Jatropha Genome Database
- JcCB0097471.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0097471.10 + phase: 0
(1536 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02131 2952 0.0
>KJC_c02131
Length = 1815
Score = 2952 bits (1489), Expect = 0.0
Identities = 1531/1537 (99%), Gaps = 6/1537 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggagctcaaaaataattatgccttccccaatctttcaaagcccc-aaagacccaaatc 59
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 1795 atggagctcaaaa-taattatgccttccccaatctttcaaagcccccaaagacccaaatc 1737
Query: 60 tctaccttcagtttcatttaaatcacagtttcacgggtctccgatttctcggggtttaat 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1736 tctaccttcagtttcatttaaatcacagtttcacgggtctccgatttctcggggtttaat 1677
Query: 120 ccagtgtcagagaaggggtgactgtacagttaggatgggttctattcgagtttcagcttc 179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
Sbjct: 1676 ccagtgtcagagaaggggtgactgtacagttaggatgggt-ctattcgagtt-cagct-c 1620
Query: 180 agtcgccacagcggagaagccgtcaacggtaccagagatagtattgcaacccattaaaga 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1619 agtcgccacagcggagaagccgtcaacggtaccagagatagtattgcaacccattaaaga 1560
Query: 240 aatctccggtacggtcaagttgccgggttccaagtcactgtccaatcggattctcctcct 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1559 aatctccggtacggtcaagttgccgggttccaagtcactgtccaatcggattctcctcct 1500
Query: 300 cgctgcgctctctgaggggacaactgttgttgataacttattgaatagtgatgatgttcg 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1499 cgctgcgctctctgaggggacaactgttgttgataacttattgaatagtgatgatgttcg 1440
Query: 360 ttacatgcttggtgcattgagaacgcttggactacatgtagaggacaatagtgaacttaa 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1439 ttacatgcttggtgcattgagaacgcttggactacatgtagaggacaatagtgaacttaa 1380
Query: 420 acaagccattgtaggaggttgtggtggttattttccagtgggtaaagaatcaaaggatga 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1379 acaagccattgtaggaggttgtggtggttattttccagtgggtaaagaatcaaaggatga 1320
Query: 480 tattgaacttttccttggaaatgcgggaacagcaatgcgtccattgacagctgcagttac 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1319 tattgaacttttccttggaaatgcgggaacagcaatgcgtccattgacagctgcagttac 1260
Query: 540 tgcagcaggtggaaattcaagctacatactagatggggtcccacgaatgcgagagagacc 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1259 tgcagcaggtggaaattcaagctacatactagatggggtcccacgaatgcgagagagacc 1200
Query: 600 aattggggatttggttgttggtcttaagcagcttggtgcagatgttgcttgttctcccac 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1199 aattggggatttggttgttggtcttaagcagcttggtgcagatgttgcttgttctcccac 1140
Query: 660 aaactgccccccagttcgtgtaaatgcaaagggaggccttcctgggggaaaggttaagtt 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1139 aaactgccccccagttcgtgtaaatgcaaagggaggccttcctgggggaaaggttaagtt 1080
Query: 720 gtctggatcaattagcagtcagtacttgactgctttgctcatggctgctcctttggctct 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1079 gtctggatcaattagcagtcagtacttgactgctttgctcatggctgctcctttggctct 1020
Query: 780 tggagatgtagaaattgagattattgataaactgatatccattccttatgttgagatgac 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 tggagatgtagaaattgagattattgataaactgatatccattccttatgttgagatgac 960
Query: 840 tttgaagttaatggaacgctatggagttaatgtagaacacagtggtagctgggatcgttt 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959 tttgaagttaatggaacgctatggagttaatgtagaacacagtggtagctgggatcgttt 900
Query: 900 cttcatccgaggaggtcaaaagtaccggtctcctggaaattcttatgtcgaaggtgatgc 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 899 cttcatccgaggaggtcaaaagtaccggtctcctggaaattcttatgtcgaaggtgatgc 840
Query: 960 ttcaagtgccagttatttcctggctggggctgcaatcactggtggaactattgccgttga 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 839 ttcaagtgccagttatttcctggctggggctgcaatcactggtggaactattgccgttga 780
Query: 1020 gggttgtgggacaagcagtttgcagggagatgtaaagtttgctgaggttcttgagaaaat 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 779 gggttgtgggacaagcagtttgcagggagatgtaaagtttgctgaggttcttgagaaaat 720
Query: 1080 gggagctaaagttacctggacagagaacagtgttactgtcactggaccaccacgcaactc 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 719 gggagctaaagttacctggacagagaacagtgttactgtcactggaccaccacgcaactc 660
Query: 1140 tcctagccaaaagcacttgcgtgctgttgatgtcaacatgaacaaaatgcctgatgttgc 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 659 tcctagccaaaagcacttgcgtgctgttgatgtcaacatgaacaaaatgcctgatgttgc 600
Query: 1200 tatgacgttggctgtggttgcactctttgcagatggccctactgccataagagacgtggc 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 599 tatgacgttggctgtggttgcactctttgcagatggccctactgccataagagacgtggc 540
Query: 1260 aagttggagggtgaaagaaacagaacggatgattgccatttgcacggaattgaggaagtt 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 539 aagttggagggtgaaagaaacagaacggatgattgccatttgcacggaattgaggaagtt 480
Query: 1320 gggagcaacagttgaagaaggacccgattactgtgtgataactccaccagagaaactaaa 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 479 gggagcaacagttgaagaaggacccgattactgtgtgataactccaccagagaaactaaa 420
Query: 1380 tgtggctgagattgacacttacgatgatcacagaatggccatggcattctctcttgctgc 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 419 tgtggctgagattgacacttacgatgatcacagaatggccatggcattctctcttgctgc 360
Query: 1440 ctgtggagatgttccagtcacaatcaaggaccctggttgcacacgaaaaactttccccga 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 359 ctgtggagatgttccagtcacaatcaaggaccctggttgcacacgaaaaactttccccga 300
Query: 1500 ctactttgaagttctggagaggttcactaagcattga 1536
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299 ctac-ttgaagttctggagaggttcactaagcattga 264