Jatropha Genome Database
- JcCB0205901.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0205901.10 + phase: 0 /partial
(1922 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01027 2821 0.0
KJC_c01453 611 e-174
>KJC_c01027
Length = 2632
Score = 2821 bits (1423), Expect = 0.0
Identities = 1457/1463 (99%), Gaps = 4/1463 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 460 ccagcactttatgggtttacagaagctgatcttgatcgagaattctttttaggggtgtgg 519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2632 ccagcactttatgggtttacagaagctgatcttgatcgagaattctttttaggggtgtgg 2573
Query: 520 agaatgtctgggttcttatctgaaaaccgtccagtgcagacccttaggtccatattgact 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2572 agaatgtctgggttcttatctgaaaaccgtccagtgcagacccttaggtccatattgact 2513
Query: 580 cggcttgagcaggcttattgtgggagcattggctttgagtatatgcacattgcagatcgg 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2512 cggcttgagcaggcttattgtgggagcattggctttgagtatatgcacattgcagatcgg 2453
Query: 640 gataaatgtaactggttgagagacaagattgaaaccccaactcctatgcagtacaatcgt 699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2452 gataaatgtaactggttgagagacaagattgaaaccccaactcctatgcagtacaatcgt 2393
Query: 700 cagcgtcgtgaggttattcttgataggttgatatggagcacacaatttgagaacttcttg 759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2392 cagcgtcgtgaggttattcttgataggttgatatggagcacacaatttgagaacttcttg 2333
Query: 760 gctacaaagtggacaacagcaaagaggtttgggcttgaaggtggggaaactctgattcct 819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2332 gctacaaagtggacaacagcaaagaggtttgggcttgaaggtggggaaactctgattcct 2273
Query: 820 ggcatgaaggagatgtttgataggtctgcagatcttggagttgagagcatagttattgga 879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2272 ggcatgaaggagatgtttgataggtctgcagatcttggagttgagagcatagttattgga 2213
Query: 880 atgcctcatagaggaagattaaatgttcttggtaatgttgttcggaagcctctccgacaa 939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2212 atgcctcatagaggaagattaaatgttcttggtaatgttgttcggaagcctctccgacaa 2153
Query: 940 atatttagcgaatttagtggtggcacaaagcctgtagatgaagttggtctctacacagga 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2152 atatttagcgaatttagtggtggcacaaagcctgtagatgaagttggtctctacacagga 2093
Query: 1000 actggtgatgtcaagtatcacttgggaacttcttatgatcgtccaaccagaggtggaaag 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2092 actggtgatgtcaagtatcacttgggaacttcttatgatcgtccaaccagaggtggaaag 2033
Query: 1060 agaatccatttgtctttggttgcaaatcctagtcacttggaggctgtggatccagttgtt 1119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2032 agaatccatttgtctttggttgcaaatcctagtcacttggaggctgtggatccagttgtt 1973
Query: 1120 gttggaaagactagagctaagcaatattactcccaagatgcagacaggacaaaaaatatg 1179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1972 gttggaaagactagagctaagcaatattactcccaagatgcagacaggacaaaaaatat- 1914
Query: 1180 ggaattttgattcatggtgatggtagctttgcaggtcaaggtgtagtgtatgaaactctg 1239
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1913 ggaaatttgattcatggtgatggtagctttgcaggtcaaggtgtagtgtatgaaactctg 1854
Query: 1240 catcttagtgcactgccaaactacactactggtgggactatacacattgtggtgaataac 1299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1853 catcttagtgcactgccaaactacactactggtgggactatacacattgtggtgaataac 1794
Query: 1300 caagttgctttcacaactgatccaagggcaggcagatcttctcagtattgcactgatgtt 1359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1793 caagttgctttcacaactgatccaagggcaggcagatcttctcagtattgcactgatgtt 1734
Query: 1360 gcaaaggctttgaatgccccaattttccatgtaaatggagatgatgtggaggcagttgtt 1419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1733 gcaaaggctttgaatgccccaattttccatgtaaatggagatgatgtggaggcagttgtt 1674
Query: 1420 catgcctgtgagctggcagctgaatggcgccagactttccattcggatgttgtggttgat 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1673 catgcctgtgagctggcagctgaatggcgccagactttccattcggatgttgtggttgat 1614
Query: 1480 ttggtttgttatcgtcgatttgggcataatgagattgatgagccatctttcacacaaccc 1539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1613 ttggtttgttatcgtcgatttgggcataatgagattgatgagccatctttcacacaaacc 1554
Query: 1540 aaaatgtatcaggtcattcgaaaccatccctcagctctggaaatttaccaaaggaaactt 1599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1553 aaaatgtatcaggtcattcgaaaccatccctcagctctggaaatttaccaaaggaaac-t 1495
Query: 1600 ttagaatcaggccaggtgggtgacgaagatattaagaagatacagaagaaggtcattaca 1659
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1494 ttagaatcagg-caggtgggtgacgaagatattaagaagatacagaagaaggtcattaca 1436
Query: 1660 atccttaatgaagaattcttggctagcaaagattatgtccctaaaagaagagattggctt 1719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1435 atccttaatgaagaattcttggctagcaaagattatgtccctaaaagaagagattggctt 1376
Query: 1720 tcatctcattgggctgggtttaagtctcctgagcagctgtcacgtgtccgcaacactggg 1779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1375 tcatctcattgggctgggtttaagtctcctgagcagctgtcacgtgtccgcaacactggg 1316
Query: 1780 gtgaaacctgagatcttgaagaatgttggcaaagcaatcacaactcttccagagaatttc 1839
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1315 gtgaaacctgagatc-tgaagaatgttggcaaagcaatcacaactcttccagagaatttc 1257
Query: 1840 aagcctcacagagctgtaaaaaaggtttatgaacatcgtgcacaaatgattgaaacaggg 1899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1256 aagcctcacagagctgtaaaaaaggtttatgaacatcgtgcacaaatgattgaaacaggg 1197
Query: 1900 gaaggaattgactgggcagttgc 1922
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1196 gaaggaattgactgggcagttgc 1174
>KJC_c01453
Length = 558
Score = 611 bits (308), Expect = e-174
Identities = 358/371 (96%), Gaps = 4/371 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgtggtttagagcaggcactaacgttgcaaggcttgccattaagaggactctatgt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 190 atggcgtggtttagagcaggcactaacgttgcaaggcttgccattaagaggactctatgt 249
Query: 61 cagagtgggtcgtacacaactagagtacggttcattccatctcagagtcgatatttccat 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 250 cagagtgggtcgtacacaactagagtacggttcattccatctcagagtcgatatttccat 309
Query: 121 accactgtctttaagtccaaggcgcaaactgcaccagtcccacgacctgttcctctttcc 180
||||||||||||||||||||||| || | | || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 310 accactgtctttaagtccaaggcacacaggggactagtcccacgacctgttcctctttcc 369
Query: 181 aggctaactgatagcttcttagatggaaccagcagtgtttacttggaggagctacagaga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 370 aggctaactgatagcttcttagatggaaccagcagtg-ttacttggaggagctacagaga 428
Query: 241 gcttgggaagctgacccaaatagtgtggatgagtcatgggacaatttctttagaaacttt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429 gcttgggaagctgacccaaatagtgtggatgagtcatgggacaatttctttagaaacttt 488
Query: 301 gtgggtcaggcagcaacatcccct--ggaatttcaggccagacaattcaggagagtatgc 358
|| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489 gt-ggtcaggcagcaacactccctaggtaatttcaggccagacaattcaggagagtatgc 547
Query: 359 gtttactgttg 369
|||||||||||
Sbjct: 548 gtttactgttg 558