Jatropha Genome Database
- JcCB0130221.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0130221.10 - phase: 2 /partial
(1126 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c04160 1011 0.0
KJC_c01917 856 0.0
KJC_c08135 117 6e-26
KJC_c03453 96 2e-19
KJC_c09995 54 8e-07
>KJC_c04160
Length = 532
Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0
Identities = 531/534 (99%), Gaps = 3/534 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 589 gattgctgagactggggactcatggtttaactgccagaagctgaaattgccaaagggatg 648
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 532 gattgctgagactggg-actcatggtttaactgccagaagctgaaattgccaa-gggatg 475
Query: 649 cgggtatgagttccaaatgcaatatggatcaattggatggtcagtcggtgcaactcttgg 708
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 474 cgg-tatgagttccaaatgcaatatggatcaattggatggtcagtcggtgcaactcttgg 416
Query: 709 gtatgctcaggctgtgccagagaagcgtgtgattgcttgtattggtgatggtagctttca 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 gtatgctcaggctgtgccagagaagcgtgtgattgcttgtattggtgatggtagctttca 356
Query: 769 ggtgactgctcaagatatttcaacaatgctgcgatgtggacagaggactatcatcttctt 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 ggtgactgctcaagatatttcaacaatgctgcgatgtggacagaggactatcatcttctt 296
Query: 829 gatcaacaatggtggatacaccattgaggttgagatccatgatggcccatacaatgtgat 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 295 gatcaacaatggtggatacaccattgaggttgagatccatgatggcccatacaatgtgat 236
Query: 889 caagaactggaactacactggcttgattgatgcaatccacaatggtgaaggcaaatgctg 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 235 caagaactggaactacactggcttgattgatgcaatccacaatggtgaaggcaaatgctg 176
Query: 949 gacaactaaggttctatgtgaggaagaactcatagaagcaattgagactgcaacagggtc 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 175 gacaactaaggttctatgtgaggaagaactcatagaagcaattgagactgcaacagggtc 116
Query: 1009 gaagaaagattgcttgtgcttcattgaagtcgttgttcacaaggatgatactagcaaaga 1068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 115 gaagaaagattgcttgtgcttcattgaagtcgttgttcacaaggatgatactagcaaaga 56
Query: 1069 actcttggagtggggctccagggtctccgctgccaatagccgaccaccaaaccc 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 55 actcttggagtggggctccagggtctccgctgccaatagccgaccaccaaaccc 2
>KJC_c01917
Length = 1155
Score = 856 bits (432), Expect = 0.0
Identities = 439/440 (99%), Gaps = 1/440 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 attgagtaataaattgggtttggaggctgcagttgaagcagcagcagagttcttgaacaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 716 attgagtaataaattgggtttggaggctgcagttgaagcagcagcagagttcttgaacaa 775
Query: 61 ggctgtgaaaccagttttggtgggtgggcctaaattgagggttgcaaaggcaactgaggc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 776 ggctgtgaaaccagttttggtgggtgggcctaaattgagggttgcaaaggcaactgaggc 835
Query: 121 ctttgtggaattagctgatgcttctggttatgccctggctgttatgccatcagctaaagg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 836 ctttgtggaattagctgatgcttctggttatgccctggctgttatgccatcagctaaagg 895
Query: 181 gtttgtgccggagcaccatccccacttcattgggactt-attggggtgctgtgagcactg 239
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 896 gtttgtgccggagcaccatccccacttcattgggactttattggggtgctgtgagcactg 955
Query: 240 ctttctgtgctgagatcgtggaatctgctgatgcttacttgtttgctggacctattttta 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 956 ctttctgtgctgagatcgtggaatctgctgatgcttacttgtttgctggacctattttta 1015
Query: 300 atgactatagctctgttggatactctctccttctcaagaaagagaaggcaatcattgtgc 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1016 atgactatagctctgttggatactctctccttctcaagaaagagaaggcaatcattgtgc 1075
Query: 360 agcctgaccgtgtggtgattggaaatggacctgcatttggatgtgttctaatgaaggact 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1076 agcctgaccgtgtggtgattggaaatggacctgcatttggatgtgttctaatgaaggact 1135
Query: 420 ttctcaaagcccttgcaaag 439
||||||||||||||||||||
Sbjct: 1136 ttctcaaagcccttgcaaag 1155
>KJC_c08135
Length = 379
Score = 117 bits (59), Expect = 6e-26
Identities = 128/149 (85%), Gaps = 4/149 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 650 gggtatgagttccaaatgcaatatggatcaattggatggtcagtcggtgcaactcttggg 709
|||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 164 gggtatgaattccagatgcagtatggatctattggctggtcagttggtgctactcttgga 105
Query: 710 tatgctcaggctgtgccaga--gaagcgtgtgattgcttgtattggtgatggtagctttc 767
||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |
Sbjct: 104 tatgctcaggc--agccagaacgaagcgcgtgattgcttgcattggtgatggaagtttcc 47
Query: 768 aggtgactgctcaagatatttcaacaatg 796
|||| || ||||| |||||||||||||||
Sbjct: 46 aggttacggctcaggatatttcaacaatg 18
>KJC_c03453
Length = 980
Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-19
Identities = 140/168 (83%), Gaps = 2/168 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 158 gctgttatgccatcagctaaagggtttgtgccggagcaccatccccacttcattgggact 217
||||||||||| || | ||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct: 332 gctgttatgccctctggtaaagggctagtgccagagcatcatccacacttcattgggact 391
Query: 218 tattggggtgctgtgagcac-tgctttctgtgctgagatcgtggaatctgctgatgctta 276
|| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct: 392 tactggggtgctgttagcacaagcttt-tgtggggagatagtggagtctgctgatgccta 450
Query: 277 cttgtttgctggacctatttttaatgactatagctctgttggatactc 324
| ||| ||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct: 451 tatttttattggtcctatattcaatgactacagctctgtcggatactc 498
Score = 87.7 bits (44), Expect = 5e-17
Identities = 98/114 (85%), Gaps = 4/114 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 650 gggtatgagttccaaatgcaatatggatcaattggatggtcagtcggtgcaactcttggg 709
|||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 824 gggtatgaactccagatgcagtatggatctattggctggtcagttggtgctactcttgga 883
Query: 710 tatgctcaggctgtgccaga--gaagcgtgtgattgcttgtattggtgatggta 761
||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 884 tatgctcaggc--agccagaacgaagcgcgtgattgcttgcattggtgatggta 935
>KJC_c09995
Length = 339
Score = 54.0 bits (27), Expect = 8e-07
Identities = 33/35 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 918 atgcaatccacaatggtgaaggcaaatgctggaca 952
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 322 atgcaatccataatgatgaaggcaaatgctggaca 288