Jatropha Genome Database
- JcCB0220081.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0220081.10 - phase: 0 /partial
(888 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01383 1592 0.0
KJC_s16459 212 1e-54
>KJC_c01383
Length = 2242
Score = 1592 bits (803), Expect = 0.0
Identities = 803/803 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gacctggcaacagtcgactcaatcttattgagagagcttccacctgtggaggatagcgat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 803 gacctggcaacagtcgactcaatcttattgagagagcttccacctgtggaggatagcgat 744
Query: 61 gctcggctagctctcaaaagactcatagacattagcatgggagttattactcctttgtca 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 743 gctcggctagctctcaaaagactcatagacattagcatgggagttattactcctttgtca 684
Query: 121 gagcagctgacaaagccattgcccaatgccatggttcttgtaaatcttaaggagattgca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 683 gagcagctgacaaagccattgcccaatgccatggttcttgtaaatcttaaggagattgca 624
Query: 181 actggtgcttacaagcttttgccagaaggtacacgcttggttgtgtctgtacgtggtgat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 623 actggtgcttacaagcttttgccagaaggtacacgcttggttgtgtctgtacgtggtgat 564
Query: 241 gagtcctatgaagaattggaaatcctcaaagatatagatgctacaatgattcttcatgat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 563 gagtcctatgaagaattggaaatcctcaaagatatagatgctacaatgattcttcatgat 504
Query: 301 ctaccatttacagaagataaaattggtagagtgcatgcagccaggaggttgtttgaattc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 503 ctaccatttacagaagataaaattggtagagtgcatgcagccaggaggttgtttgaattc 444
Query: 361 ctatcagaccatgctctgaatttccctgtaattcaccatattcagtttccaaatgcaatc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 443 ctatcagaccatgctctgaatttccctgtaattcaccatattcagtttccaaatgcaatc 384
Query: 421 cacagggatgacttggtcattggtgctggtacaaatgctggggcacttttagtagatggt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 383 cacagggatgacttggtcattggtgctggtacaaatgctggggcacttttagtagatggt 324
Query: 481 cttggcgatggtctcctgctagaagctccaggccaggattttgatttcctgaggaatacc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 323 cttggcgatggtctcctgctagaagctccaggccaggattttgatttcctgaggaatacc 264
Query: 541 tctttcaacttgctacagggttgcagaatgagaaacacgaagacggagtatgtctcgtgt 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 263 tctttcaacttgctacagggttgcagaatgagaaacacgaagacggagtatgtctcgtgt 204
Query: 601 ccatcctgtggtagaactttgtttgaccttcaagaaataagtgcagaaatccgagaaaag 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 203 ccatcctgtggtagaactttgtttgaccttcaagaaataagtgcagaaatccgagaaaag 144
Query: 661 acatctcacttgcctggtgtctcgattgcaattatgggttgcattgtaaatggaccgggt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 143 acatctcacttgcctggtgtctcgattgcaattatgggttgcattgtaaatggaccgggt 84
Query: 721 gagatggctgatgcagattttggatatgttggtggtgctcccggaaagattgacctatac 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 83 gagatggctgatgcagattttggatatgttggtggtgctcccggaaagattgacctatac 24
Query: 781 gttggaaagactgtggtaaagcg 803
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23 gttggaaagactgtggtaaagcg 1
>KJC_s16459
Length = 455
Score = 212 bits (107), Expect = 1e-54
Identities = 107/107 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 4 ctggcaacagtcgactcaatcttattgagagagcttccacctgtggaggatagcgatgct 63
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 330 ctggcaacagtcgactcaatcttattgagagagcttccacctgtggaggatagcgatgct 389
Query: 64 cggctagctctcaaaagactcatagacattagcatgggagttattac 110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 390 cggctagctctcaaaagactcatagacattagcatgggagttattac 436