctttgattgctatgcgatacttggagccgcca 776
Query: 361 catattatcctccgaaaagggttaattgctggagtgaagtaccctcatctagcagaacac 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 775 catattatcctccgaaaagggttaattgctggagtgaagtaccctcatctagcagaacac 716
Query: 421 atatcagactatatggcaaggactcttttttatacttcccttttgtatcttactacgacc 480
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 715 atatcagactatatggcaaggactcttatttatacttcccttttgtatcttactacgacc 656
Query: 481 gagcataaacgtgttgttgctgaattctgtgggaatgtggagttatgcaggctcactgag 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 655 gagcataaacgtgttgttgctgaattctgtgggaatgtggagttatgcaggctcactgag 596
Query: 541 caggttgttttttctgacccttacaaagtatctgaatacaaccgttggacttccccttac 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595 caggttgttttttctgacccttacaaagtatctgaatacaaccgttggacttccccttac 536
Query: 601 cttgatcaggatgctgtggctgtccgggaggataacattttaaagcttgaagtagctgaa 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 cttgatcaggatgctgtggctgtccgggaggataacattttaaagcttgaagtagctgaa 476
Query: 661 ttgaaatccaggttctgtgaacaagctcaagccttaatccatggagatctccacactggt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 ttgaaatccaggttctgtgaacaagctcaagccttaatccatggagatctccacactggt 416
Query: 721 tctgtcatggttacttcttcttcaactcaggttatagatccagaatttgcattctatggt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 tctgtcatggttacttcttcttcaactcaggttatagatccagaatttgcattctatggt 356
Query: 781 ccaatgggttttgatattggagcttttattggaaacttgattttggcatacttttctcaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 ccaatgggttttgatattggagcttttattggaaacttgattttggcatacttttctcaa 296
Query: 841 gatggccatgcgagtccagtagatgatcgaaagt 874
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 295 gatggccatgcgagtccagtagatgatcgaaagt 262
Score = 511 bits (258), Expect = e-144
Identities = 258/258 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 902 agtcatataaagagtggattttaaagacgattgaagaaacatggaatcttttttacaaaa 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 264 agtcatataaagagtggattttaaagacgattgaagaaacatggaatcttttttacaaaa 205
Query: 962 aattcattgggctttgggatgagcacaaggatggacctggtgaggcatatcttccagcaa 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 204 aattcattgggctttgggatgagcacaaggatggacctggtgaggcatatcttccagcaa 145
Query: 1022 tttataacaaccctgaggttcgtcagcttgtacaggaaaactttttgaaaggtttgttcc 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 144 tttataacaaccctgaggttcgtcagcttgtacaggaaaactttttgaaaggtttgttcc 85
Query: 1082 atgatacccttggatttggtgcagccaaaatgataaggagaattgttggtgtagcccatg 1141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 84 atgatacccttggatttggtgcagccaaaatgataaggagaattgttggtgtagcccatg 25
Query: 1142 ttgaggattttgaatcaa 1159
||||||||||||||||||
Sbjct: 24 ttgaggattttgaatcaa 7