Jatropha Genome Database
- JcCB0213661.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0213661.20 - phase: 2 /pseudo/partial
(1194 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02813 1376 0.0
KJC_c02558 442 e-124
>KJC_c02813
Length = 1479
Score = 1376 bits (694), Expect = 0.0
Identities = 930/1002 (92%), Gaps = 12/1002 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aaaattccctatcaagattatgttggagctgcattgaagcaatctatgaccatcaacatt 62
|||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct: 481 aaaagtccctgtgaagattatgttgaagctgcagtgaagcaagctatgaccatccacatt 540
Query: 63 accattgcaccaggcgatattctgatatttatgactggccaagacgaaatcgaagtggcc 122
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct: 541 accagtgcaccaggcgatattctgatatttatgactggccaagacgaaattgaagcggcc 600
Query: 123 tgttatgttcttgctgagcacatggaacaactcatctcttcctcaaagaaagcagtagct 182
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct: 601 tgttatgcccttgctgagcgcatggaacaactcatctcttcctcaaataaagcagtacct 660
Query: 183 aagctcttgatactgcctatatactcctaactaccagttgattggcaagcaaaaatattc 242
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||
Sbjct: 661 aagctcttgatactgcctatatacccc-aactaccagctgatttgcaagcaaaa-tattc 718
Query: 243 caaaaagcatacgatgagccccgaaaatgcattgttgccaccaacattgctgaaacatcg 302
||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 719 caaaaggcggaagatggtgcccgaaaatgcattgttgccaccaacattgctgaaacatcg 778
Query: 303 ttgacagttgatggaattttttatgtcattcacacagggtatg-taaaatgaaagtttac 361
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 779 ttgacagttgatggaattttttatgtcattgacacagggtatggtaaaatgaaagtttac 838
Query: 362 aatcataggatgggtatggatgctctccaagttttccctgttagccgcactgctgctgat 421
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 839 aatcctaggatgggtatggatgctctccaagtttttcctgttagccgcgctgctgctgat 898
Query: 422 cagtgtgctggacgtgctagtagaactgacctagctacatgttatatgctttatacagaa 481
||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 899 cagcgtgctggacgtgctggtagaactggccctggtacatgttataggctttatacagaa 958
Query: 482 agtgcttacctaaatgaaatggtgccaagtccagtgccagagatccagaggaccaacctt 541
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959 agtgcttacctaaatgaaatgctgccaagtccagtgccagagatccagaggaccaacctt 1018
Query: 542 ggtaatgtggttttgttgctcaagtctctcaaaattgataacttgctagattttgatttc 601
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 ggtaatgtggttttgctgctgaagtctctcaaaattgataacttgctagattttgatttc 1078
Query: 602 atggacccacctccacaggataacatcctcaattcaatgtatcagttgtgggtcttgagt 661
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct: 1079 atggacccacctccacaggataacatcctcaattcaatgtatcagttgtgggtcctgggt 1138
Query: 662 gcgcttaacaatgttggacgcctaactgatcttggctggaaaatggtggagtt-ccatca 720
|| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct: 1139 gcacttaacaatgttggaggtctaactgatcttggctggaaaatggtggagttcccatta 1198
Query: 721 gaccctccacttgctaagatgctgttgatgggagagcaactgggatgcataaatgaggtt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||
Sbjct: 1199 gaccctccacttgctaagatgctgttgatgggagaacagctgggatgtataaatgaggtt 1258
Query: 781 ttgacgattgtgtcaatgctttcagtgccatcagtgnnnnnnngccccaaagatagagca 840
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1259 ttgacgattgtgtcgatgctttcagtgccatcagtgttttttcgccccaaagatagagca 1318
Query: 841 gaggaaagtgatgctgcgagggagaaattttttgttcctgaatctgacc-----acttta 895
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 1319 gaggaaagtgatgctgcaagggagaaattttttgttcctgaatctgaccacttaactttg 1378
Query: 896 cttaatgtttacttgcaatggaaagagcaccagtatcgtggagattggtgtaatgatc-a 954
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1379 cttaatgtttacttgcaatggaaagagcaccagtatcg-ggagattggtgtaatgatcta 1437
Query: 955 ttttctgcatatcaaaggattacgg-aggctagagaagtcag 995
|||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 1438 ttttctgcatgtcaaaggnttacggaaggctagagaagtcag 1479
>KJC_c02558
Length = 609
Score = 442 bits (223), Expect = e-124
Identities = 253/259 (97%), Gaps = 3/259 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 937 agattggtgtaatgatcattttctgcatatcaaaggattacgga-ggctagagaagtcag 995
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 609 agattggtgtaatgatcattttctgcatgtcaaaggattacggaaggctagagaagtcag 550
Query: 996 atcccagctgctggatattctcaaaactttgaaaatcccattaacttcttgtgggcatga 1055
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 549 atcccagctgctggatattctcaaaactttgaaaatcccattaacttcttgtgg-catga 491
Query: 1056 ttgggatgtcataaggaaagcaatttgttctgcatatttccacaatgcagcaaggttaaa 1115
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 490 ttgggacgt-ataaggaaagcaatttgttctgcatatttccacaatgcagcaaggttaaa 432
Query: 1116 gggtgttggggaatatgtcaattgcaggaacggaatgccatgccatcttcacccgagtag 1175
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 431 gggtgttggggaatatgtcaattgcaggaatggaatgccatgccatcttcacccgagtag 372
Query: 1176 tgcgctgtatggcttaggt 1194
|||||||||||||||||||
Sbjct: 371 tgcgctgtatggcttaggt 353