Jatropha Genome Database
- JcCB0097801.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0097801.10 + phase: 0
(1017 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c11812 1354 0.0
>KJC_c11812
Length = 890
Score = 1354 bits (683), Expect = 0.0
Identities = 704/712 (98%), Gaps = 1/712 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 277 atcactttctcattaactaatggaccagaatatcacatctcacagattgctgatgcagtg 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atcactttctcattaactaatggaccagaatatcacatctcacagattgctgatgcagtg 60
Query: 337 gtggtagcaagatatgtaggagcaactcttgtactacctgacattagaggaaccaagcca 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gtggtagcaagatatgtaggagcaactcttgtactacctgacattagaggaaccaagcca 120
Query: 397 ggtgatgaaaggaagtttgaagaaatatatgatgtggataaatttgtgacaagcctggat 456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggtgatgaaaggaagtttgaagaaatatatgatgtggataaatttgtgacaagcctggat 180
Query: 457 ggagtagttaaagtggcaaaggatctacctgatgatgtatcaattcgagattttgctgtt 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ggagtagttaaagtggcaaaggatctacctgatgatgtatcaattcgagattttgctgtt 240
Query: 517 gtcaagatccctaatcgtgtttcagaagatcacattgcagaatcaattgaccctatcttt 576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gtcaagatccctaatcgtgtttcagaagatcacattgcagaatcaattgaccctatcttt 300
Query: 577 agaacaaagggaaacataagattggctacttactttccctcagtaaacatgagaaagacc 636
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 agaacaaagggaaacataagattggctacttacttt-cctcagtaaacatgagaaagacc 359
Query: 637 acacaaaagagtaacagtgattcagttgcatgtttggcaatgtttggaactctggagttg 696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 acacaaaagagtaacagtgattcagttgcatgtttggcaatgtttggaactctggagttg 419
Query: 697 cagccagaagttaatgaagtggttgactctatgattgagcggttgagaactttgagccgc 756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 cagccagaagttaatgaagtggttgactctatgattgagcggttgagaactttgagccgc 479
Query: 757 aagtccgatggacggtttattgccgtggacttgagagttgatatattggnnnnnnngagt 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 480 aagtccgatggacggtttattgccgtggacttgagagttgatatattggaaaaaaagagt 539
Query: 817 tgccacggtagtgatgctggtgcagccaaaaattgttatagtgctcaggaaattgccttg 876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 tgccacggtagtgatgctggtgcagccaaaaattgttatagtgctcaggaaattgccttg 599
Query: 877 tttttaagaaagattggatttgataaggacaccacaatctacttaactcagtccagatgg 936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 tttttaagaaagattggatttgataaggacaccacaatctacttaactcagtccagatgg 659
Query: 937 gatgaaagccttgatgttcttaaggacatatttccaaaaacttatacaaagg 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 gatgaaagccttgatgttcttaaggacatatttccaaaaacttatacaaagg 711