Jatropha Genome Database
- JcCB0140211.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0140211.10 - phase: 2 /partial
(1264 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01034 2319 0.0
KJC_s13828 743 0.0
>KJC_c01034
Length = 1543
Score = 2319 bits (1170), Expect = 0.0
Identities = 1177/1178 (99%), Gaps = 1/1178 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 87 gagaacaaccagtacccacaaaacgcaacggccgtgatttcccctctgacgacggtgatt 146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39 gagaacaaccagtacccacaaaacgcaacggccgtgatttcccctctgacgacggtgatt 98
Query: 147 accaatcaggattcggcaacagctttgagtcagaggctatttctggtgctcttcctcgtg 206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 99 accaatcaggattcggcaacagctttgagtcagaggctatttctggtgctcttcctcgtg 158
Query: 207 gccaaaacagcccgcttttatgtccttacggtctttatgcagaacagctctctggttcat 266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 159 gccaaaacagcccgcttttatgtccttacggtctttatgcagaacagctctctggttcat 218
Query: 267 cttttacttctccccgcaagctgaatcaacgcagttggttttatcgaataaaaccatcag 326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 219 cttttacttctccccgcaagctgaatcaacgcagttggttttatcgaataaaaccatcag 278
Query: 327 ttactcatgaaccctttaagcctcggattccaagtaacgaaaagctagcgagcgaatttg 386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 279 ttactcatgaaccctttaagcctcggattccaagtaacgaaaagctagcgagcgaatttg 338
Query: 387 ataagacaaatagtcgtacaacacctactcagctgcggtggaagccgatggaaattcctg 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 339 ataagacaaatagtcgtacaacacctactcagctgcggtggaagccgatggaaattcctg 398
Query: 447 attccccaactgattttgttgatgggttgtatacagtttgtggggctggtagttcctttc 506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 399 attccccaactgattttgttgatgggttgtatacagtttgtggggctggtagttcctttc 458
Query: 507 ttcgccatggatttgctattcacatgtacaccgcaaacaaatcaatggacaactgtgctt 566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 459 ttcgccatggatttgctattcacatgtacaccgcaaacaaatcaatggacaactgtgctt 518
Query: 567 tctgtaatgcggatggtgactttttgatagttcctcagaaaggaaggctgtggattacta 626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 519 tctgtaatgcggatggtgactttttgatagttcctcagaaaggaaggctgtggattacta 578
Query: 627 ctgaatgtggaaagctgcaagtcacccccggtgaaatagttgttttacctcaagggttcc 686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 579 ctgaatgtggaaagctgcaagtcacccccggtgaaatagttgttttacctcaagggttcc 638
Query: 687 gttttgctgtagatttgccagacggcccatctcgtggttatgcttgtgagatatttggta 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 639 gttttgctgtagatttgccagacggcccatctcgtggttatgcttgtgagatatttggta 698
Query: 747 cccattttcagcttcctgatcttgggccaataggtggtaatggtcttgctgctccaaggg 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 699 cccattttcagcttcctgatcttgggccaataggtggtaatggtcttgctgctccaaggg 758
Query: 807 atttccttgttcccaaggcctggtttgaggaggcttctcgtccagggtataccatcatac 866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 759 atttccttgttcccaaggcctggtttgaggaggcttctcgtccagggtataccatcatac 818
Query: 867 aaaagtttggtggtgaactatttactgcaaagcaagatttttctcccttcaatgttgtag 926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 819 aaaagtttggtggtgaactatttactgcaaagcaagatttttctcccttcaatgttgtag 878
Query: 927 cctggcatggtaattatgttccatacaagtatgatctcaaaaagttttgcccttataata 986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 879 cctggcatggtaattatgttccatacaagtatgatctcaaaaagttttgcccttataata 938
Query: 987 ctgttttgtttgatcacagtgacccatcaataaatacagttttgacagcaccaactgaca 1046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 939 ctgttttgtttgatcacagtgacccatcaataaatacagttttgacagcaccaactgaca 998
Query: 1047 agcctggagtggcattacttgattttgtcattttcccttcccgatgggtagttgcagagc 1106
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 999 agcctggagtggcattacttgattttgtca-tttcccttcccgatgggtagttgcagagc 1057
Query: 1107 atacttttcgacctccatattaccatcgaaattgtatgagcgaatttatgggcctgattt 1166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1058 atacttttcgacctccatattaccatcgaaattgtatgagcgaatttatgggcctgattt 1117
Query: 1167 atggtggatatgaggcaaaagctgacgggttcataccaggtgctgcaagtcttcacagct 1226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1118 atggtggatatgaggcaaaagctgacgggttcataccaggtgctgcaagtcttcacagct 1177
Query: 1227 gcatgactccacatggtccagataccaagacatacgag 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1178 gcatgactccacatggtccagataccaagacatacgag 1215
>KJC_s13828
Length = 460
Score = 743 bits (375), Expect = 0.0
Identities = 458/472 (97%), Gaps = 14/472 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 379 cgaatttgataagacaaatagtcgtacaacacctactcagctgcggtggaagccgatgga 438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||
Sbjct: 460 cgaatttgataagacaaatagtcgtacaacacctactcagctgcg-tg--agc-gatg-- 407
Query: 439 aattcctgattccccaactgattttgttgatgggttgtatacagtttgtggggctggtag 498
||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 406 aat--ctgattccc-aactgattt-gttgatgggt-gtatacagtttgtggggctggtag 352
Query: 499 ttcctttcttcgccatggatttgctattcacatgtaca-ccgcaaacaaatcaatggaca 557
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 351 ttcctttct-cgccatggatttgctattcacatgtacaaccgcaaacaaatcaatggaca 293
Query: 558 actgtgctttctgtaatgcggatggtgacttttt-gatagttcctcagaaaggaaggctg 616
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 292 actgtgctttctgtaatgcggatggtgacttttttgatagttcctcagaaaggaaggctg 233
Query: 617 tggattactactgaatgtggaaagctgcaagtcacccccggtgaaatagttgttttacct 676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 232 tggattactactgaatgtggaaagctgcaagtcacccccggtgaaatagttgttttacct 173
Query: 677 caagggttccgttttgctgtagatttgccagacggcccatctcgtggttatgcttgtgag 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 172 caagggttccgttttgctgtagatttgccagacggcccatctcgtggttatgcttgtgag 113
Query: 737 atatttggtacccattttcagcttcctgatcttgggccaataggtggtaatggtcttgct 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 112 atatttggtacccattttcagcttcctgatcttgggccaataggtggtaatggtcttgct 53
Query: 797 gctccaagggatttccttgttcccaaggcctggtttgaggaggcttctcgtc 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52 gctccaagggatttccttgttcccaaggcctggtttgaggaggcttctcgtc 1