Jatropha Genome Database
- JcCB0186801.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0186801.10 + phase: 2 /pseudo/partial
(1046 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01351 1407 0.0
KJC_c05343 583 e-166
>KJC_c01351
Length = 779
Score = 1407 bits (710), Expect = 0.0
Identities = 717/718 (99%), Gaps = 1/718 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggaggatgagaatggccttgagcttagccttggtctaggttgtggaggatcatctgca 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 717 atggaggatgagaatggccttgagcttagccttggtctaggttgtggaggatcatctgca 658
Query: 61 aaatccaagggtaaaaatggatcctcttcggatatgaggttggacgaaggtgatagaggc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 657 aaatccaagggtaaaaatggatcctcttcggatatgaggttggacgaaggtgatagaggc 598
Query: 121 aacaagaaggtagatgatttcaaaaaacttgcttcatgcttcttcccagaagcaggattc 180
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 597 aacaagaaggtagatgatttcaaaaa-cttgcttcatgcttcttcccagaagcaggattc 539
Query: 181 aagtctcgggtctcaaataagtgattcagtgaaacctcaagagaacttctttaatgactt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 538 aagtctcgggtctcaaataagtgattcagtgaaacctcaagagaacttctttaatgactt 479
Query: 241 gtccaaagcaaatatagatgcagatgcttctgtaaatttgaaaaataggggactgtgggt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 478 gtccaaagcaaatatagatgcagatgcttctgtaaatttgaaaaataggggactgtgggt 419
Query: 301 ttcaggcagcaacagacctgctgaaattgaagaagaaaagaggccagaggctggtaacaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 418 ttcaggcagcaacagacctgctgaaattgaagaagaaaagaggccagaggctggtaacaa 359
Query: 361 acgtaaaatgttgtttgatgatataaataatcagaagaagcaagagagagatgctcatca 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 358 acgtaaaatgttgtttgatgatataaataatcagaagaagcaagagagagatgctcatca 299
Query: 421 ttctgatgtacatgacaaaaaagcttcacatatttccataacaacagaagatggctctac 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 298 ttctgatgtacatgacaaaaaagcttcacatatttccataacaacagaagatggctctac 239
Query: 481 tgctgaaaatgaggatgtggcagagtctgaagtagagggttcaacatcacggttgctctc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 238 tgctgaaaatgaggatgtggcagagtctgaagtagagggttcaacatcacggttgctctc 179
Query: 541 tcatcatgatgttggctccaagcgttttattggagttggtgctccttccgaggttccaaa 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 178 tcatcatgatgttggctccaagcgttttattggagttggtgctccttccgaggttccaaa 119
Query: 601 ggaggtccgcgggttttcagattctggtgtcattgacttacaagggcaaaaaaggcctaa 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 118 ggaggtccgcgggttttcagattctggtgtcattgacttacaagggcaaaaaaggcctaa 59
Query: 661 tggttcatcagaaactgaaattaagcatgggaacttgaattatggagttccattttct 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 58 tggttcatcagaaactgaaattaagcatgggaacttgaattatggagttccattttct 1
>KJC_c05343
Length = 505
Score = 583 bits (294), Expect = e-166
Identities = 294/294 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 753 cgtttcctatcaaagaatctaactgtattggtattcccaacacttcaggcccgcctttat 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 505 cgtttcctatcaaagaatctaactgtattggtattcccaacacttcaggcccgcctttat 446
Query: 813 cgggaatgatgcaggtggtgcctacttcaaatggtgagcatcaaacaggcacccagtctg 872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 445 cgggaatgatgcaggtggtgcctacttcaaatggtgagcatcaaacaggcacccagtctg 386
Query: 873 caagtcctggaaatttgccagtaacatttggctattcacctgtccagcttccaacattgg 932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 385 caagtcctggaaatttgccagtaacatttggctattcacctgtccagcttccaacattgg 326
Query: 933 ataaggataattcatggagcttggtctctcatcttcaacagttccacccttcctatgctg 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 325 ataaggataattcatggagcttggtctctcatcttcaacagttccacccttcctatgctg 266
Query: 993 gtagaggtccatcaaactcagataagccaaatgaaggattgaagactgttccag 1046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 265 gtagaggtccatcaaactcagataagccaaatgaaggattgaagactgttccag 212