Jatropha Genome Database
- JcCB0148401.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0148401.10 - phase: 0 /pseudo
(1348 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02976 2167 0.0
>KJC_c02976
Length = 1493
Score = 2167 bits (1093), Expect = 0.0
Identities = 1157/1168 (99%), Gaps = 9/1168 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 185 ataagaggcatggtctcacaatcacagctgttatgacagatgacaacacaacaatgacaa 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1493 ataagaggcatggtctcacaatcacagctgttatgacagatgacaacacaacaatgacaa 1434
Query: 245 atgagaaagaaatggaagatattcatctttt-gagcattgatcctgggtt--gggaccat 301
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct: 1433 atgagaaagaaatggaagatattcatctttttgagcattgatcctggggttggggaccat 1374
Query: 302 ttaaagaccacttcagttatagaatgaaaagatacagaaatcagaaagagcaaattgaaa 361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1373 ttaaagaccacttcagttatagaatgaaaagatacagaaatcagaaagagcaaattgaaa 1314
Query: 362 aacacgaaggaggtcttgacgaattttccagaggttacctgaaatttggatttaatagag 421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1313 aacacgaaggaggtcttgacgaattttccagaggttacctgaaatttggatttaatagag 1254
Query: 422 aagaaggtggcattgtctatcgtgagtgggcccctgcagctgaggaagctcaagtcattg 481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1253 aagaaggtggcattgtctatcgtgagtgggcccctgcagctgaggaagctcaagtcattg 1194
Query: 482 gcgactttaatggatgggatggttccaaccacaaaatggaaaagaatgaatttggagttt 541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1193 gcgactttaatggatgggatggttccaaccacaaaatggaaaaga-tgaatttggagttt 1135
Query: 542 ggagtatcaaaataactgatgctgctggaaatccagcaattcctcacaattcaagggtca 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1134 ggagtatcaaaataactgatgctgctggaaatccagcaattcctcacaattcaagggtca 1075
Query: 602 agtttcgattcaagcatggtaatggaatttgggttgatcgaattccagcttggattagat 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1074 agtttcgattcaagcatggtaatggaatttgggtt-atcgaattccagcttggattagat 1016
Query: 662 atgccactgtggacccttcaaatttcggtgcaccatatgatggtgtctactgggatcctc 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1015 atgccactgtggacccttcaaatttcggtgcaccatatgatggtgtctactgggatcctc 956
Query: 722 cagcttcagaaaggtatcaatttgagtaccctcggcctccaaaaccca-gggccccacgt 780
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 955 cagcttcagaaaggtatcaatttgagtaccctcggcctccaaaacccacgggccccacgt 896
Query: 781 atatacgaggctcatgtgggaatgagcagctcagaacctcgtgttaatacatacagagaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 895 atatacgaggctcatgtgggaatgagcagctcagaacctcgtgttaatacatacagagaa 836
Query: 841 tttgctgatgatgttttgcctcgcatacgggccaataactataacacagttcagttaatg 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 835 tttgctgatgatgttttgcctcgcatacgggccaataactataacacagttcagttaatg 776
Query: 901 gctgtgatggagcattcctattatggatcatttgggtaccatgttactaacttttttgct 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 775 gctgtgatggagcattcctattatggatcatttgggtaccatgttactaacttttttgct 716
Query: 961 gtaagcagtagatctggaacccctgaggatcttaagtatttaattgataaagctcatagc 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 715 gtaagcagtagatctggaacccctgaggatcttaagtatttaattgataaagctcatagc 656
Query: 1021 ttgggtttatgtgttctgatggatgttattcacagccatgcaagtaacaatgtcactgat 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 655 ttgggtttatgtgttctgatggatgttattcacagccatgcaagtaacaatgtcactgat 596
Query: 1081 ggccttaatggctttgatgttggccaaagctctcaagaatcctatttccacactggagat 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595 ggccttaatggctttgatgttggccaaagctctcaagaatcctatttccacactggagat 536
Query: 1141 agaggctaccataagttatgggacagcaggctctttaattatgctaattgggaagttctt 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 agaggctaccataagttatgggacagcaggctctttaattatgctaattgggaagttctt 476
Query: 1201 cgcttcctgctgtcgaacctgagatggtggcttgaggagtacaaattcgatggctttcgg 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 cgcttcctgctgtcgaacctgagatggtggcttgaggagtacaaattcgatggctttcgg 416
Query: 1261 tttgatggagtaacttcaatgctgtaccatcaccatggaatcgacatggcatttacgggg 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 415 tttgatggagtaacttcaatgctgtaccatcaccatggaatcgacatggcatttactggg 356
Query: 1321 taattagtaacgtagtatttcagtgaag 1348
||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct: 355 -aatta-taacg-agtatttcagtgaag 331