Jatropha Genome Database
- JcCB0196521.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0196521.10 + phase: 0 /partial
(1152 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03604 2248 0.0
KJC_c09731 56 2e-07
>KJC_c03604
Length = 1297
Score = 2248 bits (1134), Expect = 0.0
Identities = 1141/1142 (99%), Gaps = 1/1142 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 11 caagtcctacaaatctgcataactgcagcaaccagctggagtttcaaaatcagaaccagg 70
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1195 caagtcctacaaatctgcataactgcagcaaccagctggagtttcaaaatcagaaccagg 1136
Query: 71 ctcacttgcatgctcaaaccaatgtctggccaatgcagcaactgttagagccttccactc 130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1135 ctcacttgcatgctcaaaccaatgtctggccaatgcagcaactgttagagccttccactc 1076
Query: 131 tgcactctcagcaaattaatataccccaagctgattctaatgttctcaatggatcacttc 190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1075 tgcactctcagcaaattaatataccccaagctgattctaatgttctcaatggatcacttc 1016
Query: 191 ctttcttagacactgatgagtggatatcaaatccgtcttcttgcatacctctccctggga 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1015 ctttcttagacactgatgagtggatatcaaatccgtcttcttgcatacctctccctggga 956
Query: 251 tatatggatcatcagggcctctgtcaatgtttggattgcaagaacaatcatccatactcc 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 955 tatatggatcatcagggcctctgtcaatgtttggattgcaagaacaatcatccatactcc 896
Query: 311 ctgaagcaattaatccttctttacctttaatgaatcaggatttgtgggatcaacagctaa 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 895 ctgaagcaattaatccttctttacctttaatgaatcaggatttgtgggatcaacagctaa 836
Query: 371 acaatttaagatttttatccccaccaagccaactcgttcctttagctcagcaagacctct 430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 835 acaatttaagatttttatccccaccaagccaactcgttcctttagctcagcaagacctct 776
Query: 431 gtagccttaactcaagtggtgcaaaagatttgtcagatgagagcaatgatcaaagtggga 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 775 gtagccttaactcaagtggtgcaaaagatttgtcagatgagagcaatgatcaaagtggga 716
Query: 491 tatatggctctcttagtgttgatgttgggaatgggggaagtgccgtaattgatccttctg 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 715 tatatggctctcttagtgttgatgttgggaatgggggaagtgccgtaattgatccttctg 656
Query: 551 tctctaatactcttttggatgagttgtgcacgtcgaaggatgctgatttccaaaaccctt 610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 655 tctctaatactcttttggatgagttgtgcacgtcgaaggatgctgatttccaaaaccctt 596
Query: 611 cagattgtttggtcggtaacttgagctcaagccaggatgttcagtcacagattacttcag 670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595 cagattgtttggtcggtaacttgagctcaagccaggatgttcagtcacagattacttcag 536
Query: 671 caagcttagcagattcccaagctttctcacagcaagactttccagacagctcaggtggta 730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 caagcttagcagattcccaagctttctcacagcaagactttccagacagctcaggtggta 476
Query: 731 catcttcaagcaatgtggatattgacaagggcaattatatgcagaataactcatggcagc 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 catcttcaagcaatgtggatattgacaagggcaattatatgcagaataactcatggcagc 416
Query: 791 aagttgctccacgggtgcggacatacacaaaggttcaaaaggctggctcagtggggaggt 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 415 aagttgctccacgggtgcggacatacacaaaggttcaaaaggctggctcagtgggga-gt 357
Query: 851 cgatcgatgtctcaagttttagaaactacgaagaactatgttctgcaatcgaatgcatgt 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 356 cgatcgatgtctcaagttttagaaactacgaagaactatgttctgcaatcgaatgcatgt 297
Query: 911 ttggacttgaagggttgcttaataatccaagggagtcaggttggaagctggtgtatgtgg 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 296 ttggacttgaagggttgcttaataatccaagggagtcaggttggaagctggtgtatgtgg 237
Query: 971 actatgagaatgatgttctattgattggagatgatccatgggaggagtttgttggttgtg 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 236 actatgagaatgatgttctattgattggagatgatccatgggaggagtttgttggttgtg 177
Query: 1031 tccgctgcataaggatcctgtcaccttctgaagttcagcagatgagtgaggagggaatga 1090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 176 tccgctgcataaggatcctgtcaccttctgaagttcagcagatgagtgaggagggaatga 117
Query: 1091 agctccttaacaatgccaatatcaacggcctgaatacctccgtaacagaaggcagccatg 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 116 agctccttaacaatgccaatatcaacggcctgaatacctccgtaacagaaggcagccatg 57
Query: 1151 ct 1152
||
Sbjct: 56 ct 55
>KJC_c09731
Length = 506
Score = 56.0 bits (28), Expect = 2e-07
Identities = 49/56 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 806 tgcggacatacacaaaggttcaaaaggctggctcagtggggaggtcgatcgatgtc 861
|||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct: 408 tgcgaacatatacaaaggttcaaaagcgtggctcagtgggcaggtctattgatgtc 463