Jatropha Genome Database
- JcCB0182811.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0182811.10 - phase: 0 /partial
(1395 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c09671 1253 0.0
>KJC_c09671
Length = 693
Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0
Identities = 686/695 (98%), Gaps = 8/695 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 648 gatttgtgattccaagcaattgaaaaa-gttgg--ctccaataag-ctcaa-gactaaca 702
||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 693 gatttgtgattccaagcaattgaaaaaagttaggactccaataagactcaaagactaaca 634
Query: 703 actatcaataatgtgatttactttgaagatgatgaaagtgcaactgcaattgatcctagc 762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 633 actatcaataatgtgatttactttgaagatgatgaaagtgcaactgcaattgatcctagc 574
Query: 763 atatctggaagtatgatgcactggacggtttcatctttttctaaagttgagaaactgggc 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 573 atatctggaagtatgatgcactggacggtttcatctttttctaaagttgagaaactgggc 514
Query: 823 aaagacaatcccctccctccaa-gcatgccttccaaaaatggagttgctgttatcatgta 881
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 513 aaagacaatcccctccctccaacgcatgccttccaaaaatggagttgctgttatcatgta 454
Query: 882 tacaagtggcagcacaggcctaccaaagggagtcatgattactcatggcaacattatagc 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 453 tacaagtggcagcacaggcctaccaaagggagtcatgattactcatggcaacattatagc 394
Query: 942 cactgctgcagctgtcatgacagtgatcccaaaattgggtaccaatgatgtttatatggc 1001
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 393 cactgctgcagctgtcatgacagtgatcccaaa-ttgggtaccaatgatgtttatatggc 335
Query: 1002 atacttgcccctagcacatgttcttgaactggctgctgagtctataatgttaactgcagg 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334 atacttgcccctagcacatgttcttgaactggctgctgagtctataatgttaactgcagg 275
Query: 1062 gtgtgcaattggctatggttctgcattgactttaacagacacatctaataaaattaagaa 1121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 274 gtgtgcaattggctatggttctgcattgactttaacagacacatctaataaaattaagaa 215
Query: 1122 aggaaccaaaggtgatgctactgtgttaaagcccactctcatggctgcagttccagcgat 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 214 aggaaccaaaggtgatgctactgtgttaaagcccactctcatggctgcagttccagcgat 155
Query: 1182 actagatcgtgttagagatggagttctgaaaaaggttgaggagaaaggagggcttgcaaa 1241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 154 actagatcgtgttagagatggagttctgaaaaaggttgaggag-aaggagggcttgcaaa 96
Query: 1242 aaagcttttcaaccttgcttataagcgacgattggcagccatagaaggaagctggtttgg 1301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 95 aaagcttttcaaccttgcttataagcgacgattggcagccatagaaggaagctggtttgg 36
Query: 1302 tgcttggggactggaaagaatgatgtgggatgtta 1336
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 35 tgcttggggactggaaagaatgatgtgggatgtta 1