Jatropha Genome Database
- JcCB0225661.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0225661.10 - phase: 0 /partial
(1035 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01866 2052 0.0
KJC_c04993 78 5e-14
>KJC_c01866
Length = 1774
Score = 2052 bits (1035), Expect = 0.0
Identities = 1035/1035 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 tggggccgccttgcaagagaattgacgactcttgaagcagcagcttggagaaagctaact 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1285 tggggccgccttgcaagagaattgacgactcttgaagcagcagcttggagaaagctaact 1226
Query: 61 gttggaggtgctgttgaaccctcaagatgcaattttagcgcttgtgcagtaggaaatcgg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1225 gttggaggtgctgttgaaccctcaagatgcaattttagcgcttgtgcagtaggaaatcgg 1166
Query: 121 gttgtcctttttggtggggaaggtgttaacatgcaaccgatgaatgacacatttgtactg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1165 gttgtcctttttggtggggaaggtgttaacatgcaaccgatgaatgacacatttgtactg 1106
Query: 181 gatttgaactccagcaaccctgagtggcaacatgtgcaagtgagctcccctcctcctgga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1105 gatttgaactccagcaaccctgagtggcaacatgtgcaagtgagctcccctcctcctgga 1046
Query: 241 cggtggggtcacaccctctcttgtgttaatgggtctcatttggtggtttttggaggttgt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1045 cggtggggtcacaccctctcttgtgttaatgggtctcatttggtggtttttggaggttgt 986
Query: 301 ggaaggcaaggcttactcaatgatgtctttgttttggacttggatgccaagcctccaact 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 985 ggaaggcaaggcttactcaatgatgtctttgttttggacttggatgccaagcctccaact 926
Query: 361 tggcgtgagatttctggattggctccaccacttccacgatcatggcacagttcctgcact 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 925 tggcgtgagatttctggattggctccaccacttccacgatcatggcacagttcctgcact 866
Query: 421 cttgatggcaccaagctgatagtctcaggtgggtgtgcagattctggggtacttcttagt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 865 cttgatggcaccaagctgatagtctcaggtgggtgtgcagattctggggtacttcttagt 806
Query: 481 gacacatttctgcttgatctatcaatggaaaaaccagtctggagggagataccagtagca 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 805 gacacatttctgcttgatctatcaatggaaaaaccagtctggagggagataccagtagca 746
Query: 541 tggaccccaccttcacggctgggtcatactctttcagtttatggtggcaggaagatattg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 745 tggaccccaccttcacggctgggtcatactctttcagtttatggtggcaggaagatattg 686
Query: 601 atgtttgggggtttggctaagagtggtccacttcgattccgttccagtgatgttttcact 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 685 atgtttgggggtttggctaagagtggtccacttcgattccgttccagtgatgttttcact 626
Query: 661 atggatctaagtgaggaggagccttgttggaggtgtgtaactgggagcggaatgcctggt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 625 atggatctaagtgaggaggagccttgttggaggtgtgtaactgggagcggaatgcctggt 566
Query: 721 gctggaaacccaggtggcatagctcctcctccaaggcttgatcatgtagctgtgagcctt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 565 gctggaaacccaggtggcatagctcctcctccaaggcttgatcatgtagctgtgagcctt 506
Query: 781 ccaggtggtagaatcctgatatttggtggctcagttgctggtcttcattctgcttcccaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 505 ccaggtggtagaatcctgatatttggtggctcagttgctggtcttcattctgcttcccaa 446
Query: 841 ctttatcttttggaccctaccgatgaaaaacctacgtggaggattctaaatgtaccaggg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 445 ctttatcttttggaccctaccgatgaaaaacctacgtggaggattctaaatgtaccaggg 386
Query: 901 cgacctccacgttttgcctggggacatagtacatgtgtggtaggagggacaagggcaata 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 385 cgacctccacgttttgcctggggacatagtacatgtgtggtaggagggacaagggcaata 326
Query: 961 gtccttggcggtcaaactggcgaggagtggatgctaagtgagctccatgagctgtccttg 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 325 gtccttggcggtcaaactggcgaggagtggatgctaagtgagctccatgagctgtccttg 266
Query: 1021 gctagctctgttatc 1035
|||||||||||||||
Sbjct: 265 gctagctctgttatc 251
>KJC_c04993
Length = 818
Score = 77.8 bits (39), Expect = 5e-14
Identities = 63/71 (88%)
Strand = Plus / Minus
Query: 280 ttggtggtttttggaggttgtggaaggcaaggcttactcaatgatgtctttgttttggac 339
|||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||
Sbjct: 509 ttggtggtatttggagggtgtggaaggcaggggttgctcaatgatgtttttgtcctggac 450
Query: 340 ttggatgccaa 350
|||||||||||
Sbjct: 449 ttggatgccaa 439