Jatropha Genome Database
- JcCB0097241.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0097241.20 - phase: 2 /partial
(1324 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00097 2625 0.0
KJC_s14329 866 0.0
KJC_s13568 805 0.0
KJC_s13183 127 7e-29
KJC_c04031 82 4e-15
>KJC_c00097
Length = 1884
Score = 2625 bits (1324), Expect = 0.0
Identities = 1324/1324 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 ttatttgtttgtctctatttcgttgggaaggaagagtcagatggctttgtggtcgatttt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1670 ttatttgtttgtctctatttcgttgggaaggaagagtcagatggctttgtggtcgatttt 1611
Query: 61 attggatattttgaataggcctactattggtgatatcgtggctgagctcgtcatgtttat 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1610 attggatattttgaataggcctactattggtgatatcgtggctgagctcgtcatgtttat 1551
Query: 121 ggctcccttgtggattgcggttattattggggttcttgtaggatgggcgtggaagcctaa 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1550 ggctcccttgtggattgcggttattattggggttcttgtaggatgggcgtggaagcctaa 1491
Query: 181 atgggccaacttgggtagagaattgctggattcttctgtcaataaagactctgcgaacac 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1490 atgggccaacttgggtagagaattgctggattcttctgtcaataaagactctgcgaacac 1431
Query: 241 agtaccatcgccagcatcttcctcgattccgaccttaaattctttgaagtttcagttgcc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1430 agtaccatcgccagcatcttcctcgattccgaccttaaattctttgaagtttcagttgcc 1371
Query: 301 cagttgcatctcttggattgccgacgatgggattcaaaaggactctcccccagccccacc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1370 cagttgcatctcttggattgccgacgatgggattcaaaaggactctcccccagccccacc 1311
Query: 361 ttccttgagtgctgattgcagttccaaacagtcgcaaaaggaaagttccggtatagtaaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1310 ttccttgagtgctgattgcagttccaaacagtcgcaaaaggaaagttccggtatagtaaa 1251
Query: 421 tgaagatgatttagagcatttgtgcaagcttgtggaagagaaagatggaggtcctgcttg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1250 tgaagatgatttagagcatttgtgcaagcttgtggaagagaaagatggaggtcctgcttg 1191
Query: 481 gattcagatgatggatcgttctaccccaactatgagctataaagcttggcggagggaccc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1190 gattcagatgatggatcgttctaccccaactatgagctataaagcttggcggagggaccc 1131
Query: 541 tgagaatggccccccgcaatatcgtagtagcactgtgtttgaggatgccactcctgaaat 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1130 tgagaatggccccccgcaatatcgtagtagcactgtgtttgaggatgccactcctgaaat 1071
Query: 601 ggtgagggacttcttttgggatgatgaatttcgaatgaaatgggatgacatgcttataca 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1070 ggtgagggacttcttttgggatgatgaatttcgaatgaaatgggatgacatgcttataca 1011
Query: 661 tgctgcaactttggaggagtgccctaccacaggaacaatgatagttcagtgggtgcggaa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1010 tgctgcaactttggaggagtgccctaccacaggaacaatgatagttcagtgggtgcggaa 951
Query: 721 gtttcccttcttctgcagtgacagagagtacatcataggccgtcgaatttgggaatcagg 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 950 gtttcccttcttctgcagtgacagagagtacatcataggccgtcgaatttgggaatcagg 891
Query: 781 tcgactgtattactgtgttacaaagggagttccttgcatgtctgttccaaggcgcaacaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 890 tcgactgtattactgtgttacaaagggagttccttgcatgtctgttccaaggcgcaacaa 831
Query: 841 accaagacgtgtggatttgtactattcaagctggtgcgttcgtgcagttgaatcaaaaag 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 830 accaagacgtgtggatttgtactattcaagctggtgcgttcgtgcagttgaatcaaaaag 771
Query: 901 gggggatggccagctgactgcatgtgaggtgctactgttccatcatgaagatatgggtat 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 770 gggggatggccagctgactgcatgtgaggtgctactgttccatcatgaagatatgggtat 711
Query: 961 tccgtgggaaattgcaaagcttggagtccggcagggtatgtggggagctgtgaaaaagat 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 710 tccgtgggaaattgcaaagcttggagtccggcagggtatgtggggagctgtgaaaaagat 651
Query: 1021 tgaaccgggtttacgtgcatatcaaaagcagagagcagctggagacccactttcacgttg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 650 tgaaccgggtttacgtgcatatcaaaagcagagagcagctggagacccactttcacgttg 591
Query: 1081 tgctttcatggctcagatcaacaccaaagtaagcgcagattacctgagatctttagagag 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 590 tgctttcatggctcagatcaacaccaaagtaagcgcagattacctgagatctttagagag 531
Query: 1141 caatgctaatagttcattggaggctgcaacgcaggattcatccaagaaatcggggggaaa 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 530 caatgctaatagttcattggaggctgcaacgcaggattcatccaagaaatcggggggaaa 471
Query: 1201 catacctaggatgctagtgcttggtggggctattgctcttgcttgtactcttgacagagg 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 470 catacctaggatgctagtgcttggtggggctattgctcttgcttgtactcttgacagagg 411
Query: 1261 gctgctgactaaagctgttatatttggagtagctagaagatttgcaaaaattggaaggag 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 410 gctgctgactaaagctgttatatttggagtagctagaagatttgcaaaaattggaaggag 351
Query: 1321 gttg 1324
||||
Sbjct: 350 gttg 347
>KJC_s14329
Length = 554
Score = 866 bits (437), Expect = 0.0
Identities = 437/437 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 43 ggctttgtggtcgattttattggatattttgaataggcctactattggtgatatcgtggc 102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggctttgtggtcgattttattggatattttgaataggcctactattggtgatatcgtggc 60
Query: 103 tgagctcgtcatgtttatggctcccttgtggattgcggttattattggggttcttgtagg 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tgagctcgtcatgtttatggctcccttgtggattgcggttattattggggttcttgtagg 120
Query: 163 atgggcgtggaagcctaaatgggccaacttgggtagagaattgctggattcttctgtcaa 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atgggcgtggaagcctaaatgggccaacttgggtagagaattgctggattcttctgtcaa 180
Query: 223 taaagactctgcgaacacagtaccatcgccagcatcttcctcgattccgaccttaaattc 282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 taaagactctgcgaacacagtaccatcgccagcatcttcctcgattccgaccttaaattc 240
Query: 283 tttgaagtttcagttgcccagttgcatctcttggattgccgacgatgggattcaaaagga 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tttgaagtttcagttgcccagttgcatctcttggattgccgacgatgggattcaaaagga 300
Query: 343 ctctcccccagccccaccttccttgagtgctgattgcagttccaaacagtcgcaaaagga 402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ctctcccccagccccaccttccttgagtgctgattgcagttccaaacagtcgcaaaagga 360
Query: 403 aagttccggtatagtaaatgaagatgatttagagcatttgtgcaagcttgtggaagagaa 462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aagttccggtatagtaaatgaagatgatttagagcatttgtgcaagcttgtggaagagaa 420
Query: 463 agatggaggtcctgctt 479
|||||||||||||||||
Sbjct: 421 agatggaggtcctgctt 437
>KJC_s13568
Length = 533
Score = 805 bits (406), Expect = 0.0
Identities = 406/406 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 493 ggatcgttctaccccaactatgagctataaagcttggcggagggaccctgagaatggccc 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 406 ggatcgttctaccccaactatgagctataaagcttggcggagggaccctgagaatggccc 347
Query: 553 cccgcaatatcgtagtagcactgtgtttgaggatgccactcctgaaatggtgagggactt 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346 cccgcaatatcgtagtagcactgtgtttgaggatgccactcctgaaatggtgagggactt 287
Query: 613 cttttgggatgatgaatttcgaatgaaatgggatgacatgcttatacatgctgcaacttt 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 286 cttttgggatgatgaatttcgaatgaaatgggatgacatgcttatacatgctgcaacttt 227
Query: 673 ggaggagtgccctaccacaggaacaatgatagttcagtgggtgcggaagtttcccttctt 732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 226 ggaggagtgccctaccacaggaacaatgatagttcagtgggtgcggaagtttcccttctt 167
Query: 733 ctgcagtgacagagagtacatcataggccgtcgaatttgggaatcaggtcgactgtatta 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 166 ctgcagtgacagagagtacatcataggccgtcgaatttgggaatcaggtcgactgtatta 107
Query: 793 ctgtgttacaaagggagttccttgcatgtctgttccaaggcgcaacaaaccaagacgtgt 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 106 ctgtgttacaaagggagttccttgcatgtctgttccaaggcgcaacaaaccaagacgtgt 47
Query: 853 ggatttgtactattcaagctggtgcgttcgtgcagttgaatcaaaa 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 46 ggatttgtactattcaagctggtgcgttcgtgcagttgaatcaaaa 1
>KJC_s13183
Length = 78
Score = 127 bits (64), Expect = 7e-29
Identities = 64/64 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 770 tgggaatcaggtcgactgtattactgtgttacaaagggagttccttgcatgtctgttcca 829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgggaatcaggtcgactgtattactgtgttacaaagggagttccttgcatgtctgttcca 60
Query: 830 aggc 833
||||
Sbjct: 61 aggc 64
>KJC_c04031
Length = 582
Score = 81.8 bits (41), Expect = 4e-15
Identities = 81/93 (87%), Gaps = 1/93 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 563 cgtagtagcactgtgtttgaggatgccactcctgaaatggtgagggacttcttttgggat 622
|||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||
Sbjct: 474 cgtagtagaactgtgtttgaggatgcaactccagaattggtaagagatttcttc-gggat 532
Query: 623 gatgaatttcgaatgaaatgggatgacatgctt 655
||||| |||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct: 533 gatgagtttcgactgaaatgggatgccatgctt 565